Basic Information

Symbol
MACROD2
RNA class
mRNA
Alias
Mono-ADP Ribosylhydrolase 2 O-Acetyl-ADP-Ribose Deacetylase MACROD2 C20orf133 [Protein ADP-Ribosylaspartate] Hydrolase MACROD2 [Protein ADP-Ribosylglutamate] Hydrolase MACROD2 ADP-Ribose Glycohydrolase MACROD2 MACRO Domain-Containing Protein 2 MACRO Domain Containing 2 DJ631M13.5 [Protein ADP-Ribosylglutamate] Hydrolase Chromosome 20 Open Reading Frame 133 EC 3.5.1.- EC 3.2.2.- C2orf133
Location (GRCh38)
20:13995369-16053197
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
Drug abuse diagnoses
External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_001351661.2
Sequence length
4916.0 nt
GC content
0.4172

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-1387.30 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -1484.30 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 1123.93
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_001033087.2 NCBI
AUCCAUACCAGAUAUGCCACUAUCGAGAAGCAGAUGACAGGCUCAGGCC… 4443 nt 0.4011
NM_001351661.2 NCBI
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NM_001351663.2 NCBI
GACAGGCUCUGAGGUGCUGCUGUGGCGGCGUCCGCGGGGCUGAGGCGGG… 4913 nt 0.4171
NM_001351664.2 NCBI
AUCCAUACCAGAUAUGCCACUAUCGAGAAGCAGAUGACAGGCUCAGGCC… 4524 nt 0.4005
NM_080676.6 NCBI
GACAGGCUCUGAGGUGCUGCUGUGGCGGCGUCCGCGGGGCUGAGGCGGG… 4847 nt 0.4180
Summary

The protein encoded by this gene is a deacetylase involved in removing ADP-ribose from mono-ADP-ribosylated proteins. The encoded protein has been shown to translocate from the nucleus to the cytoplasm upon DNA damage. [provided by RefSeq, May 2017]

Forensic Context

A study in mice demonstrated that the MACROD2 gene was identified as a network hub node with differing relative connectivity between lines among ventral midbrain differentially expressed genes overexpressed in the methamphetamine high drinking (MAHDR) line [Hitzemann et al. DOI:10.3390/brainsci9070155].