Basic Information

Symbol
MAP1B
RNA class
mRNA
Alias
Microtubule Associated Protein 1B PPP1R102 MAP5 Protein Phosphatase 1, Regulatory Subunit 102 Microtubule-Associated Protein 1B DFNA83 FUTSCH MAP-1B PVNH9
Location (GRCh38)
5:72107234-72209565
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
Drug abuse diagnoses
External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_005909.5
Sequence length
11790.0 nt
GC content
0.4439

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-3291.34 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -3518.67 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 3239.24
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_001324255.2 NCBI
AUGGCAUCUUGGUGCACGUCUGUGCCAUUCCUCUCAAUAUUUCCAAAGA… 11568 nt 0.4391
NM_005909.5 NCBI
GCAGUGGAGAGGAGCGGCCGGAGCGAGACACUUCGCCGAGGCACAGCAG… 11790 nt 0.4439
Summary

This gene encodes a protein that belongs to the microtubule-associated protein family. The proteins of this family are thought to be involved in microtubule assembly, which is an essential step in neurogenesis. The product of this gene is a precursor polypeptide that presumably undergoes proteolytic processing to generate the final MAP1B heavy chain and LC1 light chain. Gene knockout studies of the mouse microtubule-associated protein 1B gene suggested an important role in development and function of the nervous system. [provided by RefSeq, Jul 2008]

Forensic Context

A study in humans demonstrated that the MAP1B was identified as a high-confidence gene common between mice and humans within the top 10% of genes related to lifetime alcohol consumption [Farris et al. DOI:10.1038/Mp.2014.159].