Basic Information

Symbol
MAP3K8
RNA class
mRNA
Alias
Mitogen-Activated Protein Kinase Kinase Kinase 8 Tpl-2 C-COT MEKK8 ESTF EST COT Tumor Progression Locus 2 Proto-Oncogene C-Cot Proto-Oncogene Serine/Threoine Protein Kinase Augmented In Rheumatoid Arthritis 2 Cot (Cancer Osaka Thyroid) Oncogene Serine/Threonine-Protein Kinase Cot Cancer Osaka Thyroid Oncogene Ewing Sarcoma Transformant EC 2.7.11.25 AURA2 TPL-2 TPL2
Location (GRCh38)
10:30433473-30461833
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
-
External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_005204.4
Sequence length
2850.0 nt
GC content
0.4449

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-867.80 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -920.33 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 542.16
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_001244134.1 NCBI
ACCCUGCAACCGGGCAGUCUCUUUCUGUUUACGGAGAGAAAGGGGAAAU… 2782 nt 0.4576
NM_001320961.2 NCBI
AGUGCUGGUCUGGGCAGUGCGCGGGGAAGCGGGGACCCGCUGUCACUGC… 2527 nt 0.4329
NM_005204.4 NCBI
ACUCGUCCGCUCCGCUCUGGACUGCGCGCCACGCUCUGGGGUCCGGCGC… 2850 nt 0.4449
Summary

This gene is an oncogene that encodes a member of the serine/threonine protein kinase family. The encoded protein localizes to the cytoplasm and can activate both the MAP kinase and JNK kinase pathways. This protein was shown to activate IkappaB kinases, and thus induce the nuclear production of NF-kappaB. This protein was also found to promote the production of TNF-alpha and IL-2 during T lymphocyte activation. This gene may also utilize a downstream in-frame translation start codon, and thus produce an isoform containing a shorter N-terminus. The shorter isoform has been shown to display weaker transforming activity. Alternate splicing results in multiple transcript variants that encode the same protein. [provided by RefSeq, Sep 2011]

Forensic Context

No relevant information is available at the moment.