Basic Information

Symbol
MAP3K7
RNA class
mRNA
Alias
Mitogen-Activated Protein Kinase Kinase Kinase 7 MEKK7 TAK1 Transforming Growth Factor-Beta-Activated Kinase 1 TGF-Beta Activated Kinase 1 EC 2.7.11.25 TGF-Beta-Activated Kinase 1 EC 2.7.11 TGF1a CSCF FMD2
Location (GRCh38)
Forensic tag(s)
Drug abuse diagnoses

MANE select

Transcript ID
NM_145331.3
Sequence length
4932.0 nt
GC content
0.3887

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-1334.70 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -1430.39 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 1410.60
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
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GGCGGAAAACGCAGCGGAGCCAGAGCCGGACACGGCUGUGGCCGCUGCC… 4932 nt 0.3887
GGCGGAAAACGCAGCGGAGCCAGAGCCGGACACGGCUGUGGCCGCUGCC… 4816 nt 0.3891
GGCGGAAAACGCAGCGGAGCCAGAGCCGGACACGGCUGUGGCCGCUGCC… 4735 nt 0.3875
Summary

The protein encoded by this gene is a member of the serine/threonine protein kinase family. This kinase mediates the signaling transduction induced by TGF beta and morphogenetic protein (BMP), and controls a variety of cell functions including transcription regulation and apoptosis. In response to IL-1, this protein forms a kinase complex including TRAF6, MAP3K7P1/TAB1 and MAP3K7P2/TAB2; this complex is required for the activation of nuclear factor kappa B. This kinase can also activate MAPK8/JNK, MAP2K4/MKK4, and thus plays a role in the cell response to environmental stresses. Four alternatively spliced transcript variants encoding distinct isoforms have been reported. [provided by RefSeq, Jul 2008]

Forensic Context

A study in mice demonstrated that chronic methamphetamine administration significantly dysregulates the MAP3K7 in microglia, implicating it in autophagy and protein processing of endoplasmic reticulum pathways [Oladapo et al. DOI:10.3390/Ijms26020649].