Basic Information

Symbol
MARCHF6
RNA class
mRNA
Alias
Membrane Associated Ring-CH-Type Finger 6 MARCH-VI RNF176 TEB4 E3 Ubiquitin-Protein Ligase MARCHF6 MARCH6 Membrane-Associated Ring Finger (C3HC4) 6, E3 Ubiquitin Protein Ligase RING-Type E3 Ubiquitin Transferase MARCHF6 Membrane-Associated RING Finger Protein 6 Membrane-Associated RING-CH Protein VI Ring Finger Protein 176 Doa10 Homolog Membrane-Associated RING-CH Finger Protein 6 Membrane-Associated Ring Finger (C3HC4) 6 RING-Type E3 Ubiquitin Transferase MARCH6 E3 Ubiquitin-Protein Ligase MARCH6 Membrane Associated Ring Finger 6 RING Finger Protein 176 Protein TEB-4 EC 2.3.2.27 KIAA0597 FCMTE3 DOA10 FAME3
Location (GRCh38)
5:10353695-10440388
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
Postmortem interval inference
External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_005885.4
Sequence length
9641.0 nt
GC content
0.3993

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-2624.94 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -2807.21 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 2508.87
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_001270660.2 NCBI
GUUCCCGCCCCUCCCCCUCCCGUGUCGCUCGCUUUCUGUCAGCCUCUCU… 9497 nt 0.3992
NM_001270661.2 NCBI
GUUCCCGCCCCUCCCCCUCCCGUGUCGCUCGCUUUCUGUCAGCCUCUCU… 9326 nt 0.3994
NM_005885.4 NCBI
GUUCCCGCCCCUCCCCCUCCCGUGUCGCUCGCUUUCUGUCAGCCUCUCU… 9641 nt 0.3993
Summary

This gene encodes a member of a family of membrane-associated E3 ubiquitin ligases containing RING-CH-type zinc finger motifs. Ubiquitination of type II deiodinase by the encoded protein is an important regulatory step in thyroid hormone signalling. Alternatively spliced transcript variants encoding multiple isoforms have been observed for this gene. [provided by RefSeq, Jul 2012]

Forensic Context

A longitudinal mRNA expression analysis in post-mortem human blood demonstrated that the MARCHF6 shows an up-regulated expression pattern after death and is involved in protein demannosylation, with its expression data contributing to a post-mortem interval prediction model that achieved a root mean square error of 4.75 hours in cross-validation [Antiga et al. DOI:10.1038/s41598-021-96095-z].