Basic Information

Symbol
MAP3K3
RNA class
mRNA
Alias
Mitogen-Activated Protein Kinase Kinase Kinase 3 MAPKKK3 MAPK/ERK Kinase Kinase 3 MEKK3 MEK Kinase 3 MEKK 3 MAP/ERK Kinase Kinase 3 EC 2.7.11.25 CCM5
Location (GRCh38)
17:63622381-63696305
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
Drug abuse diagnoses Cause of death analysis Mechanical injury analysis
External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_002401.5
Sequence length
4752.0 nt
GC content
0.5711

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-1912.00 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -1992.35 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 1039.77
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_001330431.2 NCBI
GUUUUUCGGAGCGUUCCUGAGGUGGAGAACGGUGGCCGGACGGAGAGAC… 4740 nt 0.5711
NM_001363768.2 NCBI
GUUUUUCGGAGCGUUCCUGAGGUGGAGAACGGUGGCCGGACGGAGAGAC… 4833 nt 0.5690
NM_002401.5 NCBI
GUUUUUCGGAGCGUUCCUGAGGUGGAGAACGGUGGCCGGACGGAGAGAC… 4752 nt 0.5711
NM_203351.3 NCBI
GUUUUUCGGAGCGUUCCUGAGGUGGAGAACGGUGGCCGGACGGAGAGAC… 4845 nt 0.5690
Summary

This gene product is a 626-amino acid polypeptide that is 96.5% identical to mouse Mekk3. Its catalytic domain is closely related to those of several other kinases, including mouse Mekk2, tobacco NPK, and yeast Ste11. Northern blot analysis revealed a 4.6-kb transcript that appears to be ubiquitously expressed. This protein directly regulates the stress-activated protein kinase (SAPK) and extracellular signal-regulated protein kinase (ERK) pathways by activating SEK and MEK1/2 respectively; it does not regulate the p38 pathway. In cotransfection assays, it enhanced transcription from a nuclear factor kappa-B (NFKB)-dependent reporter gene, consistent with a role in the SAPK pathway. Alternatively spliced transcript variants encoding distinct isoforms have been observed. [provided by RefSeq, Jul 2008]

Forensic Context

A study in rats demonstrated that the MAP3K3 (Map3k3) was identified as a potential regulator of methamphetamine reward and addiction through transcriptome profiling of whisker follicles, showing an up-down regulated expression pattern (1.41-fold after self-administration, 0.72-fold after withdrawal) and a betweenness centrality score of 0.0133 [Song et al. DOI:10.1038/s41598-018-29772-1]. A study in rats demonstrated that the MAP3K3 was significantly altered in liver gene expression on day 1 following a 20% total body surface area burn injury, where it was classified as a signaling gene involved in inflammatory signaling [Jayaraman et al. DOI:10.1016/j.jss.2007.05.025].