Basic Information

Symbol
MARCHF2
RNA class
mRNA
Alias
Membrane Associated Ring-CH-Type Finger 2 MARCH-II RNF172 E3 Ubiquitin-Protein Ligase MARCHF2 HSPC240 MARCH2 Membrane-Associated Ring Finger (C3HC4) 2, E3 Ubiquitin Protein Ligase RING-Type E3 Ubiquitin Transferase MARCHF2 Membrane-Associated RING Finger Protein 2 Membrane-Associated RING-CH Protein II Ring Finger Protein 172 Membrane-Associated Ring Finger (C3HC4) 2 RING-Type E3 Ubiquitin Transferase MARCH2 E3 Ubiquitin-Protein Ligase MARCH2 Membrane Associated Ring Finger 2 RING Finger Protein 172 EC 2.3.2.27 EC 6.3.2
Location (GRCh38)
19:8411460-8439017
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
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External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_001005415.2
Sequence length
1380.0 nt
GC content
0.6138

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-598.30 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -619.41 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 318.93
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_001005415.2 NCBI
GGACGCAGGUGCCGGCCGGAGCGGAGCUAGUGGCGCCGACGGGCCGGGC… 1380 nt 0.6138
NM_001005416.2 NCBI
GGACGCAGGUGCCGGCCGGAGCGGAGCUAGUGGCGCCGACGGGCCGGGC… 1170 nt 0.6068
NM_001369776.1 NCBI
GGACGCAGGUGCCGGCCGGAGCGGAGCUAGUGGCGCCGACGGGCCGGGC… 2025 nt 0.6119
NM_001369777.1 NCBI
GGACGCAGGUGCCGGCCGGAGCGGAGCUAGUGGCGCCGACGGGCCGGGC… 1446 nt 0.6113
NM_001369778.1 NCBI
GGACGCAGGUGCCGGCCGGAGCGGAGCUAGUGGCGCCGACGGGCCGGGC… 1649 nt 0.6010
NM_001369779.1 NCBI
GCUCAGAAGAACAUGUGAGGCCAGGAAGGCUGCUGGCUGAGCUGUUUAG… 1720 nt 0.5698
NM_016496.5 NCBI
GGACGCAGGUGCCGGCCGGAGCGGAGCUAGUGGCGCCGACGGGCCGGGC… 1651 nt 0.6008
Summary

MARCH2 is a member of the MARCH family of membrane-bound E3 ubiquitin ligases (EC 6.3.2.19). MARCH enzymes add ubiquitin (see MIM 191339) to target lysines in substrate proteins, thereby signaling their vesicular transport between membrane compartments. MARCH2 reduces surface accumulation of several glycoproteins and appears to regulate early endosome-to-trans-Golgi network (TGN) trafficking (Bartee et al., 2004 [PubMed 14722266]; Nakamura et al., 2005 [PubMed 15689499]).[supplied by OMIM, Mar 2010]

Forensic Context

A study in humans demonstrated that the MARCHF2 was downregulated in subcutaneous adipose tissue during short-term weight loss in obese participants [Bollepalli et al. DOI:10.1038/ijo.2017.245].