Basic Information

Symbol
MAN2A1
RNA class
mRNA
Alias
Mannosidase Alpha Class 2A Member 1 Alpha-Mannosidase 2 GOLIM7 MANII MANA2 Mannosyl-Oligosaccharide 1,3-1,6-Alpha-Mannosidase Golgi Integral Membrane Protein 7 Golgi Alpha-Mannosidase II EC 3.2.1.114 AMan II Mannosidase, Alpha, Class 2A, Member 1 Mannosidase, Alpha Type II EC 3.2.1 Man II
Location (GRCh38)
Forensic tag(s)
-

MANE select

Transcript ID
NM_002372.4
Sequence length
6553.0 nt
GC content
0.4004

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-1823.20 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -1955.09 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 1793.47
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
....(((((((((((((((((((((((((.((((((((((...)))).))))).....((((.(((((((.((((.(((.(....).))))))).....(((((...)))))((((((.(((....))).)))))).((((((..((((((((((((..........)).))).)))))))..))))))((.(((((((((.(((((((....)))))))..((((...))))..(((..(((..(((((...))))).)))..)))))).)))))))))))))))))))..((((........))))...(((((......)))))).)).)))))).)))))..))))))))....((....)).((((((((((((((((((((((.(((..(((.(.((((((....((((((((((((......(((.(((.((((..(((((((.....))))))))))).)))....(((.....))).)))....)))))..))))))).)))).)).).)))))).)))))))).)))))).(((((.....)))))..(((((..(((((((((((((..............((((((((((.((((((((((((....(((...)))..)))))))..((((((((..........((((((((((..(((((.(((((((((....(((((...)))))........(((((((.(((......))).)))))))((((((((((....((((.(((.....)))..))))(((((......)))))..))))))))))...............))))))))).))..((((((.....))))))(((((...))))).(.((((.......)))))(((.(((((((.......))))))).)))...)))..))))))))))(((((..((..(((((((((((((((((..........)))))...(((........)))..))))))))))))....))..))))).....(((((......))))).....((((((((((((.(((.(((......))).............(((((..(((((....(((((...(((((..(...)..))))).....(((((.(((.(((((((.........))))))).))).))))).)))))....)))))..)))))............))).))))))..)))))))))))))).)))))))))))...)))).......((((((..((((((((.((...((((((...((......))...))))))....))))))))))...))))))..)))))))))))))((((((((((......((((.......))))))))))))))..((((((((.((((((.((((((.((((......(((((...(((..(((((((((((((......)))).)))))))))))).)))))((((((((((((.((((..(((((((.((.(((((...)))))...(((((...)))))......(((((((...(((......)))...))))))))).)))))))((((.((((.((((...(((.......)))...)))).)))).)))).(((((..((((((.....))))))..)))))......((((....))))...((((((((((.((((........))))))))(((((((....)))))))...........((((((((.....))))))))(((.(((((.(.(((((....)))))).))))).))).(((..(((((((.((((((((((((.((((.(((((.((((..(((((.((((((((((..((......))..))))))((((((....))))))..(((......)))..............((((((.(((.((.....))..)))))))))((((((((....)))))))).....((((.....))))....(((((((((.....)))).)))))..........))))...)))))))))))))).))))......))))))))))))))))))).))).....))))))...................(((..........)))..............((((.((((((.((((..((....))..)))).((..((.(((......))).))..))...(((((((((..((((((((.(((((((((((((((((((...((((((((..............))))))))....((((...(((((((.((((((.......))))))............(((.(((...(((((.((.....))..))))).))).))).......((((....))))(((.(((.................))).))))))))))))))))))))..)))))))))))))))........(((((((......))))))))))))).))).))))))....))))))..))))..)))))))))))))))).)))))).....)))))))))).))))))))...((((((((...(((((((...((..(((.(((.....(((((.(((((..(((.(((((.((((..((...((((((((((.....(((((((((((..........)))).)))))))..))))))))))........(((((((((((.(((....((((((((((....((((........(((((((((((((......(((((......)))))..((((((((....)))))))).((((((.(((((.(((((((.(((((((.((((...(((((((((............)))))))))..((.(((((.................))))).)))))))))))))...((((((.........(((((.((((.....))))......((((((((((((((...((((..((((((((((((((((((.((.((....)).)).))))))((((((((((..((((.((........)).))))..))))..))))))......((((......))))..)))))....(((((......((((((........)))))).....))))).........................((((....))))..((((((((((((..((((((..((((((....((....((((((....(((........))).....(((.......))).((((.....))))))))))....))....))))))))))))..)))))..)))))))..(((((((....(((((((((((.((((((...(.((((.((..(((....)))...))..)))))...).))))).)))))).((((((....))))))..)))))..)))))))((...(((((((..(((...((.((((((((.....................))))).))).))...)))..)))))))...))))))))).)))))))))))...)))))))..(((((...............)))))..))))).........)))))).)))))))))))).))))))...((((((((((((((((((...............(((((...(((((((((...((((((((((((((..(((((........))......((((.((....)).)))))))..))))))))))))))((((((..(((((((..(((...(((...((.((((((..((((.....)))).)))))).))..)))...)))....)))))))...............(((((((((...((((.(((........(((.(((((((...((((.....(((((((..((((.(((....))))))).....)))))))))))...))))))))))......))).)))).))))).))))........(((((((.(((((....((((((((.(((((......(((((.((((((..(((((.((((((.((((((.((((((.......)))))).......)))))).)))))).)))))..))))..)).)))))............((((..(((((((((.....((((((((..((((((((((((((.....(((.((.(((((.((((((((((..((((((.........(((((.....)))))......))))))...)))))))).........))))))).)).)))...)))))..)))))))))..((((........)))))))))..)))........)))))))))..)))).....(((((...)))))........))))).))))))))))))).)))))))......))))))..)))))...))))))))))))).))))))).)))))))...))))))))))))).((.((((((....((((((((((.(((((((..((((((((..((((((....)))))).(((((...))))).......(((((((((((((((((((((((.....)))....((((((((((..........)))))).))))((((((((((((.........((((((.((((.....)))))))))).........((((((...(((..((((((....))))))..))).))))))))))))))))))..................))))))))))).))))))))).........((((.(((((.......)))))))))))))))))))).......))))...))))))))))))))))..))....(((((.....))))).......(((..........))).(((........))).))))....))))))))))((((......))))(((((((.((((.(......).)))))))))))..(((((.(((((((((((((((((........(((((((((((((((.(((.(((((((((((((((((((((((((((...))))))))))(((((((((.........)))))))))...........(((((((((..((((((((((.....((((.(((...((((((....((((.(((((.((((......(((...(((((....)))))....)))....))))..)).))).)))).....))))))...))).))))..(((......)))...(((.(((.............((((........))))...........))).)))(((.(((...((((((.......))))))...))))))............)))))))))).)))))))))((((..(((((((((((.(((((..(((((((((((....(((((((((((.((......((((((((((((((((.........)))))))).....(((((.(..(((..(((.....)))..)))..).)))))....((((..(((((((((((((.......))))).............)))))))).))))..(((((....))))))))))))))).)))))))))))...((((.......)))).......((((((.((((.((.....))))))))))))......(.(((((((....))))))).).((((((....)))))).))))))...)))))......))))))))))))))))..))))...(((((((...(((......((((.((((((...(((((((((.(((((((((((....))))))))))).............(((((((..............))).))))((((((((((((((...))))))....)))).)))))))))).)))))))))......((((...(((((((.((((((((((((...)))))..)))))))((((((((((((..((......))..))))))))))))..(((....)))...)))))))...)))))))))))...))))))).))))))))))))))))).........((((((...)))))).))).)))).................(((.......))).....)))))))))))(((((((((((.(......((((((........))))))..).)))))))))))...))))))))))))))))).)))))...........((((((((.((((......).))).))))))))..)))))))))))))).............................(((((((((...)))))).)))..)).))))))).....)).)))..))))))))))...))).)))...))...))))))).....))))))))((((...(((.((...)).)))...)))).....)))))...........))))))))((((.....))))....))))(((((....(((((((.(((......)))..)))))))))))).
Thermodynamic Ensemble Prediction
....((((((((((({(((((((((((((,((({(((((({{,||||.|||||{....((((.(((((((.((((((,((((.({..,,}).)))).}}(((({...,)))){{(((({(((.,..{||{||||||.((((((..({({(((,((,,..,,,,,}.,}})))))))))),)}}))))}},|,|||||||{{,(((((((....))))))),.((({{{,||}|{,,,,..{{{..(((({...))))).}))}.)))))})))})))),))))))))))),,|{{{..{{{...})))..,}||,|}.}},.))))}).)).)))))).)))))..})))))))....{{..,,)).{((((((((((({...|))))).(((((((,{{{((((((({,,{(((((.({(((((.{((((..{((.((((,.{((((((.....))))))))))).))|((((((.(((({|{|{({,....||||,...{({((({{.,|.,|,{,,,|,}}.}}))),.,..))).))}}},,,}}}}}}|||,..,,}}},},})))))))))),.....)))).}.,.))))).,.))))))}},))))))))))}))}.))))(((((..{((((((.((({.............}))).))))}}})..)))))..,....,(,(({{{||||,....,{{.(((((((.(((......))).))))))).)}||}}}}}}))}(((({..{{{.{{({(....,...((((((((.,,(((({{.((((((({((.((((((..((((((({,.{{(((((((((.((((..{{{..(((((.{...,}}))))).}}}...))).).))))).)))}||,{|.....,({{.,,...,....)))..{(((((((((({.{{.((({.(((..(((((((((..(((((((({..{(((((({((({....{{,,,,.}}}|{{{({,,.{((((((....,,(((((((.((((((.,,.((((((....)))))){{{...(((((((.{,((((((((((((((((......((.(((((..(((.(((((({((({((,({((,,{,.....))).,)}))}),..)))}..))))))..((((.(((((.((((((.{{(((.......}))}}(((((((....)))))))....((((((((..((,{,((((...((((((({{((,..,}}),,,..))))))).))))..,}},,))......)))))).......(((((.((((((((((.,{(({{{,.....,(((,,....}}}((((((((((((((((((......((((.......)))))))))))},,.........}}}.)))))))).,{{{{..,.||..((((((((,(((((((((((((((((......)))).))))))))).....)))).,))))))))),,,||,.,|}}}|{{|{,|,,,,,)).}}}}),))))..))))).))))).))))).....)))))).)))))}))).)))..))))))).....)))))))))))..)))))}.))))))).)))(((((((((((({{{.{{(((((..((((((.....))))))..))))}.,|,,.{(((...,|||,...,{{{{{{(((.((((........)))))))}{((((((....))))))).,..,......((((((((.....)))))))),||.|{{{{.,.(((((....)))))..,})}}.}},.(((..(((((((.((((((((((((,((({.(((({,((((..(((((.((((,{{(((..((....,,||,,}}}}}|((((((....))))))}.(((......))).,.,,....}},..{(((({,(((.{{.....})..))))))))|((((((({....}))))))),.,,,({((.,,.,}}}}....||{||{|||,....,}}}.))))),,...,,...})))...)))))))))))))).}))}..,...))))))))))))))))))).))).....))))||(({{,..|||,........,{{.......,|||,|{{,,...,,.{{{,....(((..........))),}}}))},}})))),,}))))}}....,....)))).)).)))))),,.....,,.)))))).)))))))}.,..)))))))}}||||||||}}}}}}}..{(....(((((((.....((((((((((((.,.(((((({(((((,.{{{{{,,(((((((((.((((.....(((((.((.....))..))))),{(((((.......))))).}}.{,..{{{,((({{,,.............|||,,.}.,,,,}}||,,,},,.})))})}|{{{........}}},...(((((((......))))))).)))))))))))))|(((.(((.((((...{{..,,{{.((.((((....)))).)).))..,,.....)))).))).)))}........{{((..((((((...,,((.{{((,(,.{{{.,,,,))),.}.,,,,,,}}...})}..)))))).,||||,,{,,.....((((((({(({..........}})}.))))))).,))))),,,,.,,,,))},},)))))).,)))))))))))).((((.....))))....,,,,.(((((((((((({....,{(({{{{,.{{{{{{{{{.((((((((....))))))))....|}}}}}}}}.||,{,{{.{((((((.((({...{((((((((......,,,.,,})))))))}..((.{((((.................))))}.))}))))))))}|{{{....)))},.,..,.||....{{{|...,.},}},,}}..||||||{(((((((,.,((({.,{({{{,{((((((((({{.{{,||....}}.)),))))))|(((((((((..((((.((.......,)).))))..))))..))))))|.....|||{....,,)))}..))))},...,.....,}|||||{{||||,.....,}}}|},,|,{.{{{{{{{,,{{,.....,.|||||,.{{{((({....}}}}..((((((((((((..(((((,.{((((((....((....((((((...,((,....{,,,},}.....|||,,,......,}||||.....))),))))))....))....))))))))))))..)))))..)))))))..{{{{|||,}}.{{{||((((((.((((({...{.((((.((..(((....)))...))..))))}...}.))))).)))))).((((((....}))))).,|||}}..}}}}}}}||...,{{{{((||{(|...,,.((({(((({.,{{{,{{..,,..{||,..}},}}.,}}.))}}.}},..))))))).)}},,}}}})).)))}}}}}|||{{.|||},,.,{((({...(((((.,,...{{({({((..{(((((({......{{..{{{{{|,,||,{(|{{{||||...||||,,,{{{{....((({((...{{{{{{{{{((,(((,,,,((((.(({....||||{,||||||.}||,}}........,,.}}}}}}}}}..)})))),.)),})))}},)))))))),,)),........(((((((.,({{...(((...((.((((((..((((.....)))).)))))).))..)))...))}.,,.))))))).}.}})))))}..}})},|}}}}....,,.)))))...}})))},|,))|.|))}|.,||||||{(((..(((((((.,{{{(({,...,.},})))}),.)))))))..))}}|{||||||||||,,,,..{{{{|||{{{{.{,((.....{{{{,({{{..{{{{,,,.((((,((....)).}))}..,||||,.|}||,|}}}{(((.((((((.((((((,(({({{.......)})))),}))),,,}}}},.}))))).)))))}.,)))}}))})),,}.,,.........,{{{..(((((((((.....(({(((((..((((((((((((((.....(((.{{.(((,{,(,((((((((,,((((({.,{{.....(((((.....)))))...}},))))))..,))))))))...,....,)))),}},)}.)))...)))))..)))))))))..{{{{........}}}))))))..)))........))))))))),}))))}}}}}}||{{...|}}}}|,,,,,,||||,|,|||||,,,|,|||||{}||||||.{{{|{|{{{...|||,...,,,))))),})))},,))))),}}}))))}},))))))))))))).},,||,.,,....,.)))))))..,||......,..,,,,,..((((({....}))))){{{...{{{{|...})})},,||||{{{{,(((((((((({{{(.....|||...,((((((((((..........)))))),.}}}((((((((((((..,,{,...((((((.{({{.....})})))))))....}},||{{{{{{...(((..((((((....))))))..))).))))))))))))))))))........,..,,,,,,,))))))))))).)))})))))))))..))))))))).|)})))).,}))))))))))}},)))))))..))))))))),..)))))),})))))),}........(((((.....))))).......(((.{......}.))),...{((((((..((((((.{{.((({(((((((((((......))))))...)))))..)))).,,.)))))))))))))..(((((.(((((((((((((((((.......,(((((((((((((((.(({.(((((((((((((((((((((((((((...)))))))))){((((((((.........))))))))}...........{((((((((..{{((((((((,,{,{((((.(({...((((((...,((((.(((((.((((......(((,,.(((((....))))).,}.)))....))))..)).))).)))).,...))))))...}}}.{{({..,(({,....)))}}.))}}..,,.......,,.,,((((,...,,,,||}|,,,,,||....,,,.,,,{{{.,,,...((((((.......))))))...||||}}.|||||...,|,}}))))))}|.}})))))}|{{||..{{(((((((({.{{(((,|({{{{{{{{{|,,..(((((((((((.,,...,,.((((((((((((((((.........)))))))).....(((((.(..(((..(((.....)))..)))..).)))))....{{{{..(({((((((((((.......))))).............}}}}}})},)))}..(((({....))))))))))))),),)))))))))))...((((.......)))).......((((((.((((,{{.....)))))}))))))......,.(((((((....))))))),|,((((((....)))))).))))))...)))))...,}}))))))))))))))))..)))),..(((((((...(((....,{((((,,,|}}|}..(((((((...(((((((((({....}))))))))))...},))})))..{{{{(((..............}}|||}}}((((((((((((((...))))))....))))}}})),,{({|,...|{|||,,.....{|||}|.{{{||||.((((((({((((...))))}..))))))){(((((((((((..((......))..)))))))))))}.,|{|,...})),,.))))}}}}),))))),,,)))...))))))).))))))))))))))))),......,,(((((,...,))))}.})}.)))),{{{{{{..............,.})}})))....,)))))))))))|((((((((((.,......((((((........))))))..,.))))))))))),..))))))))))))))))).))))).........|,{{((((((.{(((......)}})}.)))))))||,...,|||}}},.|||||...||{{,{{((({((({(,..,,,{{{({((,((..,||||},,{{{..((((((,,.{{{{{{{..{{{,,,.,}}})))),)}...((({......)))).)))))).,)))}}}))}},}))))))},)),)))))}))))))))........,)))))))..)))))))))))|((((.....)))),...))))|((((....(((((((.(((......)))..)))))))))))).

Transcripts

ID Sequence Length GC content
CCUUUCCCCUCCGCUUCUCUGACCUAGCUGCGCGGCCCCGGCCCGGGAG… 6553 nt 0.4004
Summary

This gene encodes a glycosyl hydrolase that localizes to the Golgi and catalyzes the final hydrolytic step in the asparagine-linked oligosaccharide (N-glycan) maturation pathway. Mutations in the mouse homolog of this gene have been shown to cause a systemic autoimmune disease similar to human systemic lupus erythematosus. [provided by RefSeq, Dec 2013]

Forensic Context

No relevant information is available at the moment.