Basic Information

Symbol
MAPKAPK3
RNA class
mRNA
Alias
MAPK Activated Protein Kinase 3 MK-3 3pK MAPKAP3 MK3 Mitogen-Activated Protein Kinase-Activated Protein Kinase 3 MAP Kinase-Activated Protein Kinase 3 Chromosome 3p Kinase MAPKAP Kinase 3 EC 2.7.11.1 MAPKAP-K3 MAPKAPK-3 MAPK-Activated Protein Kinase 3 EC 2.7.11 MDPT3
Location (GRCh38)
3:50611487-50651017
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
Cause of death analysis
External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_001243925.2
Sequence length
2537.0 nt
GC content
0.5711

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-1025.60 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -1071.67 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 530.37
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
.((((.(((((.((((((((.(.((((((..((((((((...((((..(((.(((((.(((.((...(((((..(((((.(((.(.(((.(((((........))))).))).).)))))))))))))...)).))))))))...))).)))).....)).).)))))((((((((.....))))(((((.(......).)))))....((((((((.(((.((((.(((((.((.((((((((...........((((((..(((((((...)))))))........((((((((((.((.......(((...((((.(((..(((((....((((((((.......))))))))..)))))))).))))....))))).))))))))))...((....)).))))))...)))))))).)).))))).....((((...(((((((((((((.(((....(((......)))...((((.(..((((((((((((.....))))....))))))))..)..))))(((.((((((....(((((....(((((((.....)))))..(((((((((.....((.(((...((((...))))))).))))))))..)))..............))....)))))..))))))..))).)))))))))))).))))...))))((((.(((.(((........))).))).))))...))))))).)))))...)))..((((.....))))......)))).....)))))).).))))))))))))).)))).(((((.(((.(.((.(((((..(((((((((((...((((((((....(((((((...((((((((((.((((((.(....((.((((((.((((.((((...((((.....((((.(((((.((((.((((((...((((((.(((........)))...)))))).))).....))).))..)).))))).))))(((((...))))).))))...)))))))).((((((.....((...(((.(((....))).))))).....))))))((((..........))))......)))))).))...).))))))...........)))))...))))))))))))((((.(((((((((((((((.(((..((((((........(((((...........)))))....((..........))((((((.....))))))......((((.((((((((((((..(((((.(((((((((........))))))).))(((((((((((((((((((((.....(((((....(((........)))...)))))...)))))))((((..(((((((((((((((...))))))))..(((((..(((...........))).)))))(((((...)))))))))))).))))....)))))))))......)))))((((((..((((.......)))).)))))).))))).))))))))))))))))....(((((((.........((..(((((....).)))).))))))))).))))))..)))..))))).((((((.((((....)))))))))).((((((((((((((((..((((((.((....)).)))))))))))).....))))))))))......)))))))))).))))......))))))))))))))))))))))))))).)))..))))).((((((.(((..((((((((((((.....(((((((..((..((...(((((((.....)))))))..))..))..))))))).....))).)))))))))(((((((.(((((((((.....((.(((.(((((.....).))))..)))))((((((((((.((((((.((((..((((((.(((((.(..(((((....)))))..))))))....))))))...........(((.(((..((((((((....)))))....)))..))))))(((((((((......(((((((...)))))))(((((...)))))..(((((((.((((((((((((....(((((.....))))).....)))))..(((((((..((.....))..)))))))(((....)))..........))))))))))))))..(((((..(((.(((.(((((((..((((((.((((((..(((........)))..)))))).))))))))))).)).))).)))..))))))))))))))......)))).))).)))))))))))))...(((((((((..(((.((((((.((..((((((((((((.......))).......))).)))).))))))))).).))).)).))).))))..)).))))))))).........)))))))).))))))(((((((....))))).)).((((......))))..((((((((((.....)))))).))))........................
Thermodynamic Ensemble Prediction
.((((.(({((,((((((((.(.((((((..((((({((...((((..(((,(((((.(((.((..,(((((..(((((.(((.(.(((.(((((........))))).))).).))))))))))))).}.}),)))))))},,.))).)))).....)).}.))))){(((((((.....))))(((((.{......,.)))))....((((((((.(((.((((.(((((.((.((((((((...........((((((..(((((((...)))))))....,...(((((((((((((.,{...,{{(...{(((.(((,.(((((....((((((((.......))))))))..)))))))).))))..,,}}))),}))))))))),,.{|....}}.)))))).,.)))))))).)).))))).....((((...(((((((((((((.(((..{.(((.....,}}}...((((.(..((((((((((((.....))))....))))))))..)..))))(((.((((((,{(.(((...}}}.}||(((.....,}}}}..(((((((((({...{{,(({...{(((...))))))).))))))))}.,))....(((({.,.....,.)))))....))))))..))).)))))))))))),})))...))))((({.(((.(((.,,...},,)}.))).})))...))))))).)))))...)))..((((.....))))......}}}}.....)))))).}.)))))))))))}),}))),{{{((.({,.(,({.((({{,,(((((((((((...((((((((..{{.({.,,...((((((.....,({(({{.,,....,..((((((((((((((..((((((,.{,,{.(((((.,((((.((((((({...(({,..,,,....((((((((((((,..{{||||,(({{({...,},||.,,}},{||{{(((({,..},}},...}},)))}))}})}}}}}},}})))))....{((.(({....})).))}..........((((((.((.(((.((((.........((((.(((..(((.((((((........((((((......|((......},},},.)))))),((((((((.....,((((,{....,...({(((...........}))))....,,.,,.......,,((((((.....))))))......(((((((((({((((((((((((((..(((((((........))))))).))))))...)))))))},|,})))....))))))...,,,..,,,,..,}}..}))))}}}})))))))((((..(((((((,{((({{{,,,||||}}},..|||||,,{{{.........,.}}}.}}}},(((({...}))))))))))).))))...)))))).)))..))).)))).((((((..((((.......)))).)))))).))))))))).)))))){(((((....)))))|({{......})}}))))))).))))}.)))))...}},}},,.)))})).{{.,((((.(((({{{((((....)))))))))).))))|,))..((((((..((((((.((....)).)))))))))))).)))))))))))))))}})),)}))....)))))).)).}).)))))))))))))))))))))}))}}},}}}.,|||}|{((((((.(((..((((((((((((.,,..((((({{{,((..{(...(((((((,....}}))))}..}}..)).,)))))))..,,,))).)))))))))((((({{{(((((((,(.....((.(((.(((({.....).)))).,)))))((((((((((.((((((.((((..((((((.(((((.(..(((((....)))))..))))))....))))))..........,(((.{((..,,{(((((....}}}}}|....,}.,)))}))|(({{,,,.......{((((({...))))))}(((({...}))))..(((((((.((((((((((((....(((((.....))))).....)))))..(((((((..((.....))..)))))))(((....)))..,,....,,)))))))))))))),,(((((..(((.(((.(((((((..((((((.((((((..{((........)))..)))))).))))))))))))}).))).)))..)))))|}}}}})))}....,)))).))),})))))))))))).,.(((((((,,,.(((.((((((.((..{{((((((({{{.......))}.......))).)))).)}))))))).).))).},.))).)))),,}..)))))))}}.........)))))))).)))))|(((((((....))))).)),((((......))))..((((((((((.....)))))).)))).............}},,,,,,...

Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_001243925.2 NCBI
ACUCUCGGCCCUGGGAUUUCUGCGGCCGCCAGCUCCCGCGACCGCCUCU… 2537 nt 0.5711
NM_001243926.2 NCBI
CUUCCCGGAAGCAGCGUCUUCCUAGAACCGCGGGCUGAGCGGUGGGGCC… 3021 nt 0.5687
NM_004635.5 NCBI
ACUCUCGGCCCUGGGAUUUCUGCGGCCGCCAGCUCCCGCGACCGCCUCU… 2522 nt 0.5702
Summary

This gene encodes a member of the Ser/Thr protein kinase family. This kinase functions as a mitogen-activated protein kinase (MAP kinase)- activated protein kinase. MAP kinases are also known as extracellular signal-regulated kinases (ERKs), act as an integration point for multiple biochemical signals. This kinase was shown to be activated by growth inducers and stress stimulation of cells. In vitro studies demonstrated that ERK, p38 MAP kinase and Jun N-terminal kinase were all able to phosphorylate and activate this kinase, which suggested the role of this kinase as an integrative element of signaling in both mitogen and stress responses. This kinase was reported to interact with, phosphorylate and repress the activity of E47, which is a basic helix-loop-helix transcription factor known to be involved in the regulation of tissue-specific gene expression and cell differentiation. Alternate splicing results in multiple transcript variants that encode the same protein. [provided by RefSeq, Sep 2011]

Forensic Context

A study in humans demonstrated that the MAPKAPK3 gene was downregulated as part of the inhibited oxidative stress-induced senescence pathway in lung tissue from post-mortem samples of individuals who succumbed to septic shock [Pinheiro da Silva et al. DOI:10.1111/jcmm.17938].