Basic Information

Symbol
MAPKAP1
RNA class
mRNA
Alias
MAPK Associated Protein 1 SIN1 MIP1 Mitogen-Activated Protein Kinase 2-Associated Protein 1 Mitogen-Activated Protein Kinase Associated Protein 1 Stress-Activated Protein Kinase-Interacting 1 Target Of Rapamycin Complex 2 Subunit MAPKAP1 SAPK-Interacting Protein 1 TORC2 Subunit MAPKAP1 MGC2745 MSIN1 Stress-Activated Map Kinase Interacting Protein 1 Stress-Activated Map Kinase-Interacting Protein 1 MEKK2-Interacting Protein 1 Ras Inhibitor MGC2745 JC310 SIN1b SIN1g
Location (GRCh38)
9:125437393-125707266
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
Other applications
External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_001006617.3
Sequence length
3369.0 nt
GC content
0.5010

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-1129.20 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -1188.16 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 815.76
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_001006617.3 NCBI
GUCGUGUGCGGCUCGGGGUAAUAGGGCUGCUGCUCGGCCGGCCGGCGGC… 3369 nt 0.5010
NM_001006618.2 NCBI
GUCGUGUGCGGCUCGGGGUAAUAGGGCUGCUGCUCGGCCGGCCGGCGGC… 1563 nt 0.4907
NM_001006619.2 NCBI
GUCGUGUGCGGCUCGGGGUAAUAGGGCUGCUGCUCGGCCGGCCGGCGGC… 3228 nt 0.5022
NM_001006620.2 NCBI
GUCGUGUGCGGCUCGGGGUAAUAGGGCUGCUGCUCGGCCGGCCGGCGGC… 3041 nt 0.5074
NM_001006621.2 NCBI
GUCGUGUGCGGCUCGGGGUAAUAGGGCUGCUGCUCGGCCGGCCGGCGGC… 2951 nt 0.5124
NM_024117.4 NCBI
GUCGUGUGCGGCUCGGGGUAAUAGGGCUGCUGCUCGGCCGGCCGGCGGC… 3261 nt 0.4971
Summary

This gene encodes a protein that is highly similar to the yeast SIN1 protein, a stress-activated protein kinase. Alternatively spliced transcript variants encoding distinct isoforms have been described. Alternate polyadenylation sites as well as alternate 3' UTRs have been identified for transcripts of this gene. [provided by RefSeq, Jul 2008]

Forensic Context

A study in humans demonstrated that the MAPKAP1 gene was downregulated in subcutaneous adipose tissue during short-term (0-5 month) weight loss in obese participants [Bollepalli et al. DOI:10.1038/ijo.2017.245].