Basic Information

Symbol
MAP4
RNA class
mRNA
Alias
Microtubule Associated Protein 4 Microtubule-Associated Protein 4 MAP-4
Location (GRCh38)
3:47850678-48089295
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
Other applications
External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_001385682.1
Sequence length
9232.0 nt
GC content
0.4981

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-3060.70 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -3226.65 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 2151.68
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_001385677.1 NCBI
AUUUGGACAGAAAUGUUGAAGGCAGGUGCCUGAUCCAAAAUGCAUUUAG… 5683 nt 0.5300
NM_001385681.1 NCBI
AUUUGGACAGAAAUGUUGAAGGCAGGUGCCUGAUCCAAAAUGCAUUUAG… 5734 nt 0.5302
NM_001385682.1 NCBI
AUUUGGACAGAAAUGUUGAAGGCAGGUGCCUGAUCCAAAAUGCAUUUAG… 9232 nt 0.4981
NM_001385684.1 NCBI
AUUUGGACAGAAAUGUUGAAGGCAGGUGCCUGAUCCAAAAUGCAUUUAG… 5638 nt 0.5294
NM_001385685.1 NCBI
AUUUGGACAGAAAUGUUGAAGGCAGGUGCCUGAUCCAAAAUGCAUUUAG… 5581 nt 0.5286
NM_001385686.1 NCBI
AUUUGGACAGAAAUGUUGAAGGCAGGUGCCUGAUCCAAAAUGCAUUUAG… 5848 nt 0.5292
NM_001385687.1 NCBI
AUUUGGACAGAAAUGUUGAAGGCAGGUGCCUGAUCCAAAAUGCAUUUAG… 9232 nt 0.4986
NM_001385688.1 NCBI
AUUUGGACAGAAAUGUUGAAGGCAGGUGCCUGAUCCAAAAUGCAUUUAG… 9001 nt 0.4983
NM_001385689.1 NCBI
AUUUGGACAGAAAUGUUGAAGGCAGGUGCCUGAUCCAAAAUGCAUUUAG… 9118 nt 0.4988
NM_001385690.1 NCBI
AUUUGGACAGAAAUGUUGAAGGCAGGUGCCUGAUCCAAAAUGCAUUUAG… 2875 nt 0.3816
Showing 131 to 140 of 144 entries
Summary

The protein encoded by this gene is a major non-neuronal microtubule-associated protein. This protein contains a domain similar to the microtubule-binding domains of neuronal microtubule-associated protein (MAP2) and microtubule-associated protein tau (MAPT/TAU). This protein promotes microtubule assembly, and has been shown to counteract destabilization of interphase microtubule catastrophe promotion. Cyclin B was found to interact with this protein, which targets cell division cycle 2 (CDC2) kinase to microtubules. The phosphorylation of this protein affects microtubule properties and cell cycle progression. Multiple transcript variants encoding different isoforms have been found for this gene. [provided by RefSeq, Aug 2008]

Forensic Context

A study in humans demonstrated that the MAP4 gene was downregulated in subcutaneous adipose tissue during short-term weight loss [Bollepalli et al. DOI:10.1038/ijo.2017.245].