Basic Information

Symbol
MARCO
RNA class
mRNA
Alias
Macrophage Receptor With Collagenous Structure SCARA2 SR-A6 Scavenger Receptor Class A, Member 2 Macrophage Receptor MARCO Scavenger Receptor Class A Member 2
Location (GRCh38)
2:118942172-118994664
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
-
External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_006770.4
Sequence length
1810.0 nt
GC content
0.5823

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-748.40 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -775.96 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 317.45
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_006770.4 NCBI
ACAACCAGCUGCAGUGGUUCGAUGGGAAGGAUCUUUCUCCAAGUGGUUC… 1810 nt 0.5823
Summary

The protein encoded by this gene is a member of the class A scavenger receptor family and is part of the innate antimicrobial immune system. The protein may bind both Gram-negative and Gram-positive bacteria via an extracellular, C-terminal, scavenger receptor cysteine-rich (SRCR) domain. In addition to short cytoplasmic and transmembrane domains, there is an extracellular spacer domain and a long, extracellular collagenous domain. The protein may form a trimeric molecule by the association of the collagenous domains of three identical polypeptide chains. [provided by RefSeq, Jul 2008]

Forensic Context

No relevant information is available at the moment.