Basic Information

Symbol
MAN1C1
RNA class
mRNA
Alias
Mannosidase Alpha Class 1C Member 1 HMIC Mannosyl-Oligosaccharide 1,2-Alpha-Mannosidase IC Processing Alpha-1,2-Mannosidase IC EC 3.2.1.113 MAN1A3 MAN1C Mannosidase, Alpha, Class 1C, Member 1 1,2-Alpha-Mannosidase IC Alpha-1,2-Mannosidase IC Pp6318
Location (GRCh38)
1:25616791-25786205
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
-
External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_020379.4
Sequence length
3561.0 nt
GC content
0.6220

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-1600.80 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -1659.44 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 755.58
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
.(((...((((.((.((((((((((((((((.(((((.(((.((.((((((((((((.(((.((((.((.(((.((((((.(((((((((((((((........)))))))))).(((((((..(((...((((((((((((((((....)))))))(((((.((((..(((((((((((((.....((..((((...)))))))))).)))))))))..)))).)))))((((((....))))))(((((((((((.((((((......)))))).)))).((((((((..(((((......((((((((((((...))))).....(((((((((((.(...(((.(((((((((((((((...((((.((((...(((...(((((((..((((((((.......)))))))).((((....(((.(((.((((((.(((....))).))))))))).)))))))(((...(((((((((......)))).)))))....))).((((......)))).....((((...)))).........)))))))....)))..)))).)))).))))))))))).)))))))....).)))))))))))(((((.((((((((((.(.((((((((((((....))))........)))))))).))))).)).))))..))))))))))))(((((((.(((((((((....(((((((((((((.(.(((((((((((..(((.((.((((((((((.(..(((......)))..)...)))))))))))).))))))))).))))).).))))))).(((((....))))).((((...((((((.((((((((......))))))))...........)))))))))).....((((((.((((......))))))))))..))))))..)))))))))...)))))))..)))))....)))))))).....(((((((.(((((((((..(((((((((.(((.......(((((.......((((...(((.((((((((....)))))))).))).))))..((((.....)))).)))))......))))))))))))....)).))))))))))))))....))).))))..)))).)))))....)))...)))))))(((((((((((((.((....)))))))))....)).)))).....)))))))).)))))).)).)))).)))..))))........)))))))).)).)))))))).)))))((((.((((...(((((...)))))...)))).))))...(((((((((.(((..((((....))))...((.(.(((((......((((..((.((((.(((((....)).))).)))).)).))))))))).).))))).)))))))))((.(((....))).))..(((((((((.(((.((((((.(((((((.(...).)))))))..((((((((((((....((((((((((((...(((...))).......((((.((((......)))).))))(((..(((...)))....)))...(((((....(((((((((((.........((((((.((.((((((...((((....(..(((((...)))))..)...)).))...)))))).....((((.(((......(((((..((((((((((...((((....))))(((((((((....)))))))))...((((((((((....((.((((....))))))....)))))).)).)).)))))))))))))))(((((.(((...)))))))).((....)).......((((....)))))))))))..(((.(((((((((((((.((((((...(((...)))...))).))).))))).......((((...(.......)..)))).)))))))).))))))))))))))))))))))..)))))))))))))..)))).....))).))).))))))((((((...(((((((.((((........(((....((....))))))))))))))))....(((((((((((((((.((((....(((((..((((.....))))(((((((.(((......)))))))))).)))))...)))).............(((((((.((....(((((......)))))...))))))))).((((((.................))))))))))))...((((((...(.....)...))))))..)))))))))........)))))).)))))).))).)).)))))))((...((((((((.....((.(((((....((((((.(((.((..(((((((((....).))))))))..)).....((........)).(((((((...((.(((.....((((..(((((..((((.........)))).)))))....))))((((...(((((((((.(........).)))).)))))..))))......))).))..))))).)).)))))))))((((.(((((((((....))))...))))).))))))))).)).....))))))))...))((((((.((((((((..((((..((((((((.....((((((((....((..((((.....))))..)).....))...))))))((((((..............((((......)))).(((((((.(((((.......(((..((.((((((........))))))))..)))))))))))))))...))))))......))))))))))))..))))))))...)))))).....((....)).(((..((((((((...))).))))).)))))))))))))))).))))....((((((...)))))).((((((((((((((((....)))))).(((((.(((........))).)))))(((......))).....((((((.(((.(((......))).)))..(((((.(((((.(((((((((((....((((.(((((((..((((((((....)).))))))...(((....((((....)))).....)))...........((((......))))(((((.((((((((((...(((.(((..............))).)))...)))))))))).)))))..........))))))).))))....)))))).))))).))))).)))))...)))))).................(((((.........))))).))))))))))..........((((....)))).)))..................(((.(((((.....(((((((((((((....((((((.(.(((((..(((((..........))))).))))).))))))).....)))))).................(((((.(((((((((((((....)))))))))......)))))))))....))))))).....))))))))..
Thermodynamic Ensemble Prediction
.(((...((((.((.((((((((((((((((.(((({,(((.((.((((((((((((.(((.((((.((.(((.((((((.(((((((((((((((........)))))))))).(((((((..((({..((((((((((((((((....)))))))(((((.((((..(((((((((((((.....{{..((((...))))}})))).)))))))))..)))).)))))((((((....))))))(((((((((((.((((((......)))))).)))).((((((((..(((((......((((((((((((...))))).....(((((((((((.(...(((.(((((((((((((((...((((.((((,..(((...(((((((,,(((({{{|,,,,,..||}||||}{((((..,,(((.(((.((((((.(((....))).))))))))).))),,)}))),..(((((((((......)))).)))))....,}}.{(((......)))}.....{{{{...}))).,.......)))))))....)))..)))).)))).))))))))))).)))))))....).)))))))))))(((((.((((((((((.(.((((((((((((....))))........)))))))).})))).)).))))..))))))))))))(((((((.(((((((((....(((((((((((((.(.(((((((((((..(((..({((((((((((.,..(((......)))..)...)))))))))))))))))))))).))))).).)))))))}(((((.,..}}}}).{{{{...((((({.((((((((......)))))))).{......,..))})))}}}}...|,((((((.((((......)))))))))).}))))))..)))))))))...)))))))..)))))....)))))))).....(((((({{(((((((((..(((((((((.(((.,.....(((((...,{,.{(((...(((.((((((((....)))))))).))).))))},((((.....)))).))))).....}))))))))))))....)).))))))))))))))....))).))))..))))})})))..,.)))...)))))))((((((((((((({((....)))))))))....)).)))).....)))))))).)))))).)).)))).)))..)))),.......}))))))).)).)))))))).)))))((((.((((...(((((...)))))...)))).)))),,.(((((((((.((({.((((....)))).,.((.(.(((((......((((..((.((((,(((((....)).,))))))).)).))))))))).).))))).)))))))))((.(((....))).}}..,(((((((,,(((((((((({(((((((.{...).)))))))..((((((((((((....((({((((((((...(((...})).....{{((....,,|}}|,,,.}}||||||{{,..|||...))),...)))...(((((....((((((((({({,........{(((((((.((((((,..,{{{,,{{(,.(((((...}))))..,.|,|,,,).,,)))))).,,,|{{|{.((,,.,||,((((,..((((((((((..,((((....))))(((((((((....)))))))))...,(((((((((....((.((((....))))))....)))))).)),)}.))))))))))))))){((((.(({...))))))))}||},},}}.......||||,}}.}}}}|||||,,..(((.(((((((((((({.((((((...(((...)))...))).))).})))),,{...,{{,,..,|||,|||,..})),).)))))))).))),,),)))))))))))))))..)))))))))))))..}))).....))).))),,))))),((({,..,(((((((.((({..,{{,..(({...,||....}}|}}))))))}))))....,|||{((((((((((.((((....(((((..((((.....))))(((((((.(((......)))))))))).)))))...))))...........,.{((((((.((....(((({.....,}))))...)))))))))}}|||||}},..............,||||},,}))),..{({{{{,,.,..,..}...)))))},||||||||}},.|||...|||||..,,))))}}})})|,|||||||{{,,.,{,(((({...((((.(((({,((((((((((....((..(((((((((....).))))))))..}}.....,,}}}}....}}},}}}.,.}})),}}}}....|||,{..{(({{..|{|||....,,.,||||,|}}}}....}}})|{{{,,.(({{{{(((,|.....,,,)}}))}})))))..)))}.,,,,,}}}}||,.},))}....,,}}}}}}}}|||,}})))))))}}.((((({......))))))......(((((..|((|.......))).)))))((((((((,.((((..((((((((....,{(({((({,...{{..((((.....))))..)),..},}}}}},,,}}|((((((..............{(((......)))},{((((((.(((((......{(((..((.((((((........))))))))..)))))))))))))))...))))))}...,.))))))))))))..)))))))),...,,,}},,,,.)))))}),,|{|,.((((((((...))).))))).}}}))))))))))))).))))....((((((...)))))).((((((((((((((((....)))))),(((((.(((..,.....})),)))))(((....,,)}},{,..((((((.(((.(((......))).)))..(((((.(((((.(((((((((((....((((.(((((((..((((((((....)).))))))....,,...,{{,...,}})}}......,||,|........,,|{......}|||(((((.((((((((((...(((.(((..............))).)))...)))))))))).))))),,........))))))).))))....)))))).))))).))))).)))))...))))))...}},...........(((((.........))))}.))))))))))..........((((....}}}),)}}.......,,,........(((.(((((.....(((((((,,..(((((((((((,.,.,,{{,...,|{|.......{{{{{.....))))}{(((,...)))},,)))..}))))))}....,,{.(((((.(((((((((((((....)))))))))}.....}})}))))),,,.))))))).....))))))))..

Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_001289010.2 NCBI
AGUGAAAGCCCGAGCGGCGGCGGCGGCGGGGACGGCGGUGGAGGCGGCC… 3380 nt 0.6225
NM_001385182.1 NCBI
AGUGAAAGCCCGAGCGGCGGCGGCGGCGGGGACGGCGGUGGAGGCGGCC… 3663 nt 0.6205
NM_001385183.1 NCBI
AGUGAAAGCCCGAGCGGCGGCGGCGGCGGGGACGGCGGUGGAGGCGGCC… 3633 nt 0.6221
NM_001385185.1 NCBI
AGAAACAAGGCUGAGCCUACAGCAAGAGCCUCCUUUUCUUCUCACCGCA… 2014 nt 0.5204
NM_020379.4 NCBI
AGUGAAAGCCCGAGCGGCGGCGGCGGCGGGGACGGCGGUGGAGGCGGCC… 3561 nt 0.6220
Summary

Predicted to enable mannosyl-oligosaccharide 1,2-alpha-mannosidase activity. Predicted to be involved in ERAD pathway. Located in extracellular exosome. [provided by Alliance of Genome Resources, Jul 2025]

Forensic Context

No relevant information is available at the moment.