Basic Information

Symbol
MAPK9
RNA class
mRNA
Alias
Mitogen-Activated Protein Kinase 9 JNK2 PRKM9 P54a SAPK Stress-Activated Protein Kinase JNK2 Stress-Activated Protein Kinase 1a C-Jun N-Terminal Kinase 2 MAP Kinase 9 EC 2.7.11.24 Jun Kinase JNK-55 SAPK1a MAPK 9 C-Jun Kinase 2 JNK2ALPHA EC 2.7.11 JNK2BETA P54aSAPK SAPK1A JNK2A JNK2B
Location (GRCh38)
5:180233143-180292099
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
Sudden death from CNS diseases Cause of death analysis
External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_002752.5
Sequence length
4799.0 nt
GC content
0.4334

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-1421.20 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -1515.68 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 1068.51
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_139068.3 NCBI
AGACCGGGCGCCGCGGCGGCGGCAGCGGCGGAGAAGGGAGCGGGACCGG… 4353 nt 0.4383
NM_139069.3 NCBI
AGACCGGGCGCCGCGGCGGCGGCAGCGGCGGAGAAGGGAGCGGGACCGG… 4353 nt 0.4390
NM_139070.3 NCBI
AGACCGGGCGCCGCGGCGGCGGCAGCGGCGGAGAAGGGAGCGGGACCGG… 4799 nt 0.4340
Showing 11 to 13 of 13 entries
Summary

The protein encoded by this gene is a member of the MAP kinase family. MAP kinases act as an integration point for multiple biochemical signals, and are involved in a wide variety of cellular processes such as proliferation, differentiation, transcription regulation and development. This kinase targets specific transcription factors, and thus mediates immediate-early gene expression in response to various cell stimuli. It is most closely related to MAPK8, both of which are involved in UV radiation induced apoptosis, thought to be related to the cytochrome c-mediated cell death pathway. This gene and MAPK8 are also known as c-Jun N-terminal kinases. This kinase blocks the ubiquitination of tumor suppressor p53, and thus it increases the stability of p53 in nonstressed cells. Studies of this gene's mouse counterpart suggest a key role in T-cell differentiation. Several alternatively spliced transcript variants encoding distinct isoforms have been reported. [provided by RefSeq, Sep 2008]

Forensic Context

A bioinformatics study in brown rats (Rattus norvegicus) identified MAPK9 as a gene enriched in the neurotrophin signaling pathway and associated with spinal cord injury self-repair [Liu et al. DOI:10.1097/BRS.0000000000001323]. Separately, a study in human vascular endothelial cells predicted MAPK9 as an apoptosis-related target gene for miRNAs upregulated in exosomes under heat stroke conditions [Chen et al. DOI:10.12659/MSM.909983].