Basic Information

Symbol
MAP1A
RNA class
mRNA
Alias
Microtubule Associated Protein 1A MAP1L Microtubule-Associated Protein 1A Proliferation-Related Protein P80 MAP-1A EC 2.7.2.8 EC 6.3.4.5 MTAP1A
Location (GRCh38)
15:43510958-43531620
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
Drug abuse diagnoses
External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_002373.6
Sequence length
10266.0 nt
GC content
0.5521

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-3760.94 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -3938.92 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 2562.94
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_001411089.1 NCBI
GGAAGCUGCCGGACUAACACUCCGCGGGUGUUUCCAUGGAGACCGAGGC… 10548 nt 0.5536
NM_002373.6 NCBI
ACUCCCACCCUAAGUGCUGCAGACUCUUCCCUGAAGCUGCCGGCUGAGG… 10266 nt 0.5521
Summary

This gene encodes a protein that belongs to the microtubule-associated protein family. The proteins of this family are thought to be involved in microtubule assembly, which is an essential step in neurogenesis. The product of this gene is a precursor polypeptide that presumably undergoes proteolytic processing to generate the final MAP1A heavy chain and LC2 light chain. Expression of this gene is almost exclusively in the brain. Studies of the rat microtubule-associated protein 1A gene suggested a role in early events of spinal cord development. [provided by RefSeq, Jul 2008]

Forensic Context

A study in humans demonstrated that the MAP1A was identified as a high-confidence gene in common between mice and humans within the top 10% of genes related to lifetime alcohol consumption [Farris et al. DOI:10.1038/Mp.2014.159].