Basic Information

Symbol
MAPRE3
RNA class
mRNA
Alias
Microtubule Associated Protein RP/EB Family Member 3 RP3 EB3 Microtubule-Associated Protein RP/EB Family Member 3 EB1 Protein Family Member 3 End-Binding Protein 3 EBF3 APC Binding Protein EBF3-S
Location (GRCh38)
2:26970633-27027219
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
-
External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_012326.4
Sequence length
1890.0 nt
GC content
0.5667

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-681.50 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -714.98 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 590.36
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
((.((((((((((.((((.(((((((.((......))))))))).)))).)).....))))))...(((((..((((.....)))).)))))..((((...)))).(((((((..((.((....((((((((.((((((((((.((((((((((.....((((((.((((((...(((.(((.(((((.....)))))..((((((((.......))).)))))(((((...(((((((.(((.........)))))))...................(((((....)))))...(((((....))))))))))))))))..)))...))))))..)))))).(((((((...(((..((((.((......)).))))..((.....)))))..)))))))((((((....(((((((..((((((((((((................(((((((((.(((((((...((((((.(((((((((........))))).((.((((...(.((((((((....((.....))....)))))))).)))))))..((((((..(((.(((...((..(((((..(((((........)))))....((..(((...........)))..))...((((((((((....((((.(((...........((((........((((((......(((((.(........)))))).....))))))((....)).(((((((((.((.(((......)))(((...(((...(((((((((....))).............((((....((((..((((....(((((((((((.((((((.....(((........))).....))))......)).)))))))))))....))).)..)))).....))))((((......)))).......)))))))))...)))...)))).)))))))((((((((..((((((......((((......)))).........(((........)))(((((.......)))))((((..((((.(.(((((((((((((((((((((((((...(((((((((...((((((..((..........))..))).)))..))))((((((....)))))))))))...))).))))))....)))))))))))).....)))).))))).))))))))))))).))))).))))..((.((((((((....)))).)))).))..........))).))))....))))))))))((((...........)))))))))..)).))))))...))))))(((..(((.(((.....))).))).)))....((((...))))))))...))))))..))))))).)))))..))))...)))))).))))))..))))))).)))))).)))))))))).)).)))(((((((((((....(((((((.((((((.(((.((((......)))))))...............(((....))).......)))))).)))))))))))).)))))).))))).))))))))...)).))..)))))))..((((.(((((.(((((....((.((((((((.(((.((((((((((((...(((.((((((((((((..........(((.....((((((((.(((.....))).))))....).))).....)))..........).))))))))................))).)))...)))).)))))).....))))).))))))))))...)))))))))).))))....))))(((((((.((..(((((((((...(((....)))..)))))))))....)))))))))...........
Thermodynamic Ensemble Prediction
{({{{((((((((.((((.(((((((.((......))))))))).)))).)).....))))))...(((((..((((.....)))).)))))..((((...)))).(((((((..((.((.,..((((((((.((((((((((.((((((((((....{(((({({((((((,,{(({.{{{.{((((.....)))}}..((((((((.......))).))))),{{||...,..((((.(((......,,.))}))))......,|||,,,..,,.,(((((,...|||||{||(((((....))))),.,}},)))}),,|||,{.},,,||{{}}}}}|{(((||||.,,|||..{|{|,,|}}}...,,}))))},|,..,{{{{{{,..|||||||{(((({....||{||{{..{||||,||||||,{{,.....,},..,,{{,,{||{{.,,((((.,{(((,{{{{((({{,,...,||||||||,,|||{{((((.{{(,,,,||||,,,}.||.....||,||{|,||||||....,},,,{((((({.,|{{.(((,,.((,,(({{{,,(((((........)))))....,.,,{{,.........,,}}..,||..{(({(({{{{|,.,,|{{|,|{|,||}}......||||,.......{(((((......(((({,(........)))))).....)))))}{(....)}.{||||||||,|||(((,.....})}{(,.{{{{,..,{||||||,....,|}}},.||,|{({.,,{{||,|{|.{|,,.||,|,.||||{|,|||(((((((.(({{.......)))).}})))))...,|||{||.|.||,,||}}},}}))||||,}},}}},.||,...,},{|||||,,..,,))))}.||..{||||(,,,,.}))))}..)}))},|}}}}}(((({{{{,,{(((((,,,.,.,{{|..,,,,}}}..........(((........)))(((((.......)))))((((..((((.{.((((((((({(((((((((((((((,,.(((((((({...((((((..((.......,..))..))).))).,)))}((((((....)))))))))))..,))}}))))))),..))))))}))))).....}))).})))).))))))))))))).))))),}}}}..({.((((((((....)))).)))).}}..........}}).))))....)}))))))})}||,....,,.,,..}))})))}),})).)))))).},))))))|||,,|||.|||..,,,))},))),))}....{(((...))))..||{{......)}}),}})))}}}.)))}},)))}.,}})))})))))),,))))})).}})))),)))))))))).)).)))(((((((((((,,.{(((((((.{(((({|{{(,((((,..{,,|..,}}}...............|||,,,|}))|,},....))))).)))))))))))).)))))).))))).)))))))).,.)).))..))))))).,((((.(((((.(((((...,((.((((((((.(((.(((((((({(((...{((.(((((((((({,..........(((.....|||.((((.(((.....))).))))....|,|||.....}}}......,,..},)))))))}...............,))).)))...))}).)))))),.,},)}))).)))))))))).,.)))))))))).))))....},,,(((((((,((..(((((((((...(({....}))..)))))))))..,.)))))))))......,},..

Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_001303050.2 NCBI
AUACUGCCUCCAUGCAAGCCCAGAAUAACCUGGAUGUGUGACUCACAGG… 1955 nt 0.5463
NM_001410716.1 NCBI
AGUGCCCUCGUCCCCCGCAGUCUCUGUGCGUUGAAGCCGGAGACCGCGG… 1845 nt 0.5702
NM_012326.4 NCBI
AGUGCCCUCGUCCCCCGCAGUCUCUGUGCGUUGAAGCCGGAGACCGCGG… 1890 nt 0.5667
Summary

The protein encoded by this gene is a member of the RP/EB family of genes. The protein localizes to the cytoplasmic microtubule network and binds APCL, a homolog of the adenomatous polyposis coli tumor suppressor gene. [provided by RefSeq, Jul 2008]

Forensic Context

No relevant information is available at the moment.