Basic Information

Symbol
MAP4K3
RNA class
mRNA
Alias
Mitogen-Activated Protein Kinase Kinase Kinase Kinase 3 GLK MAPKKKK3 RAB8IPL1 Germinal Center Kinase-Related Protein Kinase MAPK/ERK Kinase Kinase Kinase 3 MEK Kinase Kinase 3 EC 2.7.11.1 MEKKK 3 Germinal Center Kinase-Like Kinase EC 2.7.11 MEKKK3
Location (GRCh38)
2:39249266-39437324
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
Mechanical injury analysis
External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_003618.4
Sequence length
4335.0 nt
GC content
0.3947

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-1172.40 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -1257.87 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 1159.47
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_001270425.2 NCBI
GGAAGCCAUGUUGGAGUUUCACCCCGAGCGAGGGGCUGCGAGGGUUCUC… 4272 nt 0.3947
NM_001410753.1 NCBI
GGAAGCCAUGUUGGAGUUUCACCCCGAGCGAGGGGCUGCGAGGGUUCUC… 4214 nt 0.3951
NM_003618.4 NCBI
GGAAGCCAUGUUGGAGUUUCACCCCGAGCGAGGGGCUGCGAGGGUUCUC… 4335 nt 0.3947
Summary

This gene encodes a member of the mitogen-activated protein kinase kinase kinase kinase family. The encoded protein activates key effectors in cell signalling, among them c-Jun. Alternatively spliced transcripts encoding multiple isoforms have been observed for this gene. [provided by RefSeq, Jul 2012]

Forensic Context

A study in rats demonstrated that the MAP4K3 (mitogen-activated protein kinase kinase kinase kinase 3) was significantly altered in expression in liver tissue on day 1 following a 20% total body surface area burn injury, as part of a broader inflammatory signaling response [Jayaraman et al. DOI:10.1016/j.jss.2007.05.025].