Basic Information

Symbol
MAP3K6
RNA class
mRNA
Alias
Mitogen-Activated Protein Kinase Kinase Kinase 6 MAPKKK6 MEKK6 ASK2 Apoptosis Signal-Regulating Kinase 2 EC 2.7.11.25 Apoptosis Signal Regulating Kinase 2 EC 2.7.11
Location (GRCh38)
1:27355180-27366972
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
Other applications
External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_004672.5
Sequence length
4438.0 nt
GC content
0.6343

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-2000.80 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -2065.31 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 1355.70
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_001297609.2 NCBI
ACAAGUGAAGGCAGGGCAGCGUUGGCGGGCGCUCCCUUGAGAAGUCCAG… 4414 nt 0.6353
NM_004672.5 NCBI
ACAAGUGAAGGCAGGGCAGCGUUGGCGGGCGCUCCCUUGAGAAGUCCAG… 4438 nt 0.6343
Summary

This gene encodes a serine/threonine protein kinase that forms a component of protein kinase-mediated signal transduction cascades. The encoded kinase participates in the regulation of vascular endothelial growth factor (VEGF) expression. Alternative splicing results in multiple transcript variants. [provided by RefSeq, Jul 2014]

Forensic Context

A study in mice demonstrated that the MAP3K6 was up-regulated at 6 hours in gastrocnemius muscle following a distant dorsum burn injury (30% TBSA) but was not differentially expressed in response to a local hind limb burn, identifying it as part of a specific transcriptional response to distant trauma [Padfield et al. DOI:10.01.ta.0000230567.56797.6c].