Basic Information

Symbol
MAP3K1
RNA class
mRNA
Alias
Mitogen-Activated Protein Kinase Kinase Kinase 1 MAPKKK1 MEKK1 MEKK MAPK/ERK Kinase Kinase 1 MEK Kinase 1 MEKK 1 Mitogen-Activated Protein Kinase Kinase Kinase 1, E3 Ubiquitin Protein Ligase MAP/ERK Kinase Kinase 1 EC 2.7.11.25 EC 2.3.2.27 SRXY6
Location (GRCh38)
5:56815538-56896152
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
Wound age identification
External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_005921.2
Sequence length
7036.0 nt
GC content
0.4268

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-2058.80 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -2199.87 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 1781.63
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_005921.2 NCBI
GAGCGAAUGUAGCCCGCGAGAGAAAAUGGCGGCGGCGGCGGGGAAUCGC… 7036 nt 0.4268
Summary

The protein encoded by this gene is a serine/threonine kinase and is part of some signal transduction cascades, including the ERK and JNK kinase pathways as well as the NF-kappa-B pathway. The encoded protein is activated by autophosphorylation and requires magnesium as a cofactor in phosphorylating other proteins. This protein has E3 ligase activity conferred by a plant homeodomain (PHD) in its N-terminus and phospho-kinase activity conferred by a kinase domain in its C-terminus. [provided by RefSeq, Mar 2012] CIViC Summary for MAP3K1 Gene

Forensic Context

A study in porcine skin demonstrated that cutaneous bromine exposure significantly increased the MAP3K1 transcript at 7 days post-exposure in both the 45-second and 8-minute exposure groups, identifying it as part of the acute phase response, EGF, NRF2-mediated oxidative stress, and Toll-like receptor signaling pathways [Price et al. DOI:10.1016/j.toxlet.2008.08.007].