Basic Information
Symbol
MAP1LC3B
RNA class
mRNA
Alias
Microtubule Associated Protein 1 Light Chain 3 Beta
ATG8F
Microtubule-Associated Proteins 1A/1B Light Chain 3B
Microtubule-Associated Protein 1 Light Chain 3 Beta
Autophagy-Related Ubiquitin-Like Modifier LC3 B
MAP1 Light Chain 3-Like Protein 2
MAP1A/MAP1B Light Chain 3 B
MAP1A/MAP1B LC3 B
Autophagy-Related Protein LC3 B
MAP1A/1BLC3
MAP1LC3B-A
MAP1ALC3
LC3B
Location (GRCh38)
16:87383953-87405090
Forensic tag(s)
Cause of death analysis
Drug abuse diagnoses
MANE select
Transcript ID
NM_022818.5
Sequence length
2147.0 nt
GC content
0.4238
Secondary Structure
Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-557.60 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy:
-605.30 kcal/mol
Frequency:
0.0000
Diversity:
578.49
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts
| ID | Sequence | Length | GC content |
|---|---|---|---|
| AGAGUCGGAUUCGCCGCCGCAGCAGCCGCCGCCCCCGGGAGCCGCCGGG… | 2147 nt | 0.4238 |
Summary
The product of this gene is a subunit of neuronal microtubule-associated MAP1A and MAP1B proteins, which are involved in microtubule assembly and important for neurogenesis. Studies on the rat homolog implicate a role for this gene in autophagy, a process that involves the bulk degradation of cytoplasmic component. [provided by RefSeq, Jul 2008]
Forensic Context
A study in mice demonstrated that the MAP1LC3B (MAP1LC3B-II/LC3B-II) expression is increased by methamphetamine in astrocytes, indicating induction of autophagy, and its upregulation is inhibited by circHIPK2 knockdown and MIR124-2HG overexpression [Huang et al. DOI:10.1080/15548627.2017.1356975]. In human sepsis patients, the MAP1LC3B (MAP1LC3B) exhibited decreased polyadenylation in viral compared to bacterial infection samples, as identified via Nanopore direct RNA-seq [He et al. DOI:10.1186/s12879-025-11078-z]. A study in mice demonstrated that the LC3B-II/LC3B-I ratio, a marker of autophagy, was significantly increased in Kupffer cells upon miR-5101 overexpression, indicating promoted autophagy during LPS-induced endotoxemic liver injury [Yang et al. DOI:10.3390/ijms241311210].