Basic Information
Symbol
LZTS2
RNA class
mRNA
Alias
Leucine Zipper Tumor Suppressor 2
LAPSER1
KIAA1813
Leucine Zipper, Putative Tumor Suppressor 2
Leucine Zipper Putative Tumor Suppressor 2
Protein LAPSER1
HLZTS2
Location (GRCh38)
10:100996539-101007852
Forensic tag(s)
Other applications
MANE select
Transcript ID
NM_001318100.2
Sequence length
2862.0 nt
GC content
0.6478
Secondary Structure
Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-1363.90 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy:
-1407.02 kcal/mol
Frequency:
0.0000
Diversity:
644.62
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts
| ID | Sequence | Length | GC content |
|---|---|---|---|
| ACCAGGUCGGGCCAGGCGGGCGCCGGGAGCUGGGAGCCGGGAGCCCAGA… | 2822 nt | 0.6400 | |
| GAACCCGCAGGCCUGCUCACCUGGGCAGAUACCUACUCUAGGGAGGGGG… | 2801 nt | 0.6373 | |
| ACCAGGUCGGGCCAGGCGGGCGCCGGGAGCUGGGAGCCGGGAGCCCAGA… | 2881 nt | 0.6428 |
Showing 11 to 13 of 13 entries
Summary
The protein encoded by this gene belongs to the leucine zipper tumor suppressor family of proteins, which function in transcription regulation and cell cycle control. This family member can repress beta-catenin-mediated transcriptional activation and is a negative regulator of the Wnt signaling pathway. It negatively regulates microtubule severing at centrosomes, and is necessary for central spindle formation and cytokinesis completion. It is implicated in cancer, where it may inhibit cell proliferation and decrease susceptibility to tumor development. Alternative splicing of this gene results in multiple transcript variants. [provided by RefSeq, Dec 2015]
Forensic Context
A study in human neonates with hypoxic-ischemic encephalopathy (HIE) demonstrated that the LZTS2 was a top differentially expressed gene associated with adverse outcome in the high-income country cohort, where it was significantly downregulated (log2 fold change, −0.96) [Montaldo et al. DOI:10.1001/jamanetworkopen.2023.54433]. This gene interacts with the Wnt/β-catenin pathway and is known to be upregulated in cancer-induced hypoxia, indicating its role in the cellular response to acute hypoxic stress.