Basic Information

Symbol
MAPK8
RNA class
mRNA
Alias
Mitogen-Activated Protein Kinase 8 SAPK1 JNK1 PRKM8 JNK Stress-Activated Protein Kinase 1c C-Jun N-Terminal Kinase 1 JUN N-Terminal Kinase MAP Kinase 8 EC 2.7.11.24 JNK-46 SAPK1c Stress-Activated Protein Kinase JNK1 Stress-Activated Protein Kinase 1 JNK21B1/2 EC 2.7.11 JNK1A2 SAPK1C MAPK 8
Location (GRCh38)
10:48306639-48439360
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
Cause of death analysis
External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_001323329.2
Sequence length
5809.0 nt
GC content
0.3760

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-1463.40 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -1580.59 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 1655.04
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_001323327.2 NCBI
GUUACUCAGCCGAGCGGCCGAGGCCGGACGACGCGGCUUGGAUUGCGGA… 6008 nt 0.3788
NM_001323328.2 NCBI
GUUACUCAGCCGAGCGGCCGAGGCCGGACGACGCGGCUUGGAUUGCGGA… 5878 nt 0.3765
NM_001323329.2 NCBI
GUUACUCAGCCGAGCGGCCGAGGCCGGACGACGCGGCUUGGAUUGCGGA… 5809 nt 0.3760
NM_001323330.2 NCBI
GUUACUCAGCCGAGCGGCCGAGGCCGGACGACGCGGCUUGGAUUGCGGA… 6003 nt 0.3785
NM_001323331.2 NCBI
GUUACUCAGCCGAGCGGCCGAGGCCGGACGACGCGGCUUGGAUUGCGGA… 6003 nt 0.3786
NM_139046.4 NCBI
GUUACUCAGCCGAGCGGCCGAGGCCGGACGACGCGGCUUGGAUUGCGGA… 6077 nt 0.3791
NM_139049.4 NCBI
GUUACUCAGCCGAGCGGCCGAGGCCGGACGACGCGGCUUGGAUUGCGGA… 6072 nt 0.3791
Showing 11 to 17 of 17 entries
Summary

The protein encoded by this gene is a member of the MAP kinase family. MAP kinases act as an integration point for multiple biochemical signals, and are involved in a wide variety of cellular processes such as proliferation, differentiation, transcription regulation and development. This kinase is activated by various cell stimuli, and targets specific transcription factors, and thus mediates immediate-early gene expression in response to cell stimuli. The activation of this kinase by tumor-necrosis factor alpha (TNF-alpha) is found to be required for TNF-alpha induced apoptosis. This kinase is also involved in UV radiation induced apoptosis, which is thought to be related to cytochrom c-mediated cell death pathway. Studies of the mouse counterpart of this gene suggested that this kinase play a key role in T cell proliferation, apoptosis and differentiation. Several alternatively spliced transcript variants encoding distinct isoforms have been reported. [provided by RefSeq, Apr 2016]

Forensic Context

A study in human umbilical vein endothelial cells (HUVECs) demonstrated that exosomal long non-coding RNAs and microRNAs exhibit a differential expression pattern under heat stroke temperature conditions, with ten significantly upregulated and ten downregulated lncRNAs identified, and these molecules may serve as noninvasive biomarkers for heat stroke [Chen et al. DOI:10.12659/MSM.909983].