Basic Information

Symbol
MARCKS
RNA class
mRNA
Alias
Myristoylated Alanine Rich Protein Kinase C Substrate PKCSL 80K-L MACS Myristoylated Alanine-Rich Protein Kinase C Substrate (MARCKS, 80K-L) Protein Kinase C Substrate, 80 KDa Protein, Light Chain Myristoylated Alanine-Rich C-Kinase Substrate PRKCSL Phosphomyristin 80K-L Protein
Location (GRCh38)
6:113857345-113863475
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
Forensic psychiatry evaluation
External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_002356.7
Sequence length
4296.0 nt
GC content
0.4383

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-1319.80 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -1407.04 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 1336.47
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_002356.7 NCBI
GCACUUGGGCGUUGGACCCCGCAUCUUAUUAGCAACCAGGGAGAUUUCU… 4296 nt 0.4383
Summary

The protein encoded by this gene is a substrate for protein kinase C. It is localized to the plasma membrane and is an actin filament crosslinking protein. Phosphorylation by protein kinase C or binding to calcium-calmodulin inhibits its association with actin and with the plasma membrane, leading to its presence in the cytoplasm. The protein is thought to be involved in cell motility, phagocytosis, membrane trafficking and mitogenesis. [provided by RefSeq, Jul 2008]

Forensic Context

A study in humans demonstrated that the prior association of the gene MARCKS with suicidal behavior was statistically conditioned on the expression of the lincRNA LINC01268 [Punzi et al. DOI:10.1101/257188].