Basic Information

Symbol
MAF
RNA class
mRNA
Alias
MAF BZIP Transcription Factor C-MAF V-Maf Avian Musculoaponeurotic Fibrosarcoma Oncogene Homolog Transcription Factor Maf Proto-Oncogene C-Maf Avian Musculoaponeurotic Fibrosarcoma (MAF) Protooncogene V-Maf Musculoaponeurotic Fibrosarcoma Oncogene Homolog T Lymphocyte C-Maf Long Form C-Maf Proto-Oncogene CTRCT21 AYGRP CCA4
Location (GRCh38)
16:79585843-79600737
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
-
External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_005360.5
Sequence length
2669.0 nt
GC content
0.6118

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-1169.30 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -1211.26 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 703.63
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
...(((((((((((((........))))...((.((((((.((((...(.(.((((((((((((.....((((((.(.((....(((.(((((((.....(((((.....)))))....((.(((((((((((....))))))))))).)).................((((((((((..(((.((.((..((((((((((((...))))...)))))))).)))).))).)))).))))))..................))))))).)))..)).).))))))(((((((.((((((((..((((((((((.((...(((((((((.((((......((((((((...(((((..((((..((..((((((.(.((.((((((.(((..((((.(((.....)))..(((((((((..(((.......((.(((..(((((((((((((((.(((..((.....))..))))))))).)).)))))))))).))......(((((((.((.(((((((.((((....)))))))).)))..(((((((...))))).))..)).)))).))).))))))))))))))))))).)).)))).)).)..))))))..)).)))))))))...)))))))))))).))))))))).))))))))))))(((.(((((.(((.(((((((((...((((((.(((.(((((((...((((((....(((.......)))...)))))).....(((((....)))))......(((((.((((.((((..(((.....)))..)))).)).)))))))))))))).)))((((((.((...((.(((..........)))))...))...))))))..((((....)))).((((...))))....(.(((((((.((.....)).))))))).)........(((((((((((.(.((((((.........))))))).)))))..)))))).))))))....)))))........)))).))).((((((...((((((((((...((((.(((((((.(((((.(((((.(((((.....)))))((.((((((...(((........((((((....((((((.((((((((.((((..(((((..((((.((((....)))).......((.((((((((((((...(((...........)))...)))).)))))))).))...)))).)))))..)))).))))..)).)).))))))..))))))))))))))).)))))))))..))).))))))).))))((((((((((.((((.((.((((((((..(((((((.((((((((.(....((((((.((((.(..(((((.((.((..(.((.((((((((((((((.............((((((((.((((((((......))))).)))))))))..))))))))))))).))).)).)..)).)).)))))..))))).)))))).).)))))))).)))))))..)))))))).)).)))).)))..)))))))..)))))))))))))))).))))))))((((....))))..))))))))......))))))))))))))))))).).).......((.(((((.(((((......)))))))))).)).)))).)))))).)))))))))))((((((((((((((...(((((........(((((.............)))))......)))))(((((((.........((((..((......)).)))))))))))...(((((((.......(((((((((.((((((((((((((((((.......)))))))...(((..((((((...(((((........(((((((((((....(((((.(((((.(((.....)))))....(((((..((((....))))...)))))...))).)))))....((((......)))).)))))))))))))))).)))))).)))..((((.....((((((......)))))).....))))....................................))))).))))))....((((((...((((.......)))).........................(((((.((((.(((........(((((.....)))))))))))).))))).((((((...))))))))))))........))))))))).))))))).(((.((((((.((((..(((((............)))))...))))(((((((.........)))))))................((((.(((((((...((((...)))).(((((((........)))))))......))))))).)))))))))).))).......))))))).))))))).(((((..(((((...............((((.......((...)).......))))((((...(((.(((.((((...((((((...))))))..))))..))).)))....))))..(((.(((.((((.((((((.((((.(((((..(((........)))..))))).))))))))))..)))).))).)))...........)))))..)))))..
Thermodynamic Ensemble Prediction
...((((((,,(((({........,}}}}..||.{(((((.(((,{{{({(.(((((((((((({....((((((.(,((....(((.((((((({{...(((((.....}))))...,|,.(((((((((((....))))))))))).,}.............,,{,{((((((({{..(((.((.((..((((((((((({...}))}..,)))))))).)))).))),)))),)}))))..................))))))).)))..)}.),))))))|||{{{{..{{{{{{,..((((((((((.((...(((((((((.((((......((((((((...(((((..((((..((..((((((.(.((.(((({{.(((.,((({{(((.....)))..{((((((((,.{((...,.{.((.(((,.{((((((((((((((.{((,.((.....)),,)}})))))).))}}))))))))).)),.....(((((((.((.(((((((.((({....})))))))},))..(((((((...))))).))..)).)))).))).)))))))))))))}))))}.)),)))).)).)..))))))..)).)))))))))...)))))))))))).))))))))).}))))))))))}((((((....))))))((((((|...{(((((.(((.(((((((.,..((((((.(.((..{((...(((.(((.((((.....(((((....)))))..)))).))).)))......}}),.)).}.)))))).,.))))))).|}|({((({{((((,{(((((.{,.,,((.{((,.,,,,,...||}||,..}}...,})))},,||||,...))))||||{{..........{.(((((((.((.....)).))))))).}....,,..(((((((((((.(.((((((.........))))))).)))))..))))))((((.....))))}}}....}},}),}}.,||.((((((...((((((((((.{,((((.(((((((.(((((.((((({(({((.,..,))))}.(,((((((.,{(((........{{((((..,,((((((.((((({((.((((..(((((..((((,((|(.,,,))||,..,|..((,(({{{(((((({...|||....,,,.,,.))),,.))))),))))))).)),.,)))).)))))..}}}).}}}|{{|},||.}})))},,)))))))}})))))),}})))))))..))).))))))).))))((((((((((.((((.((.((((((((..(((((((.((((((((.(....((((((.((((,{..(((((.((.((..(.((.((((((((((((((.............{,(((((,{((((((((......))))).)))))))))..,,))))))))))).))).)).)..)).)).)))))..})))).)))))).,.)))))))).)))))))..)))))))).)).)))).))),,)))))))}.))))))))))))))))}))).,}.)))))))},))))}}),,))))),.....)))))}))))))))))))).}.{{{...|,|{.(((((.(((((......))))))))))||||||,|.,||,||,}.})))))|||{{{|{({{{{{|{(,{{{({{(........{{(((...||...||.,.))))),|,...})))}||{|||{.,,,.,,{{{{((.,{{,|,||.||.||||}}))}}),}},{({{({.......,{({((({{.((((((((((((((((((.......)))))))..,{{{..,(((({,,.(((((........(((((((((((....(((((.((({(.(((.....)))}},,..{((((..{(({....)))}...)))))...))).)))))....((((......)))).)))))))))))))))).))}))),,}}..{(((...,,((((((,.....}))})),},..)))),...................................))))).))))))....|||,||,,,|{||}}}}}}|}}}},.{{((({,...,{{{{{{{.{.{{{(((({(((,{((({{,,....{{||{,,,..,}}||||||}},.|||||{((((((...))))))||||||{.......,)))))))|{||,||||,{{({(((((({,(((..(((((............)))))...}}}|(((((((.........))))))),............,,,,|||,|||||||}}}{|||,...,))}||(((((........)))))},......,}}},,}|))}))}}}}}.}},..,,,,.,,}}},}.})))},,.,||||}}||})}}.}}}}}}}}..}}}}}}}.......,,...}}},}},,.},,.{{{{...,{,.({{.((((...((((((...))))))..))))..))),)))....}})),||,|,|||,{(((.((((((.((((.{((((..(((........)))..))))}.))))))))))..)))}.|||{|,,....}}}},..}}}}}..,......

Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_001031804.3 NCBI
CUUGCUGGAUCAGAGGCUUUAAAAUCUUUUUUCAUCUUCUAGCUGUAGC… 6900 nt 0.4600
NM_005360.5 NCBI
CUUGCUGGAUCAGAGGCUUUAAAAUCUUUUUUCAUCUUCUAGCUGUAGC… 2669 nt 0.6118
Summary

The protein encoded by this gene is a DNA-binding, leucine zipper-containing transcription factor that acts as a homodimer or as a heterodimer. Depending on the binding site and binding partner, the encoded protein can be a transcriptional activator or repressor. This protein plays a role in the regulation of several cellular processes, including embryonic lens fiber cell development, increased T-cell susceptibility to apoptosis, and chondrocyte terminal differentiation. Defects in this gene are a cause of juvenile-onset pulverulent cataract as well as congenital cerulean cataract 4 (CCA4). Two transcript variants encoding different isoforms have been found for this gene. [provided by RefSeq, Jan 2010]

Forensic Context

No relevant information is available at the moment.