Basic Information

Symbol
MAN1B1
RNA class
mRNA
Alias
Mannosidase Alpha Class 1B Member 1 ERMan1 MANA-ER ERManI MRT15 Endoplasmic Reticulum Mannosyl-Oligosaccharide 1,2-Alpha-Mannosidase 1 Endoplasmic Reticulum Mannosyl-Oligosaccharide 1,2-Alpha-Mannosidase Man9GlcNAc2-Specific Processing Alpha-Mannosidase Endoplasmic Reticulum Class I Alpha-Mannosidase ER Alpha 1,2-Mannosidase Man9GlcNAc2-Specific-Processing Alpha-Mannosidase Endoplasmic Reticulum Alpha-Mannosidase 1 Mannosidase, Alpha, Class 1B, Member 1 ER Alpha-1,2-Mannosidase Alpha 1,2-Mannosidase ER Mannosidase 1 EC 3.2.1.113
Location (GRCh38)
9:137086857-137109189
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
Drug abuse diagnoses
External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_016219.5
Sequence length
2707.0 nt
GC content
0.5955

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-1155.20 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -1195.50 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 766.77
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_016219.5 NCBI
GUUGACGGCGCUGCGAUGGCUGCCUGCGAGGGCAGGAGAAGCGGAGCUC… 2707 nt 0.5955
Summary

This gene encodes an enzyme belonging to the glycosyl hydrolase 47 family. This enzyme functions in N-glycan biosynthesis, and is a class I alpha-1,2-mannosidase that specifically converts Man9GlcNAc to Man8GlcNAc isomer B. It is required for N-glycan trimming to Man5-6GlcNAc2 in the endoplasmic-reticulum-associated degradation pathway. Mutations in this gene cause autosomal-recessive intellectual disability. Alternative splicing results in multiple transcript variants. A related pseudogene has been identified on chromosome 11. [provided by RefSeq, Dec 2011]

Forensic Context

A study in mice demonstrated that chronic methamphetamine administration significantly dysregulated the MAN1B1 in microglia, indicating its involvement in the protein processing of endoplasmic reticulum pathway as part of the broader glial-mediated molecular mechanisms of methamphetamine-induced neurotoxicity [Oladapo et al. DOI:10.3390/Ijms26020649].