Basic Information

Symbol
APOL2
RNA class
mRNA
Alias
Apolipoprotein L2 Apolipoprotein L-II APOL-II Apolipoprotein L, 2 ApoL-II APOL3
Location (GRCh38)
22:36226209-36239954
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
Drug abuse diagnoses
External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_030882.4
Sequence length
2429.0 nt
GC content
0.5257

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-866.40 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -912.84 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 638.89
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_030882.4 NCBI
AUUACACAGAUGCACAGCUGGACGUGGGAUCCACACAGCUCAGAACAGU… 2429 nt 0.5257
NM_145637.3 NCBI
AUCAGACAGUAAAACAGGGGCAGAGCCUGGAAUUGCACUGAGGCUUGAG… 2686 nt 0.5298
Summary

This gene is a member of the apolipoprotein L gene family. The encoded protein is found in the cytoplasm, where it may affect the movement of lipids or allow the binding of lipids to organelles. Two transcript variants encoding the same protein have been found for this gene. [provided by RefSeq, Jul 2008]

Forensic Context

A study in humans demonstrated that the APOL2 transcript was downregulated -1.4 to -1.5-fold in the dopamine cell-enriched ventral midbrain of chronic cocaine abusers compared to controls, and its expression level was diagnostic for assigning subject cohorts [Bannon et al. DOI:10.1038/Npp.2014.70].