Basic Information

Symbol
MAPK10
RNA class
mRNA
Alias
Mitogen-Activated Protein Kinase 10 JNK3 P54bSAPK P493F12 PRKM10 Stress-Activated Protein Kinase JNK3 Stress-Activated Protein Kinase 1b C-Jun N-Terminal Kinase 3 MAP Kinase P49 3F12 MAP Kinase 10 EC 2.7.11.24 SAPK1b JNK3A Stress Activated Protein Kinase Beta JNK3 Alpha Protein Kinase EC 2.7.11 MAPK 10 SAPK1B
Location (GRCh38)
4:85990007-86594625
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
Mechanical injury analysis Forensic psychiatry evaluation
External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_138982.4
Sequence length
8735.0 nt
GC content
0.3924

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-2270.60 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -2445.08 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 2070.75
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_001318067.1 NCBI
GCUAGUGUGAGAAACACCAACAGCAGGCCCAUCUCAGAUCUUCACUAUG… 6466 nt 0.4043
NM_001318068.1 NCBI
AACCAUAAUUAUCAUGUGAUCUAGACCUGAUACAUUGUAGAUGAAGAAA… 6561 nt 0.4044
NM_001318069.2 NCBI
ACAAUGGUACAGGCAGCAUCACGCUGCACAAUGGUUUCCAGGCAGUGAA… 8735 nt 0.3924
NM_001351624.2 NCBI
ACAAUGGUACAGGCAGCAUCACGCUGCACAAUGGUUUCCAGGCAGUGAA… 8752 nt 0.3926
NM_001351625.3 NCBI
ACAAUGGUACAGGCAGCAUCACGCUGCACAAUGGUUUCCAGGCAGUGAA… 8757 nt 0.3927
NM_001363657.3 NCBI
ACAAUGGUACAGGCAGCAUCACGCUGCACAAUGGUUUCCAGGCAGUGAA… 8767 nt 0.3927
NM_002753.6 NCBI
CCUUCUCCCUGCAGCUUUCCCAGUGCCUCCAGCAGCCCUCCUCAAGGAC… 8510 nt 0.3957
NM_138980.4 NCBI
ACAAUGGUACAGGCAGCAUCACGCUGCACAAUGGUUUCCAGGCAGUGAA… 8762 nt 0.3925
NM_138982.4 NCBI
ACAAUGGUACAGGCAGCAUCACGCUGCACAAUGGUUUCCAGGCAGUGAA… 8735 nt 0.3924
Summary

The protein encoded by this gene is a member of the MAP kinase family. MAP kinases act as integration points for multiple biochemical signals, and thus are involved in a wide variety of cellular processes, such as proliferation, differentiation, transcription regulation and development. This kinase is specifically expressed in a subset of neurons in the nervous system, and is activated by threonine and tyrosine phosphorylation. Targeted deletion of this gene in mice suggests that it may have a role in stress-induced neuronal apoptosis. Alternatively spliced transcript variants encoding different isoforms have been described for this gene. A recent study provided evidence for translational readthrough in this gene, and expression of an additional C-terminally extended isoform via the use of an alternative in-frame translation termination codon. [provided by RefSeq, Dec 2017]

Forensic Context

A study in mice demonstrated that the MAPK10 mRNA was extracted as part of the focal adhesion pathway in a dynamic LncRNA-mRNA network constructed from spinal cord tissue following contusion injury, implicating it in processes like cell motility, proliferation, and differentiation [Ding et al. DOI:10.1155/2016/9249401]. In human brain tissue, the MAPK10 gene was identified as a downregulated marker involved in the dopaminergic synapse pathway within a machine learning model for classifying Major Depressive Disorder [Verma and Shakya DOI:10.007/s11571-021-09724-8].