Basic Information

Symbol
MARCHF3
RNA class
mRNA
Alias
Membrane Associated Ring-CH-Type Finger 3 MARCH-III RNF173 E3 Ubiquitin-Protein Ligase MARCHF3 MARCH3 Membrane-Associated Ring Finger (C3HC4) 3, E3 Ubiquitin Protein Ligase RING-Type E3 Ubiquitin Transferase MARCHF3 Membrane-Associated RING-CH Protein III Ring Finger Protein 173 MGC48332 Membrane-Associated Ring Finger (C3HC4) 3 RING-Type E3 Ubiquitin Transferase MARCH3 Membrane-Associated RING Finger Protein 3 E3 Ubiquitin-Protein Ligase MARCH3 Membrane Associated Ring Finger 3 RING Finger Protein 173 EC 2.3.2.27 EC 6.3.2
Location (GRCh38)
Forensic tag(s)
-

MANE select

Transcript ID
NM_178450.5
Sequence length
3946.0 nt
GC content
0.4835

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-1283.01 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -1352.29 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 928.90
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
ACUCGUUGAGCAGGUCCGUGAAUUGUCAGCGCGCUGUGGGCGACUGUGU… 3946 nt 0.4835
Summary

This gene encodes a member of the membrane-associated RING-CH (MARCH) family. The encoded protein is an E3 ubiquitin-protein ligase that may be involved in regulation of the endosomal transport pathway. [provided by RefSeq, Mar 2013]

Forensic Context

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