Basic Information

Symbol
MAPK13
RNA class
mRNA
Alias
Mitogen-Activated Protein Kinase 13 SAPK4 P38delta PRKM13 Mitogen-Activated Protein Kinase P38 Delta Stress-Activated Protein Kinase 4 MAP Kinase P38 Delta MAP Kinase 13 EC 2.7.11.24 MAPK 13 EC 2.7.11 MAPK-13
Location (GRCh38)
6:36127809-36144524
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
Other applications
External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_002754.5
Sequence length
6316.0 nt
GC content
0.5193

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-2498.44 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -2608.80 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 1545.44
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_002754.5 NCBI
GGGGCGCUGGGAGCCCGUUGGGCCGCGAACGCAGCCGCCACGCUGGGGC… 6316 nt 0.5193
Summary

This gene encodes a member of the mitogen-activated protein (MAP) kinase family. MAP kinases act as an integration point for multiple biochemical signals, and are involved in a wide variety of cellular processes such as proliferation, differentiation, transcription regulation and development. The encoded protein is a p38 MAP kinase and is activated by proinflammatory cytokines and cellular stress. Substrates of the encoded protein include the transcription factor ATF2 and the microtubule dynamics regulator stathmin. Alternatively spliced transcript variants have been observed for this gene. [provided by RefSeq, Jul 2012]

Forensic Context

A study in rats demonstrated that acute ethanol exposure induces anxiolysis and is associated with decreased mRNA levels of the MAPK13 in the amygdala, as validated by quantitative RT-PCR [Krishnan et al. DOI:10.1038/S41380-022-01732-2].