Basic Information

Symbol
MAN1A1
RNA class
mRNA
Alias
Mannosidase Alpha Class 1A Member 1 Mannosyl-Oligosaccharide 1,2-Alpha-Mannosidase IA Processing Alpha-1,2-Mannosidase IA Alpha-1,2-Mannosidase IA Man(9)-Alpha-Mannosidase Man9-Mannosidase EC 3.2.1.113 Mannosidase, Alpha, Class 1A, Member 1 EC 3.2.1 HUMM3 HUMM9 MAN9
Location (GRCh38)
6:119177204-119349767
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
-
External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_005907.4
Sequence length
5018.0 nt
GC content
0.4271

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-1504.80 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -1606.57 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 1288.25
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_005907.4 NCBI
AGUGCUCGCGGGGCCGCGGCGGAGUGUACCGUGCUGCUCUACUCGCUGC… 5018 nt 0.4271
Summary

This gene encodes a class I mammalian Golgi 1,2-mannosidase which is a type II transmembrane protein. This protein catalyzes the hydrolysis of three terminal mannose residues from peptide-bound Man(9)-GlcNAc(2) oligosaccharides and belongs to family 47 of glycosyl hydrolases. [provided by RefSeq, Jul 2012]

Forensic Context

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