Basic Information

Symbol
MAFF
RNA class
mRNA
Alias
MAF BZIP Transcription Factor F Transcription Factor MafF HMafF V-Maf Avian Musculoaponeurotic Fibrosarcoma Oncogene Homolog F V-Maf Avian Musculoaponeurotic Fibrosarcoma Oncogene Family Protein F V-Maf Musculoaponeurotic Fibrosarcoma Oncogene Homolog F U-MAF U-Maf
Location (GRCh38)
22:38200767-38216511
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
Sudden cardiac death diagnosis
External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_012323.4
Sequence length
2374.0 nt
GC content
0.5931

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-989.60 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -1031.01 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 486.95
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_001161572.2 NCBI
AAUUCCGGGAAGCUCGCCUUACAACUCCGCGCGGCCUCGGCCCCCUGCG… 2400 nt 0.5942
NM_001161573.1 NCBI
AGCUGAGCUAGGAGUGAGGGAUGUGAGCCACCCCCGCUUGGCACCCCGG… 2234 nt 0.5761
NM_001161574.2 NCBI
AAUUCCGGGAAGCUCGCCUUACAACUCCGCGCGGCCUCGGCCCCCUGCG… 2307 nt 0.5947
NM_012323.4 NCBI
AAUUCCGGGAAGCUCGCCUUACAACUCCGCGCGGCCUCGGCCCCCUGCG… 2374 nt 0.5931
Summary

The protein encoded by this gene is a basic leucine zipper (bZIP) transcription factor that lacks a transactivation domain. It is known to bind the US-2 DNA element in the promoter of the oxytocin receptor (OTR) gene and most likely heterodimerizes with other leucine zipper-containing proteins to enhance expression of the OTR gene during term pregnancy. The encoded protein can also form homodimers, and since it lacks a transactivation domain, the homodimer may act as a repressor of transcription. This gene may also be involved in the cellular stress response. Multiple transcript variants encoding two different isoforms have been found for this gene. [provided by RefSeq, Jun 2009]

Forensic Context

A study in rhesus macaques demonstrated that the MAFF was the top-most significant differentially expressed gene, being overexpressed in animals with hypertrophic cardiomyopathy and sudden cardiac death with a log2FoldChange of 4.71 [Rivas et al. DOI:10.1038/s41598-024-82770-4].