Basic Information

Symbol
M6PR
RNA class
mRNA
Alias
Mannose-6-Phosphate Receptor, Cation Dependent CD-MPR CD-M6PR Cation-Dependent Mannose-6-Phosphate Receptor CD Man-6-P Receptor MPR 46 MPR46 Mannose-6-Phosphate Receptor (Cation Dependent) 46-KDa Mannose 6-Phosphate Receptor 46 KDa Mannose 6-Phosphate Receptor Small Mannose 6-Phosphate Receptor Mr 46,000 Man6PR MPR-46 SMPR MPRD
Location (GRCh38)
12:8940358-8951856
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
Other applications
External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_002355.4
Sequence length
2450.0 nt
GC content
0.4571

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-766.20 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -817.58 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 772.88
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_001207024.2 NCBI
AGAGUGGGGCACAGCGAGGCGCUAGGGGGAACGCUGGCCUCUGAAACUA… 2192 nt 0.4516
NM_001414320.1 NCBI
AGAGUGGGGCACAGCGAGGCGCUAGGGGGAACGCUGGCCUCUGAAACUA… 2559 nt 0.4549
NM_001414322.1 NCBI
AGAGUGGGGCACAGCGAGGCGCUAGGGGGAACGCUGGCCUCUGAAACUA… 2432 nt 0.4572
NM_001414323.1 NCBI
AGAGUGGGGCACAGCGAGGCGCUAGGGGGAACGCUGGCCUCUGAAACUA… 2541 nt 0.4549
NM_001414324.1 NCBI
AGAGUGGGGCACAGCGAGGCGCUAGGGGGAACGCUGGCCUCUGAAACUA… 2283 nt 0.4525
NM_001414325.1 NCBI
GCAUUCUCCCUUGACCAUGGUUCUAGCCAAAGAUCUGGCUGAGGAGCCC… 2378 nt 0.4495
NM_001414327.1 NCBI
AGAGUGGGGCACAGCGAGGCGCUAGGGGGAACGCUGGCCUCUGAAACUA… 2499 nt 0.4562
NM_001414328.1 NCBI
AGAGUGGGGCACAGCGAGGCGCUAGGGGGAACGCUGGCCUCUGAAACUA… 2481 nt 0.4563
NM_001414329.1 NCBI
AGAGUGGGGCACAGCGAGGCGCUAGGGGGAACGCUGGCCUCUGAAACUA… 2340 nt 0.4551
NM_001414330.1 NCBI
AGAGUGGGGCACAGCGAGGCGCUAGGGGGAACGCUGGCCUCUGAAACUA… 2322 nt 0.4552
Showing 1 to 10 of 14 entries
Summary

This gene encodes a member of the P-type lectin family. P-type lectins play a critical role in lysosome function through the specific transport of mannose-6-phosphate-containing acid hydrolases from the Golgi complex to lysosomes. The encoded protein functions as a homodimer and requires divalent cations for ligand binding. Alternatively spliced transcript variants encoding multiple isoforms have been observed for this gene. A pseudogene of this gene is located on the long arm of chromosome X. [provided by RefSeq, May 2011]

Forensic Context

A study in mice demonstrated that the M6PR mRNA was down-regulated (0.12-fold) in bone marrow cells 6 hours after a 6.5 Gy whole-body ionizing radiation exposure [Dai et al. DOI:10.1080/09553000600857389].