Basic Information

Symbol
MAST3
RNA class
mRNA
Alias
Microtubule Associated Serine/Threonine Kinase 3 KIAA0561 Microtubule-Associated Serine/Threonine-Protein Kinase 3 EC 2.7.11.1 EC 2.7.11 DEE108
Location (GRCh38)
Forensic tag(s)
-

MANE select

Transcript ID
NM_001393504.1
Sequence length
6020.0 nt
GC content
0.6078

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-2480.80 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -2574.25 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 1801.67
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
((((.((...((.((((((.(((((((((..(((..(((((..((((((((.((......))))))))))..))))).(((((.((((((.((......)).)))).)))))))(((((((...))))))).....(((((.(((((((.(((.....))).))))).....)).))))).((((.(((..(((..((((.((((.((.(((.....)))))))))..))))..)))))))))).(((......))).((((.((((....)))).)))).........)))....)))))))(((((((((((.......((........)))))))))).))).((((((((...............)))))))))).))))))..))..(((..(((((((((.((((..(((((((((.....(((((((.((((..(((((((.......(((((((.((((((.((.(((((.((((((...(((((((((((........).))).)))))))...))))))))))).((((...........)))).....(((.((.(((..((...((((.((....(((((((((.((((((...))))))........((.((.....)).))))))))))))).))))...))..))))))))(((((((...(((....))))))))))....)).))))))..))))))).))))).))..)))))))))))...((..(((..((((.(.((((((((((((.((((((((..((((.....(((((((...))))))).((((.(((.((.(((........))))).))).)))).))))...))))((((..((..((..((((((((((..(((.(..........).))).)).))))))))..))..))..)))).))))..)))))))))))).))))).)))..)))))))))))...))))..........(((.((.(((((((((((((((((((((((((((((((((((((.......)).))).((.((((.....))))))..(((((((((((((((((....((((.(((.((.((.(.((((((((...((.((((.((..(((((((.(((((.(((.(((((.....(((((((((((((((((..(((.(((((...(((..((....))((.(((((.....))))).)).........(((((...(((.((.(((....(((((((...(((((...)))))...)))...)))).......((((((..........)))))).(((.............)))((((((...((((((.(((((.((.(((...((.(((.....))).))))).)).))))).))))))...)))))).(.((((..((((((((.........))))))))..)))).)))).)).))).)))))....(..(((((((.....)))))))..)(((((((((((((((((((.((..((((((((((.(((..(((.........)))..))).))).))))))).........(((.(((.((((((..((.....((((((.....))))))....(((((((((..(((((..(((.(((((((((((..(((...)))..))).)))).))))..))).....))))).)))).)))))...))..))))))))).)))..)).)))))))))((((((....((((......)))).))))))(((....))).......))))))))))((((((((....((((..(((((.(((((((.(((.((((((((((((........))))))))((((..(((((.((((((........)))))).)))))))))((.(((((((.(((....((....))..))).))))))).)))))))))..((((((((...(((.((..((.((((((((((.((..........(((......)))..........(((((((((...(((((((((((..........)))))(.(((.(.(((((.(((((..((((.((((((....((.....((((((.(((((...)))))....(((((..((((((.(.((((((...................)))))).).)))..)))(((.(((..((..((((((((((((..(.((.(((.((.(((.....)))))..))).)).).))..((..(((((..((((((((((......))))))))))...)))))..)))))))))))).)).))).)))...))))).(((((.((........)).))))).(((((((.((....))...))).)))).))))))....)))))))))))).)))))))))).).))).)..(((((((((((.......((((((.............(((((((((((((((....)))))))))))))))))))))...((.((((......)))).))....)))).))))))).))).)))....)))).))))))))))))...))))).))..)).)))..)))))))).....((((....))))...)))))))...))))).))))...))))))))...............)))))))))))))))))))))))(((((((((((((((............))))))))).........(((.((......)).))).))))))))))).(.(((((((((.(((........(((...(((((((((.((...........)).)))))).)))))).)))))))))))).)(((((.((((....((((((((.(((((((((.((((((..(((.((.(.(((......)))))).)))..(((.(((((((((((..(((((((((...(((..(((......)))..)))...(((((...))))).))).))))))...))))....))))))).))).(((((((..............))))))).))).)).).))))))))))))((((((.....))))))...)))))..))))..))))).............))))).))))))))))))))).......(((((((...((((((((((((....)))))))....(((((((((.(.(.((.(((..((((.((((((((((((((((((((((...))))(((((..(((((....((((((...(((.....((((...(((((((.(.(((((((...)))......((((.(((((.((..((....))..)).(((((.(((.(((....(((...)))..)))..))).)))))))))).)))).))))).)))))))))))((......)).(((((((.....))))))).)))....))))))......)))))..)).))).(((((((((....((((((((.....((((((((.(((......((((......)))).((((((.((((.((((....(((.....(((((((.((((((((.((.((((((((((......((....))..((((((((((((..((((..(((((((((......).)))))).))((((((((((.(.((((.(((.((.....)).....((.(((((((((.((((...((((((..(((((((((((((.((((.((((......)))).((((..((((...(((((.....)).))))))).))))(((...(((((....))))))))..))))))))))..)).)))))..)))))).)))).....))))))))).))....))).)))).).))))))))))......(((((.....)).)))...........)))).)))))))))))).))))))).......))).)).)).))))))....)))))))....)))....((((........)))).(.((((((((((((((.((((..((.((((.....)))).))..))))......(((((((......))))))).......)))).)))))))))).)....................)))))))).))))))(((......)))..(((((((.((((.(((((......((((.(.((((.....))))).)))).....))))).)))))))))))))))))))))).((((((((((.((((((.((((((((((...((((((((..(((......)))..)).))))))..................................((((((((...)))))))).((((((((((((((..(((.((((((((((((.((((.........((......((..(((....)))..))......))......))))))))))))))).).)))....))))....)))))).....((((((((...)))))))))))).......((((..(((((((..(((.....)))))))))).))))....))).))))))).)))))).((.((((((.(((..(((....)))..))).))))))))...(((((.(((.....))).))))).....((((((((((.......)))))))..))).))))))))))))).....(((((((((..((((((.(((((...(((((((....(((.((((...(((((((....)).)))))))))..)))(((........))).......(((((((((..(((.((((((..(((((((.................)))))))..)))........))).)))....((((((((......)))).))))....(((((((......)).))))).......))))))))).........(((((((((..(((.....((((....))))))))))))...)))).)).)))))))))).)))))).......)))))))))..(((((.....((((....)))).))))).)))))..)))).))))).)))))))))))......))))))).))))..)))))).))))))).))).)))))((((((((((.(((((........)).)))))).))))))).....((.((((((((..((....))...)))))))).))((((.((....)).))))(((((....)))))))))))).)).)))).))....)))))))).))).)).))))))).....))))))))(((((((((((((......)))))))))..))))........))))))))).(((..((((((((((.(.(.(((.......))))).))))))))))..)))....(.((((((((..(((((..(((...)))..)))))..((.((((.((((((.((((....)))).)))))))))).)))))))))).)...))))))))))....((.(((.((((......(((((((..((((..............))))..)))))))..)))).).)))).))))......))))).....)))))))).))))).)).))).((((((((((...)))))))))).......(((((.((.((((......))))..(((((((....))))))).......(((((((((.(((.((((.((........)).)))))))))))))).)))).))))).(((((....)))))((((((((...(((((((..(((((((.......((((((((((((.....)))).)))).(((.(((...))))))(((((.(((....))).))))).....((((...((((.............))))...))))((((((((....)))))))).)))).......)))))))..)))..))))....))))))))..)))))))))..)))......)).)))).........
Thermodynamic Ensemble Prediction
((,(.(({{{(((..{((((.,,,{(({(({((((.(((((..((((((({,((......))))))))))..))))),|||{{.|||{||.|||.{.,,.,.|||,}|((((((((((((((((.((((.((...,(((({{(,{({((,{{{.....))).}))))....,||{|{{|},((((.(((..(((..((((.((((.((.(((.....)}}))))))..))))..)))}}))))},}((((.(((((..((((.((((....)))).))))....,,.,{{|,....,}})}(((((((((((((......,{{........}})))))))).))))|(((((((...............))))))))))}).})))............}}}})))}.((((..(((((((((.....(((((({{((((..{{(((((.......(((((((.((((((.{(,(((((.((((((,,.{((((((((((........).))).))))))),,.))))))||||}.(({{...,.,.,...|||},,{|..,,}|,|{||..{{..|((({|{{....((((({{{{{((({({,.,}}}}}}.,,.....}}.||},...}}|},})))}))))}|,||||...||.,||||||.|{{|||||,,{(((....))))))))))}..|}}.))))))..))))))).))))).))..)))))))))))...((..(((..((((.{.((((((((((((.((((((((..((((.....(((((((...))))))}.((((.(((.{{((((.......,))))).))).)))).))))...))))((((..,(,.((||((((((((((..(((,(.........,).))).))}})))))))..,)}}),},)))).))))..)))))))))))).})))).)))..)))))))))))...))))..........(({.((.((((((((((((((({({(((((((((((((,{((({......,}|.}}},|{,{{({...,,{,||{{..(((((((((((((((((....((((((((.((.((.(.((((((((...((.((((.{{..{(({{{(((((({{(({,(((((,{,{.((,((((((((((((((..(((,((({((..,{{.,((....}}({.(((((.....))))).)).,..{{,.,((,((,,,(((|((,(((...,,{|{|||||.||(((...)))||,,{||,..}))},,,,,,..({(({,.........,)))))}{{(|....,}}}.....||,((((((...((((((.(((((.((.(((...((.(((.....))).))))).)).))))).))))))...)))))),(.((((..((((((((.........))))))))..)))).)),}.}),))},))}}}....,..(({((((,....))}}))),.}|{|||||{{{|{({{{{{(,{(||{{|{|{||||.((({,(((,,..,,...}}}.,))),}}},))})))),.,|||...(((.((,,((((((..((.....((((({.....})))))....(((((((((..,((((..(((.(((((((((((..(((...)))..))).))))))}))..))).....))))).))))})))))...))..))))))))).)))..||,}}}}}}}||((((((....((((......)))).))))))||(....|||,.,,.,,)))})))))|((((((((....((((..(((((.(((((((.(((,({{{((((((((.,......))))))))((((,.(((((.((((((........)))))).))))),)))||.(((((((.(((....((....))..))).))))))).}}}|||||}..((((((((...(((.((..((.((((((((((.((....,,,...{{{..,...},,..},.,,,,.(((((((((...((({,((((({,{{,,.....,{|,,{.(((,(,{(({(,((({{..||||.(|{{{{....,|||.,.|{{{{,.,{({{,,,}}}}}....((({,..((((({.(.((((((..,,,,,...,,{|.....)))))}.|.|||,.|,,{{{.{||,|,,.,(((((((((({(..{.({.{((,{{.{{{.....)))))..))),)).}.))..((,.(((((..((((((((((......))))))))))...)))))..)))))))))))}.,).))},))).,.,}|||,{{(((,{{.,,{,,,.}}.})))).(((({{(.((,...,,,},))).)))).))))))},.,},)))))))))).))))))||||.,.})),,..{{{,,{(((......,},|(((((.......,,,...(((((((((((((((....)))))))))))))))}}})))...|{.((((......)))).)}.....,}}.,)))))))))}.})),...)))).)))))))))))}..,))))).))..)).)))..))))))))....,||{(....}))),,,))}}))).,,))))).))))...)))))))),....,)),),...,)}))}))))}}}))))))))))|{{{{{{(((((((((............)))))))))..,,{{{,.(({.((,,..,,||.||},|}|||||||||.{.(((((((((,((({...,.,.,,,.,,|{{((((((.((...........)).)))))),)))))),})}))))))))).,,{{{(,|{{({..,{(((((({.(((((((((.,{((((,,({(.((.{.(((,,.,,.}}}}}}.}}}..({{.{((((((((((..(((((((((...(((..(({..,,.,|||.,|||,..{{{{{..,|||||,|||,||||||...||||.,,,}}}||||,|}}.((({(((,,,{,,..,|....}}}}})).})).)),).)))))))}}})){{||||,,}},})))))}}})))))}})))).,)}},}..{{{........))))),))))}))))||||||{,.{.{,,((({(({.{({{(((((({{{....))))))}.,,.|||,|||{|},},,||.{{|,,|((({(,,{{{|||||{{,,(((((((...}}}}|||.,.{((((({{..,)))))))}|||..,|.{|{||..{{((((|.{.||{||(|...})}.,,,..((({,({{{(,((,.((..,.}),,||,(((((.(((.,{{....{{{...}})..}}}..))).)))))}})}|.}}}}.}}})}.)),,}))))},||.,,},..,.,((((((.....))))))|{{{|.....))))}}}||||||.,,,.,,.|||{(((((((((....{{{,,((.,.,||((((((((.(((......((((......)))).((((((.((((.((((.((,((({{...(((((((.((((((((.((.((((({((({......||..,,))..((((((((((((..((((..{{(((((((......)})))))).}){(((((((((.(.((((.(((.({.,,..||{{{,,(({({(({{((({((((,..{,((((..(((((((((((((.((((.((((,.{{.,{(((.,,,|}}|(({..,(({{{.....|)|)),}))),}))))},.|,{((((....))))))))..))))))))))..)).)))))..))))))})),),,.,.)))))},}),))}.},))).)))).).))))))))))......(((((.....)).))),,......,..)))).)))))))))))).)}}},}}.......))).)).)).))))))....))))))).{{(....}}}((((........))))..((((.((..,}).}}}}.|.}}||},|})}.....{(((((((((||......(((((((......))))))).....,,|,{({|......)))),.,,)))))))))).......)))))))).))))))(((......)))..((((((({((((.(((((......((((.(.((((.....))))).)))).....))))).)))))))))))))))))))))).||||||{{{,.||||||,{{{||||||{...((((((((..(((......)))..)),,))))}................................|}((((((((...))))))))||{{{|||}||{{|||{(,(((,{(,...||||.}.)})),..})))))),...,{({{.,,({{...,...}}}...}))}}....,,((((((((..((..((......))..))..)))))))}....{(((((({...}))))))),}))}}.....((((..(((((((..({,.....,),))))))).))))....})).})}}}}},}}}|||.,{,((((((,{((,,(((....|}}..|||,)})}))))...,(((,.,,,...,,))|,|,}}|||,..{{{(((((((.......))))))).,|||{|}}||||}}|||||.,,}||{{,{{{,..||||||,|||||...|||||||{|{{(((.((((...{{(({{{.,..}),}}},}))))..}}|{|....,}},.{{{,...,}}|({{{{(((..{{{.{{{{((..(((((((.................)))))))..))},,{.,,,,},|,|||..,..,,||,}}.}}}}..,)))),)},,..(((((({......}),}))))....,,,))}}}}}},.}}}}}|}}|||||,|{{..(((....,((({{{,.}|||}}}|||||{.{|||,{{{.||||||||||.,,,,||{{{,...,)))))))))))|{{..{{(.((((....))))..))),..})),..)))).))))),))),))))))..,,,..)))}))),}}))..)))))).}))))),.},),)))))|{{|||||{|,||{,{...,,..,}}.}})))).))}||||,.,{{({.{{((((({..|||...}},,.)))))))).))||||.|{..,,},.))))|||{{,},}))}})))))))}})}.)))).))....)))))))).))),)).))))))).....)))))))){((((((((((((......)))))))))..)))}........))))))))).(((..((((((((((.(.{.{((,......))))}.))))))))))..)))......,{((((((..(((((..(({...}))..)))))..{{.((((.((((((.((((....)))).)))))))))).)})))))))|{|,,.,}}}))))))....{{.|||.||||...,,,(({{{{|,,||{{....},,,.,}}.,))}}..}}}))}}..}))).)}))}..)})).....,))))}....})))))))).))))).)).))).((((((((((...)))))))))).......,.....}}.)))).))}}})))).}))))))),),,)))}}}|(((((..(((((((((.(((.((((.((........)).)))))))))))))).))..))))).....,)))})))))}..((((((...(((((((..(((((((...,,..((((((((((((.....)))).)))).(((...|}}.(((,((((.((.((((((({....,,|,........,.....,,.)),,))))}.)})))).)))..(((((((((....))))))))))))).,.....)))))))..)))..)))))))))).))))))))))))}),)).(((((((........)))))))...

Transcripts

ID Sequence Length GC content
GCGGACUCCCGGGCCAUGGACGAGUCGAGCCUCCUGCGGCGCCGCGGGC… 6044 nt 0.6079
GCGGACUCCCGGGCCAUGGACGAGUCGAGCCUCCUGCGGCGCCGCGGGC… 6023 nt 0.6078
GCGUCUAGUCUGCCGCACCAGCCAGGCGUCUGUCCCUGCGUCCGUGUGU… 6149 nt 0.6090
GCGGACUCCCGGGCCAUGGACGAGUCGAGCCUCCUGCGGCGCCGCGGGC… 6020 nt 0.6078
GCGUCUAGUCUGCCGCACCAGCCAGGCGUCUGUCCCUGCGUCCGUGUGU… 6119 nt 0.6084
GCCUGGGCGGAGUUCCAGUCGCGCUCGGGGGCGCGCGCUUCCUUCUCGC… 6136 nt 0.6111
GCGUCUAGUCUGCCGCACCAGCCAGGCGUCUGUCCCUGCGUCCGUGUGU… 6101 nt 0.6084
GCGGACUCCCGGGCCAUGGACGAGUCGAGCCUCCUGCGGCGCCGCGGGC… 5954 nt 0.6063
GCGGACUCCCGGGCCAUGGACGAGUCGAGCCUCCUGCGGCGCCGCGGGC… 5951 nt 0.6063
GCCUGGGCGGAGUUCCAGUCGCGCUCGGGGGCGCGCGCUUCCUUCUCGC… 6115 nt 0.6111
Showing 1 to 10 of 22 entries
Summary

Predicted to enable protein serine/threonine kinase activity. Predicted to be involved in cytoskeleton organization and intracellular signal transduction. Predicted to be located in cytoplasm. Implicated in developmental and epileptic encephalopathy 108. [provided by Alliance of Genome Resources, Jul 2025]

Forensic Context

No relevant information is available at the moment.