Basic Information

Symbol
MAN1A2
RNA class
mRNA
Alias
Mannosidase Alpha Class 1A Member 2 MAN1B Mannosyl-Oligosaccharide 1,2-Alpha-Mannosidase IB Processing Alpha-1,2-Mannosidase IB Alpha-1,2-Mannosidase IB EC 3.2.1.113 Mannosidase, Alpha, Class 1A, Member 2 Alpha1,2-Mannosidase
Location (GRCh38)
1:117367449-117528872
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
Postmortem interval inference
External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_006699.5
Sequence length
8576.0 nt
GC content
0.3734

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-2206.00 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -2378.74 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 2408.89
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_006699.5 NCBI
AGACCCGUGCGGUAGCAACAGCGGCGGCGGCCGCGGCGGCUGGCCGGAC… 8576 nt 0.3734
Summary

Alpha-mannosidases function at different stages of N-glycan maturation in mammalian cells. See MAN2A1 (MIM 154582) for general information.[supplied by OMIM, Mar 2008]

Forensic Context

A longitudinal mRNA expression analysis in post-mortem human blood samples demonstrated that the MAN1A2 gene, involved in protein demannosylation, shows an up-regulated expression pattern after death and was identified as a biomarker for post-mortem interval (PMI) estimation [Antiga et al. DOI:10.1038/s41598-021-96095-z].