Basic Information

Symbol
MAB21L4
RNA class
mRNA
Alias
Mab-21 Like 4 C2orf54 Protein Mab-21-Like 4 FLJ22671 Chromosome 2 Open Reading Frame 54 Uncharacterized Protein C2orf54
Location (GRCh38)
2:240886048-240896893
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
Tissue/body fluid identification Mixture deconvolution
External database
HGNC NCBI Ensembl UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_001085437.3
Sequence length
2525.0 nt
GC content
0.6028

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-1071.70 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -1111.96 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 773.81
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_001085437.3 NCBI
ACUGUGCUGUCACUCUGGAAUUCUGCUGUGUGGGAGCUGAGGCCCCACC… 2525 nt 0.6028
NM_001282921.2 NCBI
ACUGGUGCUGCAAGUCGCUGAGCUGACAGUUGUGCCGAGGACUGUCACC… 2015 nt 0.5906
NM_024861.4 NCBI
ACUGGUGCUGCAAGUCGCUGAGCUGACAGUUGUGCCGAGGACUGUCACC… 1958 nt 0.5873
Summary

No relevant information is available at the moment.

Forensic Context

A study in humans demonstrated that the MAB21L4 mRNA, used for vaginal secretion identification, exhibited cross-reactivity with saliva and menstrual blood and contained a 3-SNP microhaplotype affected by heterozygous imbalance and occasional allele dropout in mixture analyses [Yu et al. DOI:10.1016/j.fsigen.2025.103416].