Basic Information

Symbol
MAL2
RNA class
mRNA
Alias
Mal, T Cell Differentiation Protein 2 Myelin And Lymphocyte Protein 2 MAL Proteolipid Protein 2 Protein MAL2 Mal, T-Cell Differentiation Protein 2 (Gene/Pseudogene) Mal, T Cell Differentiation Protein 2 (Gene/Pseudogene) MAL2 Proteolipid Protein
Location (GRCh38)
Forensic tag(s)
Other applications

MANE select

Transcript ID
NM_052886.3
Sequence length
2826.0 nt
GC content
0.3960

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-761.30 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -816.08 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 718.72
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
GCGCCCGGAGCCCGCGGAGCUGAGCGGCGGCGGCGGCGGCGGCAGGAGC… 2826 nt 0.3960
Summary

This gene encodes a multispan transmembrane protein belonging to the MAL proteolipid family. The protein is a component of lipid rafts and, in polarized cells, it primarily localizes to endosomal structures beneath the apical membrane. It is required for transcytosis, an intracellular transport pathway used to deliver membrane-bound proteins and exogenous cargos from the basolateral to the apical surface. [provided by RefSeq, Jul 2008]

Forensic Context

A study in humans demonstrated that the MAL2 gene was downregulated during long-term weight loss (0 to 12 months) in weight losers and showed a significant DNA methylation-expression correlation that was replicated in a validation cohort of BMI-discordant monozygotic twin pairs [Bollepalli et al. DOI:10.1038/ijo.2017.245].