Basic Information

Symbol
MAPK1
RNA class
mRNA
Alias
Mitogen-Activated Protein Kinase 1 ERK2 Extracellular Signal-Regulated Kinase 2 P41mapk MAPK2 PRKM1 PRKM2 ERK Mitogen-Activated Protein Kinase 2 MAP Kinase 1 MAP Kinase 2 EC 2.7.11.24 P42-MAPK MAPK 2 ERK-2 ERT1 Protein Tyrosine Kinase ERK2 MAP Kinase Isoform P42 EC 2.7.11 P42MAPK MAPK 1 NS13 P38 P40 P41
Location (GRCh38)
Forensic tag(s)
Cause of death analysis

MANE select

Transcript ID
NM_002745.5
Sequence length
5881.0 nt
GC content
0.4389

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-1758.10 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -1869.57 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 1498.65
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
(((((((((((.(.(((((.....((((((((.(.((((..((((((((...(.((((((((((.((((...(((((((((((........(((.((((((.(((....))).)))))).)))))))))))).)).))))))))))))((.((((((...(((((.((...)).)))))..)))))).)).(((((((((......(((.((..((((.(((((.(((((((((((.......))))))))....(((((((((...(((((......((((((..(((((((......))))))).(((...))).))))))((((.((((.((((...))))...))))..)))).................))))).)))))))))...))).))))).(((((((((..(((((..........(((((((((((((((.((((((((((((((....))))))..........((((((((.((.(((((.(((....(((((((.(((((((((((.(((.((((...((((((((..((((....((((.((((((.....((((...........))))........(((((((.((.....((((........))))(((((((.....(((((..((.(((((.........(((.....(((.(((..(((...(((((((((..((((((((((...(((...)))...))))))))))..))....)))))))...)))...))))))......))).........))).)).))...))))).....)))))))..((((((((......))))).)))......(((((((((((((...((((((((....(((((((...((((.((((((((((((((((((.........((((((.....(((.(((((((.(((((((((....))).)))))).))))))).)))..............)))).)).......)))))))).................(((((...((((((...))))))..(((((((.(((((......((..(.....)..))...((((....(((((.((........)).)))))....))))(((....)))..........))))))))))))......((.((((.(....).))))))..)))))..............)))))..)))))....))))..)).)))))(((((((.....))))))).....))))))))...)))))....))))))))........(.((((((.((((.(((.((((((((.........((((....)))).......))))))))))).)))).)))))).)....((((.((((((((((................)))))))...))).))))))..))))))))))))).))))...))))..)))))...)))....))))))).......(((((((((((((..(((.(((((((((((((((..((((((((((((((....))))).........)))))))))....)))))))..((((((((.(((((((.(((((((((.((((((..(((.((((((((((((((...((.(((.((((.......))))..))).))...)))))....((((((...((((...(((((((((......(((......)))(((((((.((....))))).))))..))))))))).(((((...((.(((((.((.((((((........(((((((...((((....))))..)))))))....(((((......)))))....((((((((((((................))))))))))))(((((((((((.........(((..((((.((.(((((((...))))))).)).)))))))...(((((((((.........)))))))))........((((((((((((((.(((((..(((....))))))))))).(((((.((.....)).)))))((((.(((......))).)))).)))))))))))....(((((((...)))))))))))))).....))))..(((((.((((........)))).))))).)))))).)).))))).))...).))))))))..)))))).....(((((((((((......((((((.((((.((((...(((((....))))).)))).)))).)))))).....))))))).))))))))))))).))))))))))))))))))))))))).)))))))).......................((((((((((((.(((((((((.((((((.(..((((((((((((((....((((((......(((..((.((((((...))).))).))..)))...(((..((((((((((((((((...(((((((................(((((......)))))((((......)))).......)))).)))....)))))).....((((((((((((((((((.(...((..(((((((((..(((((((((((((((.........(((.((((........)))).)))...(((((((.(((.....((((.(((...(((((((((..((....))..)).)))).))).((((..(((((((((((.............((((((((((.......((((.....(((((((.((((...((...((((....))))..)).....))))..)))))))......))))))))))))))...((((((......((......)).....))))))...((.(((((((.........(((((((...(((((((((.(((..(((((((((...........)))))))))..)))............)))))))))..((((((...((((.(((...)))..))))...)))))))).)))))..((((((......))))))........((((((((..(((....((((.....)))).(((((.((....(((.(((.....(((.(((.((((((((..(((....)))..)))))))).((((((...))))))...(((((((((..((..((((((.((.((((((.((((.((.....((((...............)))).....)).)))).))))))))......((((((((....)))))))).....(((((((((((.....)))..))))))))........(((..(((((.((..........)).)))))..)))((((((((((((((...........))).)))).))))).))((((((((.(((.((.((....)).....)).))).....))))))))((.((((....(((((.........))))).)))).)).......))))))..)).)))))))))((((..((((....)))).))))..(((((((((.((...((((.(.((((((((((.(((.(((((.....(((......)))..))))).))).)))))))))).).)))).....))))).))))))....))).)))......))).)))....)).)))))..........))).)))))))).....))))))).))....))))))).))))))))..(((((((((((.(((((((((....(((.((...)).)))....)))))).))).))........))))))))))))))))..))).)))))))...((((....)))))))))))..........(((((((...(((((.((.(((..((......))..))).))))))).((((......))))((((((.((...((((((((((((...((((((((........)))..............((((.(((((...........))))).)))))))))...))))).((((.........))))....(((((((.(.(((...((((((((.......)))))))).)))..).))))))))))))))..)).)))))).(((((((.((((......))))))))))).))))))).......((((.....))))))).)))))....)))))))))..))...).)))))))))))))).))))(((((((((((((((((((..((((....)))).))).))))))))).(((.((....(((((((....)))))))...)).)))....((((((((......))))))))((((((....((((.........((((..((((((...(((.((..((((((((...))))))))..))..)))...))))))...)))).........)))))))))).....(((((((....((((....)))))).)))))....))))))).((((.((((..(((((.((((..(((((....)))))....)))).)))))..)))).)))).....))))))))))..)))....(((..(((((((((((.(((((((.....)))))))...)))))))))))..))).))))))))))))))))))))..).)))))).)))).)))..)).)))))....(((((((((((..........)))))))))))...............)))))))))))))..)).)))..(((....)))(((......))))))))))))..))))..........((.....))....))))))))))).))))))).(((((((.(((.((....)))))...)))))))))).))))).))...))))))))...((((.((((((((........(((....))).......)))))))).))))......(((((((((...(((((((....))))))).((((......))))............))))))))).(((..((((...))))..))).((((((.((((((((..............((((((((((((((...((((...........)))).)))))))...)))))))....)))))))).))))))(((((((((.(((((((((((............)))))...........((..((......))..)).((((.(((......))).)))).(((..(((((((.(((..((((.......((((((.(..(((((((....(.......)....)))))))..))))))).......)))).))).)))))))))).......))))))))))))))))))).)))).)))...))))).)).)))))))))))))))))))(((((((............))))))).((((((((((((.((((.......)))).)))))))...))))).......))))..))))))))))))))..((((((.(((((......((((((((..(((((((((..........))))))))).....(((((....)))))............(((((........)))))...........))))))))))))).)))))))).)...)))..))))))))).))))))))).....(((.((((........))))...))).........((((((((...))))))))..))))).).))))))..(((((.((....(((........)))...)).))))).........(((((........)))))))))).((((((...((((...(((((..((..(((((((......)))))))..)).))))).)))).))))))..
Thermodynamic Ensemble Prediction
(((((((((((.(((,(((((..,{{.{,(((((((((.{(((((((((((((({(((((((((.((((...(((((((((((,.,.{{{,{({,((((({.{{|.,..))),))})})}},,))))))))).)).))))))))))))).}((((((...(((((.((...)).)))))..))))))((({((((((((((,....(((.(((({({{,{(((,(((((((,,((({{..{,.,,}),,)}|||.{||||||{{,,,{{{||,|,||,|{{{{,.{(((({((,,,..,||}}|||,{{{...|||,||||||{(((.((((.((((...})))...))))..))))}|,,.....,.......))}}|,|||}|}}}}.......(({..((((((.,{((((((((((....)))))..{{..{{{||}.{{((({....((((((....))))))((({.(((((..........)))))..}))).....(((((.....)))))....))))}),....,{,{((({,...,.,,.))))),,......,,}||{{{.,{,....,|,}}}}...,}}}})..))),,.,}|||||}|{{................|,},,,.}})))},))))),)),...})}.(((((((((.{(.{{.........(((((((((..((((((((((...(((...)))...))))))))))..))....))))))).((((((..(((((((((((({(((((((({....,((((((((((((..........((((..((((((((......))))).)))..}}}}(((((((((((((.,.((((((((....(((((((...((((.,,{{{,{{{{((((((((.........((((((.....(((.(((((((.(((((((((....))).)))))).))))))).)))..............)))).)}.......)))))))},,...............(((((...((((({...})))))..(((((((.(((((......((,.{.....}..},...((((.,,.(((((.((........)).))))),,..))))(((....)))...,,,....))))))))))))......((.((((.{....,.))))))..))))).,,,.,,{{{....,})))}})))))....))))..))}}}}))(((((((.....))))))).....)))))))).,.)))))....))))))))........(.((((((.((((.((({((((((((....,...,{((,....))},.......))))))))))).)))).)))))).).{{.((((.((((((((((................)))))))...))).))))))|||||||...{{{.(((......)))..))},{{,..,,},,...}}})))}...,..,)))).))))))))))))))}}}..(((((((((..(((((((((,({,,..,{|||,,..,}}))}.)))))))))....)))))))))((((((((.(((((((((((((((({,((((({.,(((.((((((((((((((.,.((.(((.,{(({{.....})))}.))).)).,,)))||....((((({...{(((,,,({{({((((.{{{{.,,....,..,}}||{{|||.,,..}})}))).}},,..}}}}|}|||.(((((...{{.(((((.(((((((,,........(((((((.,,((((....))))}.)))))))....(((((......)))))....((((((((((((......,,........)))))))))))),,,,((((((({{{{,....{((..((((.({.(((((({...))))))).)).))))}}}...((((((((({{....}}}))))))))}........((((((((((({{,{(((((.,((,..,.,}.})}})))).{{{{{,{{,,...}).))))|((((.(((......))).)))),)))))))))))....(((((({...})))))}.,,,}}}....|||||..{{{||,||{,.|.....})))),))))},)))))),}).))))).})...).))))}))}.,)))))).,,,.(((((((((((......((((((.(({{..{(({,,(((({....,)))).,}}),)))).}}}))).....))))))).))))))))))))).))))))))))))))))))))))))).)))))))).....................((((((.(((((((......,{,{,,,{((((((((((((({,((....{,..,,,,.....(((((((,,{.{(({,(((,.....}||||},,{{{{(({.{,{....,{{{|||||||,,||,}.))),.,}}}||}}|.....{((((......))))}((((......))))...,,}.}}}}...}}),.}))}}},)))))))....}))))))))))).))))},,,,((((...((((.(((((((.(((.......,..,,,.{(((........))))||||......(({,{((.,,...{{,.((({,,.{{{{{{{{{,,((...,|}..}),)))).)}}.((((((((((.,.,,.{{{{||,,......((((((((((.......{{({.....(((((((.((((...{{...((((....))))..}}.....))))..)))))))......)))})))))))))),,.((((((......((......)).....))))))..,{{{{,.{((((,,,,...,,...,,}}.,|,||||||{.(((..(((((((((...........)))))))))..))).,,,,,}},,,,,,|||||},.(((((((.{........}.))))))),)))))}.,,..)))))))))).{(((((......)))))))))),))}.,,.))))}}.......{(((.....)))}..))))).))))).))))..)))).,},)))},((((((((..(({....,))..)))))))).((((((...))))))....))))))).)))))),,,..............,))},....)))))))))))))))))......,.......},},...)))))))))......((((((((....)))))))),))),}}))))}}})},,),)))))))))).}.))).))))))}.}}))))))}.{(((((({.,{(,(({{{..,{.{,((((((((((((...........))).)))).))))).)).}}}}}.||{{((({.{{({{.,....{{({{(((((((....,((((((.((((({..,((({.........))))((((((.{((((((((((((({.((((.......{(((((..((((....)))).)))))}{((((((((.{(.,.((((.(.((((((((((.(((.(((((..,,.{((......))),.))))).))).)))))))))).).)))).....}}))),||||||,,.....||||,,.,}}},..(((......)))..........(((((((((,,((((.,{{{{{(((((,,,,,,{{||.,{{,.,,}}}}}}.(((((((((({.(((((((((....(((.({...}).)))....)))))).))).}}........))))))))),{....,,},{{{((((((...(((((((((((((((.,(((,{({...,{{{{{((((...||((({(,.,{{}}||.,,,..}}}}}}}.}}{{{{{{(....}}}}})).,((((((.{(.,.((((((({((({...((((((((........)))...,,.,|......|(({.{((((...........))))}.)))))))))...})))}.((((.........))))....(((((((.{.{((...((((((((.......)))))))).)))..}.))))))))))))))..)}.)))))).(((((((.((((......))))))))))).}}}}}||{{{,....(((((..,{{,(((((((((({(((.({{.(((((({,,..{((((|,(((((.(((((((((((((((((((((((((((..((((....)))).))).))))))))).(((.((.,..(((((((....)))))))..))).)))....((((((((......)))))))){(((((....((((.........((((.,((((((...(((.{,..((((((({...})))))))..,,..)))...)))))).,.)))).........)))))))))).....{{{{{|{....((((,,..}}}}.,,))))),}}}))))))))(((((((({..(((((,{({(,,,((((,,,,|||||..,,||||.}}}}}...{|||,,,,...,||||.{{{|||,...}}}}}|{{{{(((({{{.....(((((((.....))))))).(((.((((((((({....)))))))))).)))....,.{(({((,,(,,(((|{{|.{,,.{{(((((,{{.(((((((((((..........)))))))))))....|{||.}}}}..,}},,}.}}},|}||||.||{,|}|||.,|}||||||,.,,,,..,{|||,.(((.(((((((.....))))))).)))..{((((((((((.{.{,.....},},))))}.})))))}||||||,..,},}}||||,}}}},||||{{{.{{{((((((..{{{(.(({{{{{{........(({....}}},,.....)))))))).)))}......(((((((({{{,(((((((....})))))}{(((,...,}})}}}...{{,.(({{..{|{{|,,,,{({..{{({...}}))..))),,....)}))).,)))}..,,...,,||||,,{(((.{{{{{,,,}}|{{|},,..,}}}}}))))})||||||,|.|,,,,||,,,,,.}}}.}}}}.,,)))))),,)))))).}}},{|||............)))))........)))))))||}}}.,.,}},})))),,,,,..........)))},))).)))))))))))...,,}.,}}}|||||,|}}|....,{{{|||,,,,|..........,.}}}}}}}.)))))))))}...,}}.},})))))})}}).)))}.)))).)))))))))))...)))}}),...))}})))}))))),}..,}.)))).,},}},})))))))))).}))))))))...({.{.((((((((((((((.((((.......)))).)))))))).,,},,,}|........,..)))))).}.))))))).}.,.)))))),........}))))).))))))|(((,,..,(({{,{|..}}}}..,,..,,||{}},,))),,.,.,||||{{,.,,||))),}},.....{{{{{({..............)))))))))))))).))).,)}}..)))}.,})}},{((((((((......))))))))}.....,|..{|{{........)))},,|})))))))}))))))))).)}},,},))))}.))}.},)))),.})))))....((((...((({(({{,,,......||||{..,,,,..}||}}.,,,}}}....,,,,,}))).}))...))))..(((((((......)))))))..,,....,}..............

Transcripts

ID Sequence Length GC content
AGUCUGGCAGGCAGGCAGGCAAUCGGUCCGAGUGGCUGUCGGCUCUUCA… 5881 nt 0.4389
GCCCCUCCCUCCGCCCGCCCGCCGGCCCGCCCGUCAGUCUGGCAGGCAG… 1514 nt 0.4980
Summary

This gene encodes a member of the MAP kinase family. MAP kinases, also known as extracellular signal-regulated kinases (ERKs), act as an integration point for multiple biochemical signals, and are involved in a wide variety of cellular processes such as proliferation, differentiation, transcription regulation and development. The activation of this kinase requires its phosphorylation by upstream kinases. Upon activation, this kinase translocates to the nucleus of the stimulated cells, where it phosphorylates nuclear targets. One study also suggests that this protein acts as a transcriptional repressor independent of its kinase activity. The encoded protein has been identified as a moonlighting protein based on its ability to perform mechanistically distinct functions. Two alternatively spliced transcript variants encoding the same protein, but differing in the UTRs, have been reported for this gene. [provided by RefSeq, Jan 2014] CIViC Summary for MAPK1 Gene

Forensic Context

A study in Sprague-Dawley rats demonstrated that the MAPK1 gene expression was significantly increased in drowning groups compared to control, hypoxia, and postmortem submersion groups [Kim et al. DOI:10.1007/S00414-023-02992-5].