Basic Information

Symbol
MAP4K5
RNA class
mRNA
Alias
Mitogen-Activated Protein Kinase Kinase Kinase Kinase 5 KHS KHS1 GCKR MAPK/ERK Kinase Kinase Kinase 5 Kinase Homologous To SPS1/STE20 Germinal Center Kinase-Related MEK Kinase Kinase 5 EC 2.7.11.1 MEKKK 5 EC 2.7.11 MAPKKKK5
Location (GRCh38)
14:50417845-50561126
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
Drug abuse diagnoses
External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_006575.6
Sequence length
4270.0 nt
GC content
0.3909

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-1093.00 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -1179.58 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 1373.63
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_006575.6 NCBI
GUACGCGCCUCCGCCGCCCCCGAGAGGACGCGCCGUGCAGCGGCUGAGU… 4270 nt 0.3909
NM_198794.4 NCBI
GUACGCGCCUCCGCCGCCCCCGAGAGGACGCGCCGUGCAGCGGCUGAGU… 4318 nt 0.3942
Summary

This gene encodes a member of the serine/threonine protein kinase family, that is highly similar to yeast SPS1/STE20 kinase. Yeast SPS1/STE20 functions near the beginning of the MAP kinase signal cascades that is essential for yeast pheromone response. This kinase was shown to activate Jun kinase in mammalian cells, which suggested a role in stress response. Two alternatively spliced transcript variants encoding the same protein have been described for this gene. [provided by RefSeq, Jul 2008]

Forensic Context

A study in mice demonstrated that selection for ethanol preference significantly altered gene expression and network connectivity in the nucleus accumbens shell, with the greenyellow coexpression module enriched for receptor signaling genes showing reduced connectivity in the low-preference line [Colville et al. DOI:10.1111/Gbb.12367].