Basic Information

Symbol
LYVE1
RNA class
mRNA
Alias
Lymphatic Vessel Endothelial Hyaluronan Receptor 1 LYVE-1 XLKD1 Lymphatic Vessel Endothelial Hyaluronic Acid Receptor 1 Extracellular Link Domain-Containing Protein 1 Hyaluronic Acid Receptor CRSBP-1 HAR Cell Surface Retention Sequence Binding Protein-1 Cell Surface Retention Sequence-Binding Protein 1 Extracellular Link Domain Containing 1 Extracellular Link Domain-Containing 1 CRSBP1
Location (GRCh38)
11:10556966-10611689
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
Wound age identification
External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_006691.4
Sequence length
3247.0 nt
GC content
0.4256

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-869.60 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -933.93 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 868.01
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_006691.4 NCBI
AUGAAGUGGAGCAGUGAGUGUGAGCCUCAACAUAGUUCCAGAACUCUCC… 3247 nt 0.4256
Summary

This gene encodes a type I integral membrane glycoprotein. The encoded protein acts as a receptor and binds to both soluble and immobilized hyaluronan. This protein may function in lymphatic hyaluronan transport and have a role in tumor metastasis. [provided by RefSeq, Jul 2008]

Forensic Context

A study in human skin wound healing demonstrated that the LYVE1 is a marker for lymphatic endothelial cells and is expressed in the endothelial cell cluster in spatial transcriptomic sequencing [Liu et al. DOI:10.1016/j.stem.2024.11.013].