Basic Information

Symbol
MAG
RNA class
mRNA
Alias
Myelin Associated Glycoprotein SIGLEC-4A SIGLEC4A SIGLEC4 S-MAG GMA Sialic Acid Binding Ig-Like Lectin 4A Myelin-Associated Glycoprotein Sialic Acid-Binding Immunoglobulin-Like Lectin 4A Siglec-4a SPG75
Location (GRCh38)
19:35291647-35316351
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
Mechanical injury analysis
External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_002361.4
Sequence length
2357.0 nt
GC content
0.6356

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-1054.40 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -1093.42 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 503.30
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_001199216.2 NCBI
GAGCUGGGCUGGCGGAGCAGAGGUGCAGAAGCAACUGAGUCCAAGUUGU… 2344 nt 0.6399
NM_002361.4 NCBI
GAGCUGGGCUGGCGGAGCAGAGGUGCAGAAGCAACUGAGUCCAAGUUGU… 2357 nt 0.6356
NM_080600.3 NCBI
GAGCUGGGCUGGCGGAGCAGAGGUGCAGAAGCAACUGAGUCCAAGUUGU… 2402 nt 0.6336
Summary

The protein encoded by this gene is a type I membrane protein and member of the immunoglobulin superfamily. It is thought to be involved in the process of myelination. It is a lectin that binds to sialylated glycoconjugates and mediates certain myelin-neuron cell-cell interactions. Three alternatively spliced transcripts encoding different isoforms have been described for this gene. [provided by RefSeq, Nov 2010]

Forensic Context

A study in rats using an organotypic hippocampal slice model of traumatic brain injury demonstrated that the MAG is implicated in axon regeneration blockade, as it was upregulated following a severe (50% Lagrangian) stretch injury [Di Pietro et al. DOI:10.1089/neu.2009.1095].