Basic Information

Symbol
MAP4
RNA class
mRNA
Alias
Microtubule Associated Protein 4 Microtubule-Associated Protein 4 MAP-4
Location (GRCh38)
3:47850678-48089295
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
Other applications
External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_001385682.1
Sequence length
9232.0 nt
GC content
0.4981

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-3060.70 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -3226.65 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 2151.68
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_001384813.1 NCBI
GUCUCCUACCUCCUCACGGCUCUUCCCGGCGCUCUCCUGGCUCCCUUCU… 4488 nt 0.5452
NM_001384814.1 NCBI
GUCUCCUACCUCCUCACGGCUCUUCCCGGCGCUCUCCUGGCUCCCUUCU… 5676 nt 0.5338
NM_001384815.1 NCBI
GUCUCCUACCUCCUCACGGCUCUUCCCGGCGCUCUCCUGGCUCCCUUCU… 4214 nt 0.5524
NM_001384816.1 NCBI
GUCUCCUACCUCCUCACGGCUCUUCCCGGCGCUCUCCUGGCUCCCUUCU… 5721 nt 0.5336
NM_001384817.1 NCBI
GUCUCCUACCUCCUCACGGCUCUUCCCGGCGCUCUCCUGGCUCCCUUCU… 4307 nt 0.5491
NM_001384819.1 NCBI
GUCUCCUACCUCCUCACGGCUCUUCCCGGCGCUCUCCUGGCUCCCUUCU… 5633 nt 0.5356
NM_001384820.1 NCBI
GUCUCCUACCUCCUCACGGCUCUUCCCGGCGCUCUCCUGGCUCCCUUCU… 5816 nt 0.5339
NM_001384824.1 NCBI
GUCUCCUACCUCCUCACGGCUCUUCCCGGCGCUCUCCUGGCUCCCUUCU… 5702 nt 0.5349
NM_001384825.1 NCBI
GUCUCCUACCUCCUCACGGCUCUUCCCGGCGCUCUCCUGGCUCCCUUCU… 5570 nt 0.5382
NM_001384826.1 NCBI
GUCUCCUACCUCCUCACGGCUCUUCCCGGCGCUCUCCUGGCUCCCUUCU… 5438 nt 0.5340
Showing 71 to 80 of 144 entries
Summary

The protein encoded by this gene is a major non-neuronal microtubule-associated protein. This protein contains a domain similar to the microtubule-binding domains of neuronal microtubule-associated protein (MAP2) and microtubule-associated protein tau (MAPT/TAU). This protein promotes microtubule assembly, and has been shown to counteract destabilization of interphase microtubule catastrophe promotion. Cyclin B was found to interact with this protein, which targets cell division cycle 2 (CDC2) kinase to microtubules. The phosphorylation of this protein affects microtubule properties and cell cycle progression. Multiple transcript variants encoding different isoforms have been found for this gene. [provided by RefSeq, Aug 2008]

Forensic Context

A study in humans demonstrated that the MAP4 gene was downregulated in subcutaneous adipose tissue during short-term weight loss [Bollepalli et al. DOI:10.1038/ijo.2017.245].