Basic Information

Symbol
MAP2K7
RNA class
mRNA
Alias
Mitogen-Activated Protein Kinase Kinase 7 SAPKK4 MKK7 Dual Specificity Mitogen-Activated Protein Kinase Kinase 7 Stress-Activated Protein Kinase Kinase 4 PRKMK7 Jnkk2 C-Jun N-Terminal Kinase Kinase 2 JNK-Activating Kinase 2 MAP Kinase Kinase 7 MAPK/ERK Kinase 7 SAPK Kinase 4 EC 2.7.12.2 SAPKK-4 MEK 7 JNK Kinase 2 MAPKK 7 MAPKK7 JNKK 2 JNKK2 MEK7 SKK4 MEK
Location (GRCh38)
Forensic tag(s)
Other applications

MANE select

Transcript ID
NM_145185.4
Sequence length
3375.0 nt
GC content
0.6258

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-1516.20 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -1575.21 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 801.85
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
(((.((((........)))).)))...(((((((.(((((..((((((((((((.(((((((((((.((((....)))).))))).........))))))))))).(((.(((..((((((((((((((((((((.((((((((((((((..........(((((......(((......))))))))(((((((.((((......(((((((((((((((((..(((((((............))))...((...(((((((.(((((.(.(((((((((((((.(.((((((((((...((((((.(((((((((.((.(((((.(((.((.........))..)))...))))).))..........(((.((((.((..((((((.(((((((((...(((.((((((((.....((((.(((((((.(((.(.((((...(((((((((((((.(((.((((((.(.((.(((((((((((((....)))).........((((((.........))))))((((........))))......))))))))).))..).)))))).))))))))))...........)))))).....)))).)))).))))))).))))..........((((.(((((((((((((((.........((((.(((((((((..............))).))))))))))((((.((.((......)).))...))))...)))))))...)))))))))))).(((((((((((((..((((((((.....))))).((((....((((((((((....(((((((...(((((((........)))))))...)))))))....(((((((.((((((..(((...((......)))))(((((((..((((((......))))))))).))))................)))))).))((((........)))))))))..)).))))....))))....))))(((((.((((((..(((((((((((........))))).......((((((((..(....)..))))))))....(((((..((((((.....(((((......)))))....)))))).)))))((((.((((((.....(((((((.............((......)).(((((........))))).....((((.((.((.........)))).)))))))))))..((((((((((......))))))))))))))))))))......((((......)))).)))))).)))))).)))))))).))))))))))))))))))))).))))))).(((((....)))))..(((((.(((....((((((.((((.((...(((((..((((.....(.(((((.....))))).).))))..)))))....))...)))).........((((((((......)))))))).......)))))).))).)))))............)))))))))))..)))))).)))(((....)))......)))))))))....(((.((((.(((.........((((......))))))).)))))))((((((((((((((....)))))(((.......)))...))))))..)))..((.(((((((...))))))))).((((((....(((((((((..((..(((((((......((((((((((((..((((..(((((...(((((.((((((((((((((((((.(((((.((...((((((.((((((((...(((.((((((.((.(((.(((..((.(((((((((((((.....(((((((...(((.(...(((.((((((((((.((((.(((..((.((((.(((((((.((((((((.((.((((((((....)))).....(((((.(((((((((.((((...((((((.(((.(((.....))).)))...((((......))))....))))))....)))).))))).)))))))))...(((.((..(((((.......)))))..))))).........)))).)).))))))))..))))))).)))))).....((((((...)))))).))).)))))))))))))))))..).)))...))))))).((((((.....)))))).))))).)))))))).)).))))))..)).)))))).))).((.((((((.((((((...)))))).))))))..))..))).))))).))).))).)))))))...)))))))).).)))))).))).)))))...)))))))))..)))))))))))))))))))..)).)))))))))..)))))))).)))).)))))))))).)))).)))))))))).).))))))))))))..)).)))..))))))))))((.(((((((((((((.(((((((((...(((..((((((((((......))...)))))))).)))...)))))))))....))))))...))))))).)).((((((......))))))))))))).(((((((((((((..(((((((((((.((((...((((((.......(((((((.((...((((((((..............................((((((......)).............(((((..(((.(((.......)))))).)))))))))((((..((((..((................))..))))))))....)))))))).)).))...)))))........))))))............(((........)))....)))).)))))))))))..)))))))))))))((((((((((((.....)))))))))))).)))).)))))))((.((((.......))))))..))))))..((...(((((((((..(((((((((....).))).))))).)))))))))...))(((((......)))))...)))))))).))))))))....................)))))))))...))).))).)))((((((((...(((((((..(((...((.((((((..(((((((((.((............)).))))))).))..)))))).))...)))..(((.(((....)))...))).))))).))...))))))))...(((((((((((((((.(((....)))...))))).........))))))))))))).))))))))).))).................)))).((((((........))))))...(((((..............)))))...
Thermodynamic Ensemble Prediction
(((.(((({......,)))).))),,.(((((((.((((({.(({{((((((((.(((((((((((.((((....)))).))))),........})))))))))).(((.(((..{(((((((((((((((((((.((((((((((((({..,.||,,..(((({......((({{{{.{|||,},||(({((((,(((({{{,.,,{((({,((((((((((..(((((((.{........}.))))...{{...(((((((.(((((.(.(((((((((((((.{.((((((((((...((({.,.(((((((({.((.(((((.(((.{(.,.....,.))..)))...))))).)).,........(((.(({({({..((((((.{(((((((,.,((((.((((((((.....((((.(((((((.(({,(.((((...(((((((((((((.(({.((((((.(,((.(((((((((((((....)))).,.,,,...((({{{...,,,..,))))),((((........))))......))))))))).)).,).)))))).})))))))))...........)))))).....)))).)))).))))))).))))..........((((.(((((((((((((((...,.{{,,((((.(((((((({....,||.....,,)}).))))))))))|||{{{{|{|,....}},}))...)))).}.)))))))...)))))))))))).(((((((((((((..((((((((.....))))).((((....(((((((({{....(((((((...(((((((........)))))))...)))))))...,(((((((.((((((..(((...((......)))))(((((((..((((({......})))))))).))))..,{......,,,...)))))).))((((........))))))))).,}}.))))....))))....))))|((((.((((((..(((((((((((........))))),...,,,((((((((..(....)..))))))))....(((((..((((((.....(((((......)))))....)))))).))))}((({{((((((,..{,({,((((......,.....,{(,.,...,,.{((((........))))),....,,,||||....{(((({,,,,,.|))},}})))),.||||||{{{({,.....))))})))}))))))))))),.,,}.((((......)))).)))))).)))))).)))))))).))))))))))))))))))))).))))}),.|||||...{|||||..(((((.(((....((((((.(((({((...(((((..((((..,..,.(((((,....))))),,,))))..)))))..,.))...}))).....,.(,((((((((......)))))))),}}},,,)))))}.}}}.))))).}}}},......}})))))))))..)})))).)))(((....|||.|,,..)))))))))....{{{.{(((.(((....,,,..((((......))))})).))))))){{({({(({{((((...,))))|{{{.....,})))}}.}})))},.)))..,,.(((((((...)))))))}},(((({({{..(((((((((..,{..,(((,(({{{.{,((((((((((((,{((((..(((((,.{(((((.((((((((({((((((((.(((((.((,,,({((((,{(({{((({{.(((.((((((.((.{{(,(((..((.(((((((((((((....,(.(({(((,.(((,(...((((..(((((((((((((..((((((.{{,{..,|))))})})))))|..|)))))))..)))))}||{(((.((({({((({(((((,(((({{{,,,,||}}}|}(((.....))}.|,,...{{{{..,,..}})),,.,})))))....)))).))))).)))))))))}..,,..,,,{{{((({.{{{{.||||,{{||.,{,,,.,,,||||}{{{|,...}.,}}}}}))}}|,{((((((.((((((((((...)))))).)).}),.))))))),),}}))}})})}..)))),)))).||}}||,))}.)).))).))))).)))))))).)).)))))}..)).)))))).)))},{.((((((.((((((...)))))).)))))),,))..)),,})))),))).}}}.)))))))...)))))))).}.))))))},)).)))))...)))))))),}})))))))))))),))))))).))}))))))))).}))))))),,)))).)))))))))).,)))))))))))))).).)))))))))))),.)),)))..)))))))))){{.(((((((((((((.(((((((((...(((..(((((((({(......)}...)))))))).)))...)))))))))....))))))...))))))).)),{{{{||,,..,,)}))))))))),}.(((((((((((((..(((((((((((.((((,..((((((.......((((({{.{{...((((((({..............................{,,,|,.....,.....,,.....,..(((({..(((.{{{..,,,.,)))))).)}}))||||{(((..{(((..{{................))..))))))))....)))))))).}}.}}...)))))........))))))......,,....(((,....,},,,,..,})))).)))))))))))..)))))))))))))((((((((((((.....)))))))))))).,,))})}}))))||}{,,..}}}},.,})||,..}))))).,{(...(((((((((.,(((((((((....}}}))},)))).)))))))))...))|((((......))))}...)))))))).))))))}}...................,)))))))))}.,}}}.))).)))((((((((...(({((((,.(((...((.((((((..(((((((((.{,.....,......)).)))))))},)..)))))).))...)))..(((.(((....)))...))).))))).))...))))))))...(((((((((((((((.(((....)))...)))))..,,...,,))))))))))))).))))))))).))),...,,.......,,..)))),|(((((........)))))}...{((({..............}))},...

Transcripts

ID Sequence Length GC content
AGUGCGGUGUUUGUCUGCCGGACUGACGGGCGGCCGGGCGGUGCGCGGC… 3423 nt 0.6249
AGUGCGGUGUUUGUCUGCCGGACUGACGGGCGGCCGGGCGGUGCGCGGC… 3396 nt 0.6266
AGUGCGGUGUUUGUCUGCCGGACUGACGGGCGGCCGGGCGGUGCGCGGC… 3375 nt 0.6258
Summary

The protein encoded by this gene is a dual specificity protein kinase that belongs to the MAP kinase kinase family. This kinase specifically activates MAPK8/JNK1 and MAPK9/JNK2, and this kinase itself is phosphorylated and activated by MAP kinase kinase kinases including MAP3K1/MEKK1, MAP3K2/MEKK2,MAP3K3/MEKK5, and MAP4K2/GCK. This kinase is involved in the signal transduction mediating the cell responses to proinflammatory cytokines, and environmental stresses. Alternative splicing results in multiple transcript variants. [provided by RefSeq, Jul 2014] CIViC Summary for MAP2K7 Gene

Forensic Context

A study in mice demonstrated that the MAP2K7 was down-regulated in brain tissue at 8 hours (0.479-fold) and 24 hours (0.496-fold) following whole-body irradiation with 10 Gy γ-rays [Zhao et al. DOI:10.1158/1078-0432.CCR-05-2418]. In a separate clinical study of human burn patients, the MAP2K7 was identified as a gene related only to age and not to burn injury, being classified into a group showing a main effect of age [Zhou et al. DOI:10.1073/pnas.1002757107].