Basic Information

Symbol
MASP1
RNA class
mRNA
Alias
MBL Associated Serine Protease 1 Mannose-Binding Lectin-Associated Serine Protease 1 MASP-3 Map44 MAP-1 CRARF PRSS5 MASP Complement-Activating Component Of Ra-Reactive Factor Mannose-Binding Protein-Associated Serine Protease C4/C2 Activating Component Of Ra-Reactive Factor Mannan Binding Lectin Serine Peptidase 1 Mannan-Binding Lectin Serine Protease 1 Ra-Reactive Factor Serine Protease P100 Complement Factor MASP-3 Serine Protease 5 CRARF1 RaRF Mannan-Binding Lectin Serine Peptidase 1 (C4/C2 Activating Component Of Ra-Reactive Factor) Mannan-Binding Lectin Serine Protease 1 (C4/C2 Activating Component Of Ra-Reactive Factor) Mannose-Associated Serine Protease 1 EC 3.4.21.104 EC 3.4.21.42 EC 3.4.21.- EC 3.4.21 MASP-1 MASP3 3MC1 MAP1
Location (GRCh38)
3:187217282-187291980
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
Other applications
External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_139125.4
Sequence length
3894.0 nt
GC content
0.5303

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-1427.10 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -1492.83 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 774.31
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
.....................(((((((((..(((((((((((((((((((......((..((((((((((.(((((((.((..(((((((.(((...((......))...))).)))))))......((((((((((((((((((((((((((..(((((((((...)))).((((((((...)))))))).....((((....))))..((((.((..((((((.(((((((((.(((....))).))..))))))).....))))))..))))))...((..........))......((((((..((((((((((((((((........)))..)))))))).....))))))))))))))))...))))...)))))))))))....)).)))))))))..)))))))))......))))))))))..))((((((((...((((.((.((((((.((.......((((.....))))((((.(((((((......)))..(((((....))))).))))))))...))..)))))))).))))))))))))).)))))).......((((((.........)))))).....(((((((((((((...))))....((((((((.((.....((((.(((((((.(.((((..((((((...((((((.(((...(((.(((((.((.....)).)))(((((....(((((((..(((((...((((.((.((.........))))))))))).)))))))))...)))))..((((((((((.((((...(((((..((((......((...(((.((...)).)))..)).....))))..)))))....))))....((((((((((.(((((......)))))))))))))))((.(((((((....((((...((((((((((.((.((((..(((....))).)))).))....((((((.((...(((((((((((((((.((....((......))...)).))))..)))))..))))))...)).)))))).........(((((((..((...))..))))))).)))))....))))).)))).....))))))).))..((((((........)))))).(((((.....))))).(((.(((((..((......))....)))))))).........)))))))))).....((((.((((.(((....(((((((((((...((((..((((......((((..((......)).))))(((....((((((..(((((((.((......))..)))).........(((((((....))))))).)))....))))))...)))...........((((.((....)).))))....))))..)))).)))))))))))))).))))))))...)))))))).)))))).))))))(((((((............)))))))))))).))))))).))))....))))))))))(((((...)))))((((((........))))))..((((((.(((((.....)))....))..)))))).(((((......)))))...(((((.(((((.......((((((((...(.(((....)))).))))))))))))))))))(((((((...))))))).......)))))))))....))))).).)))))).)))))).)))............................((((((...((((((((((((((((.(((((((((((((((.((((.(((((((((((((((..(((..(((((((((.(..((.((((((..((((((((((((((((((((....))))....(((((((((.((((((...(((.((.((.((((....)))).)).)).)))...)))..)))..))))))))).))))))))..((((.((((.((((.((((.(((.(((.....))))))..))))...)))))))).)))).((((...((((((......))))))))))((((((.((((((((.........))).))))).)).)))))).))))))...((((((...))))))..((((.((.(((((((((((((((((((((((((((((((.(((((((.....(((....)))..))))))).((((((((......))).))))).....(((((.(((.(((.(((......(((((..((((((....)))))))))))..((((...(((((((((........(((((((((........))))))).)))))).)))))))))))).))).).)).))))).............((((.....))))....(((((......)))))(((((((.....)))).))))))))))))((((...((.((((((.(((((((((((((((((.((((((((((.......)))))..)))))....))))).)))))))))....))).)))))).)).............))))......))).)))))).)))))))..)))))).))......(((((((.((((..((((.((((((...............((((................))))))))))..)))).....)))).))).))))....(((((((....)))))))((((......))))....................)))).)))))).))..).)))))))))((..((((......))))..)).)))..)))))((((((((((((((...)))))((((((........((.(((.(((...))).)))))........))))))..))))))))).((((((.(((((((((((((..((((.....(((.((((...................)))).)))....)))))))))))....)))))).))))))...)))).))))))..(((((((..((.(((...((((.(((.((...(((((.....)))))((((((.((.((..((((....)))).)).))..))))))...........((((.(((((..((((((..(((..(((((((...(((......))).)))))))(((......)))((((((((......)))(((...))).....)))))..........(((.((...)).))).)))))))))))))))))))).)))))))..))).))..)))))))......................(((((((...))))))))))).))))))...((.(((.(((...))).))).))........(((.((((((.((((............))))....(((((((((((((((..((.(((((((((.((..(((((((((...))).))))))..)).)))).))))).......((........))...(((((....)))))..))..)))))))))))))))..((((((.....))))))....))))))))))))))))))..)))))...)))).)))))))(((((((.((..((((((......((((((.(((((((((.(((...((((((((...((.(((.(((((.(((.....(((.....))).....)))..)))))))).)).))))))))......(((((((....)))))))))).))))))..((((........)))).....((((((.....(((.(((((((.................))))))).)))....)))))))))..))))))........))))))..)))))))))........((........))))))))..........
Thermodynamic Ensemble Prediction
.............{{..,{,{((...{{{{..,(((,..((((((..((((..,((.(((((((((((((...((((((((((((((....)))..(((((((...((.(((((((.,,..{,.....(((((((((((((((((((((({(((..,,,{{((((...)))).((((((({...})))))))..{{,((((.{{{((((,.{(((.((..((((((.(((((((((.(((....))).)),.})))))).....))))))..))))))...((..........))......,{{{||..{((((((((((((,,..,,,....,}}.,)))))))).....))))))))))))))))...))))...)))))))))))....)).)))))))))..((((((((((({,,({({(((((((({{{.,((({((((((((((,,,..,,,(((((({{...((((.....)))).,..},...(((......))).......}))))),)))))))))}},))}.}})))),))),|||{}}}}}.}),))))}.),)),,,.}}|||,.........})||(((((.{.((((((((((((...))))....((((((((.((.....((((.(((((((.(.((({..((((((...((((((.(((...(((.(((((.{,....,))})))(((((....(((((((,.((((,..{((((.({,{(.........}}))))))))).)))))))))...)))))..((((((((((.((((,..(((((..((((,,....{|,..(((.((...)).)))..}......))))..)))))..,.))))....((((((((({,(((((......)))))))))))))))((.(((((((....((((...((((((((((.((.((((..(((....))).)))).))....{(((({({{((((((,...,.((((,{{{,....||...})))}},,}}.}))))})),)),,.|||||....,.,,,,,)}}},.....(((((((,,{,...))..})))))).)))))....))))).)))).....))))))).))..((((((........)))))).(((((.....))))).(((.(((((..((......))....)))))))).........)))))))))).,...((((.((((.(((....(((((((((((...((((..{(((......((((..((......)).)))){{(....((((((,.(((((((.((......))..)))).........(((((((....))))))).)))....)))))).,.}}}.......,...((((.{(....)}.))))..,.))))..)))).)))))))))))))).))))))))...,})))))).)))))).))))))(((((((............)))))))})))).))))))).))))....))))))))))(((((...))))).....(((.((((((({{((((((((((((((((((((((((,.,{((,........(((((......))))),.,,)}})))))))),{{{...,||}..,,,.((((((((((.((.((((.{{((({.,,,(((({,((((((((((.(.{.....(((((((((.....{,{((((((((({{{,((((,...})))|,,{{........,,...........,,,.|,...,},))})).))))))}.,},}},.}})))))))))..,}}))))))))))..},,,((((....||||..,,))))..(((((((((.........)))))))))(((((((((({(((((((((((.........(((((.,({({({....)}}|{{|.{,(((((((((..((((.((..(({...)))...)).))))....))))}})))).|,.|||}{((.....))).(({.{(({{,,,}}}})))}..,,.})}}))))))))))...))))))}.))))))))))....)))))),...)))).)).))))))))))...}))))))))}..((((((...))))))..{{{..((.(((((((((((((((((((((((((((((((((((((((.....(((....)))..))))))).((((({((......})).))))).....(((((.(((.(((.(((,,....(((({..((((((....})))))}))))..,(((...(((((((((........(((((((((........))))))).)))))).)))))}}})))).))).).)).))))).........{|..(({{..,,.,))}....{{(((......|||||{,,{{{{,,,,,)}}}.}})))))))))){{,,...((.((((((.(((((((((((((((((.((((((((({.{....,)))))..)))))....))))).)))))))))....))).)))))).)),,{{.........,,},.}}}}.))),}))))).)))))))..)))))).)).,,,...(((((((.............))))))).....))))))))))))))).))).......,(((((....{{{{{{...}}}})}}..))))).|{,,,(({{{,|,,,,})}}}},.,.....,,{||||{.{{,...|,.........|||{{{,|({{{{(({,.{{{|,..})}||,.||||......))))}.)),))),})}|,(((((((((({((((...))))|((((((........((.(((.(((...))).)))))........))))))..)))))))))),},....(((((((((((((..((((..,,.(((.((((.....,....,}.......)))).))).,,.)))))))))))....)))))).)))))))),.))))))})))))(((((((..((.(((...(({(((((.((....,,{{.....,,}||((((((.{(.{{..((((....)))).)).))..))))))..||,....,.((((.(((({.,(((((,.,(((..(((((((...({,......,}}.)))))))||{....,.}}}((((((((......)))(((...))).....)))))..........(((.{{...}).))).))))))))))))))))))}).}))))))..))).))..))))))).....))})))))))))..))))))).)))))))))))...{{{{{((({{..((.(((.(((...))).))),)),,,}}}},|((.((((((.((((............))))....(((((((((((((((..{{.(((((((((.((..(((((((((...)))})}))))..)).)))).))))).,,....||........},...(((({....}))))..})..)))))))))))))))..((((((.....))))))....))))))))}..)),}))))))))))|||||.}|,,}})))}||||||,||}},{||||,,,{{,((({((..{||||||{,.,|,,,{{{{{{{{..,|||({{,(({{{.{({.....{{{....,)))..,},}}),,))))},||{||{||,,||||..{.{((((((((....)))))))))}.}|||||............,,{{||,....((((((.....(((.(((((((.................))))))).)))....)))))).})},})))))...{{{..,.))))}}).)))))))),,,..}}||........}},}))))....)}....

Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_001031849.3 NCBI
AGAACAAAGAUAAGGCAUCACGGACACCACACCGGGCACGAGCUCACAG… 2221 nt 0.4899
NM_001879.6 NCBI
AGAACAAAGAUAAGGCAUCACGGACACCACACCGGGCACGAGCUCACAG… 4994 nt 0.4932
NM_139125.4 NCBI
AGAACAAAGAUAAGGCAUCACGGACACCACACCGGGCACGAGCUCACAG… 3894 nt 0.5303
Summary

This gene encodes a serine protease that functions as a component of the lectin pathway of complement activation. The complement pathway plays an essential role in the innate and adaptive immune response. The encoded protein is synthesized as a zymogen and is activated when it complexes with the pathogen recognition molecules of lectin pathway, the mannose-binding lectin and the ficolins. This protein is not directly involved in complement activation but may play a role as an amplifier of complement activation by cleaving complement C2 or by activating another complement serine protease, MASP-2. The encoded protein is also able to cleave fibrinogen and factor XIII and may may be involved in coagulation. A splice variant of this gene which lacks the serine protease domain functions as an inhibitor of the complement pathway. Alternate splicing results in multiple transcript variants.[provided by RefSeq, Apr 2010]

Forensic Context

A study in humans demonstrated that the MASP1 is significantly upregulated in trauma and sepsis patients compared to controls, showing excellent diagnostic ability with an AUC > 0.7 and correlating positively with disease severity metrics like APACHE-II scores and CRP levels [Xian et al. DOI:10.3389/fmed.2024.1320811].