Basic Information

Symbol
MAGI2
RNA class
mRNA
Alias
Membrane Associated Guanylate Kinase, WW And PDZ Domain Containing 2 MAGI-2 AIP1 KIAA0705 ACVRIP1 ARIP1 Membrane-Associated Guanylate Kinase, WW And PDZ Domain-Containing Protein 2 Membrane-Associated Guanylate Kinase Inverted 2 Atrophin-1-Interacting Protein 1 Atrophin-1-Interacting Protein A AIP-1 Activin Receptor-Interacting Protein 1 Activin Receptor Interacting Protein 1 ACVRINP1 NPHS15 SSCAM
Location (GRCh38)
7:78017055-79453667
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
-
External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_012301.4
Sequence length
6975.0 nt
GC content
0.5008

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-2266.20 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -2396.04 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 1680.91
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_001301128.2 NCBI
ACACCCGCUCACCAGCUCGGCUACUGCUCGCUCCGGCUGCCGCCGCCGC… 6933 nt 0.5008
NM_012301.4 NCBI
ACACCCGCUCACCAGCUCGGCUACUGCUCGCUCCGGCUGCCGCCGCCGC… 6975 nt 0.5008
Summary

The protein encoded by this gene interacts with atrophin-1. Atrophin-1 contains a polyglutamine repeat, expansion of which is responsible for dentatorubral and pallidoluysian atrophy. This encoded protein is characterized by two WW domains, a guanylate kinase-like domain, and multiple PDZ domains. It has structural similarity to the membrane-associated guanylate kinase homologue (MAGUK) family. [provided by RefSeq, Jul 2008]

Forensic Context

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