Basic Information

Symbol
MAST3
RNA class
mRNA
Alias
Microtubule Associated Serine/Threonine Kinase 3 KIAA0561 Microtubule-Associated Serine/Threonine-Protein Kinase 3 EC 2.7.11.1 EC 2.7.11 DEE108
Location (GRCh38)
19:18097749-18151692
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
-
External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_001393504.1
Sequence length
6020.0 nt
GC content
0.6078

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-2480.80 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -2574.25 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 1801.67
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
((((.((...((.((((((.(((((((((..(((..(((((..((((((((.((......))))))))))..))))).(((((.((((((.((......)).)))).)))))))(((((((...))))))).....(((((.(((((((.(((.....))).))))).....)).))))).((((.(((..(((..((((.((((.((.(((.....)))))))))..))))..)))))))))).(((......))).((((.((((....)))).)))).........)))....)))))))(((((((((((.......((........)))))))))).))).((((((((...............)))))))))).))))))..))..(((..(((((((((.((((..(((((((((.....(((((((.((((..(((((((.......(((((((.((((((.((.(((((.((((((...(((((((((((........).))).)))))))...))))))))))).((((...........)))).....(((.((.(((..((...((((.((....(((((((((.((((((...))))))........((.((.....)).))))))))))))).))))...))..))))))))(((((((...(((....))))))))))....)).))))))..))))))).))))).))..)))))))))))...((..(((..((((.(.((((((((((((.((((((((..((((.....(((((((...))))))).((((.(((.((.(((........))))).))).)))).))))...))))((((..((..((..((((((((((..(((.(..........).))).)).))))))))..))..))..)))).))))..)))))))))))).))))).)))..)))))))))))...))))..........(((.((.(((((((((((((((((((((((((((((((((((((.......)).))).((.((((.....))))))..(((((((((((((((((....((((.(((.((.((.(.((((((((...((.((((.((..(((((((.(((((.(((.(((((.....(((((((((((((((((..(((.(((((...(((..((....))((.(((((.....))))).)).........(((((...(((.((.(((....(((((((...(((((...)))))...)))...)))).......((((((..........)))))).(((.............)))((((((...((((((.(((((.((.(((...((.(((.....))).))))).)).))))).))))))...)))))).(.((((..((((((((.........))))))))..)))).)))).)).))).)))))....(..(((((((.....)))))))..)(((((((((((((((((((.((..((((((((((.(((..(((.........)))..))).))).))))))).........(((.(((.((((((..((.....((((((.....))))))....(((((((((..(((((..(((.(((((((((((..(((...)))..))).)))).))))..))).....))))).)))).)))))...))..))))))))).)))..)).)))))))))((((((....((((......)))).))))))(((....))).......))))))))))((((((((....((((..(((((.(((((((.(((.((((((((((((........))))))))((((..(((((.((((((........)))))).)))))))))((.(((((((.(((....((....))..))).))))))).)))))))))..((((((((...(((.((..((.((((((((((.((..........(((......)))..........(((((((((...(((((((((((..........)))))(.(((.(.(((((.(((((..((((.((((((....((.....((((((.(((((...)))))....(((((..((((((.(.((((((...................)))))).).)))..)))(((.(((..((..((((((((((((..(.((.(((.((.(((.....)))))..))).)).).))..((..(((((..((((((((((......))))))))))...)))))..)))))))))))).)).))).)))...))))).(((((.((........)).))))).(((((((.((....))...))).)))).))))))....)))))))))))).)))))))))).).))).)..(((((((((((.......((((((.............(((((((((((((((....)))))))))))))))))))))...((.((((......)))).))....)))).))))))).))).)))....)))).))))))))))))...))))).))..)).)))..)))))))).....((((....))))...)))))))...))))).))))...))))))))...............)))))))))))))))))))))))(((((((((((((((............))))))))).........(((.((......)).))).))))))))))).(.(((((((((.(((........(((...(((((((((.((...........)).)))))).)))))).)))))))))))).)(((((.((((....((((((((.(((((((((.((((((..(((.((.(.(((......)))))).)))..(((.(((((((((((..(((((((((...(((..(((......)))..)))...(((((...))))).))).))))))...))))....))))))).))).(((((((..............))))))).))).)).).))))))))))))((((((.....))))))...)))))..))))..))))).............))))).))))))))))))))).......(((((((...((((((((((((....)))))))....(((((((((.(.(.((.(((..((((.((((((((((((((((((((((...))))(((((..(((((....((((((...(((.....((((...(((((((.(.(((((((...)))......((((.(((((.((..((....))..)).(((((.(((.(((....(((...)))..)))..))).)))))))))).)))).))))).)))))))))))((......)).(((((((.....))))))).)))....))))))......)))))..)).))).(((((((((....((((((((.....((((((((.(((......((((......)))).((((((.((((.((((....(((.....(((((((.((((((((.((.((((((((((......((....))..((((((((((((..((((..(((((((((......).)))))).))((((((((((.(.((((.(((.((.....)).....((.(((((((((.((((...((((((..(((((((((((((.((((.((((......)))).((((..((((...(((((.....)).))))))).))))(((...(((((....))))))))..))))))))))..)).)))))..)))))).)))).....))))))))).))....))).)))).).))))))))))......(((((.....)).)))...........)))).)))))))))))).))))))).......))).)).)).))))))....)))))))....)))....((((........)))).(.((((((((((((((.((((..((.((((.....)))).))..))))......(((((((......))))))).......)))).)))))))))).)....................)))))))).))))))(((......)))..(((((((.((((.(((((......((((.(.((((.....))))).)))).....))))).)))))))))))))))))))))).((((((((((.((((((.((((((((((...((((((((..(((......)))..)).))))))..................................((((((((...)))))))).((((((((((((((..(((.((((((((((((.((((.........((......((..(((....)))..))......))......))))))))))))))).).)))....))))....)))))).....((((((((...)))))))))))).......((((..(((((((..(((.....)))))))))).))))....))).))))))).)))))).((.((((((.(((..(((....)))..))).))))))))...(((((.(((.....))).))))).....((((((((((.......)))))))..))).))))))))))))).....(((((((((..((((((.(((((...(((((((....(((.((((...(((((((....)).)))))))))..)))(((........))).......(((((((((..(((.((((((..(((((((.................)))))))..)))........))).)))....((((((((......)))).))))....(((((((......)).))))).......))))))))).........(((((((((..(((.....((((....))))))))))))...)))).)).)))))))))).)))))).......)))))))))..(((((.....((((....)))).))))).)))))..)))).))))).)))))))))))......))))))).))))..)))))).))))))).))).)))))((((((((((.(((((........)).)))))).))))))).....((.((((((((..((....))...)))))))).))((((.((....)).))))(((((....)))))))))))).)).)))).))....)))))))).))).)).))))))).....))))))))(((((((((((((......)))))))))..))))........))))))))).(((..((((((((((.(.(.(((.......))))).))))))))))..)))....(.((((((((..(((((..(((...)))..)))))..((.((((.((((((.((((....)))).)))))))))).)))))))))).)...))))))))))....((.(((.((((......(((((((..((((..............))))..)))))))..)))).).)))).))))......))))).....)))))))).))))).)).))).((((((((((...)))))))))).......(((((.((.((((......))))..(((((((....))))))).......(((((((((.(((.((((.((........)).)))))))))))))).)))).))))).(((((....)))))((((((((...(((((((..(((((((.......((((((((((((.....)))).)))).(((.(((...))))))(((((.(((....))).))))).....((((...((((.............))))...))))((((((((....)))))))).)))).......)))))))..)))..))))....))))))))..)))))))))..)))......)).)))).........
Thermodynamic Ensemble Prediction
((,(.(({{{(((..{((((.,,,{(({(({((((.(((((..((((((({,((......))))))))))..))))),|||{{.|||{||.|||.{.,,.,.|||,}|((((((((((((((((.((((.((...,(((({{(,{({((,{{{.....))).}))))....,||{|{{|},((((.(((..(((..((((.((((.((.(((.....)}}))))))..))))..)))}}))))},}((((.(((((..((((.((((....)))).))))....,,.,{{|,....,}})}(((((((((((((......,{{........}})))))))).))))|(((((((...............))))))))))}).})))............}}}})))}.((((..(((((((((.....(((((({{((((..{{(((((.......(((((((.((((((.{(,(((((.((((((,,.{((((((((((........).))).))))))),,.))))))||||}.(({{...,.,.,...|||},,{|..,,}|,|{||..{{..|((({|{{....((((({{{{{((({({,.,}}}}}}.,,.....}}.||},...}}|},})))}))))}|,||||...||.,||||||.|{{|||||,,{(((....))))))))))}..|}}.))))))..))))))).))))).))..)))))))))))...((..(((..((((.{.((((((((((((.((((((((..((((.....(((((((...))))))}.((((.(((.{{((((.......,))))).))).)))).))))...))))((((..,(,.((||((((((((((..(((,(.........,).))).))}})))))))..,)}}),},)))).))))..)))))))))))).})))).)))..)))))))))))...))))..........(({.((.((((((((((((((({({(((((((((((((,{((({......,}|.}}},|{,{{({...,,{,||{{..(((((((((((((((((....((((((((.((.((.(.((((((((...((.((((.{{..{(({{{(((((({{(({,(((((,{,{.((,((((((((((((((..(((,((({((..,{{.,((....}}({.(((((.....))))).)).,..{{,.,((,((,,,(((|((,(((...,,{|{|||||.||(((...)))||,,{||,..}))},,,,,,..({(({,.........,)))))}{{(|....,}}}.....||,((((((...((((((.(((((.((.(((...((.(((.....))).))))).)).))))).))))))...)))))),(.((((..((((((((.........))))))))..)))).)),}.}),))},))}}}....,..(({((((,....))}}))),.}|{|||||{{{|{({{{{{(,{(||{{|{|{||||.((({,(((,,..,,...}}}.,))),}}},))})))),.,|||...(((.((,,((((((..((.....((((({.....})))))....(((((((((..,((((..(((.(((((((((((..(((...)))..))).))))))}))..))).....))))).))))})))))...))..))))))))).)))..||,}}}}}}}||((((((....((((......)))).))))))||(....|||,.,,.,,)))})))))|((((((((....((((..(((((.(((((((.(((,({{{((((((((.,......))))))))((((,.(((((.((((((........)))))).))))),)))||.(((((((.(((....((....))..))).))))))).}}}|||||}..((((((((...(((.((..((.((((((((((.((....,,,...{{{..,...},,..},.,,,,.(((((((((...((({,((((({,{{,,.....,{|,,{.(((,(,{(({(,((({{..||||.(|{{{{....,|||.,.|{{{{,.,{({{,,,}}}}}....((({,..((((({.(.((((((..,,,,,...,,{|.....)))))}.|.|||,.|,,{{{.{||,|,,.,(((((((((({(..{.({.{((,{{.{{{.....)))))..))),)).}.))..((,.(((((..((((((((((......))))))))))...)))))..)))))))))))}.,).))},))).,.,}|||,{{(((,{{.,,{,,,.}}.})))).(((({{(.((,...,,,},))).)))).))))))},.,},)))))))))).))))))||||.,.})),,..{{{,,{(((......,},|(((((.......,,,...(((((((((((((((....)))))))))))))))}}})))...|{.((((......)))).)}.....,}}.,)))))))))}.})),...)))).)))))))))))}..,))))).))..)).)))..))))))))....,||{(....}))),,,))}}))).,,))))).))))...)))))))),....,)),),...,)}))}))))}}}))))))))))|{{{{{{(((((((((............)))))))))..,,{{{,.(({.((,,..,,||.||},|}|||||||||.{.(((((((((,((({...,.,.,,,.,,|{{((((((.((...........)).)))))),)))))),})}))))))))).,,{{{(,|{{({..,{(((((({.(((((((((.,{((((,,({(.((.{.(((,,.,,.}}}}}}.}}}..({{.{((((((((((..(((((((((...(((..(({..,,.,|||.,|||,..{{{{{..,|||||,|||,||||||...||||.,,,}}}||||,|}}.((({(((,,,{,,..,|....}}}}})).})).)),).)))))))}}})){{||||,,}},})))))}}})))))}})))).,)}},}..{{{........))))),))))}))))||||||{,.{.{,,((({(({.{({{(((((({{{....))))))}.,,.|||,|||{|},},,||.{{|,,|((({(,,{{{|||||{{,,(((((((...}}}}|||.,.{((((({{..,)))))))}|||..,|.{|{||..{{((((|.{.||{||(|...})}.,,,..((({,({{{(,((,.((..,.}),,||,(((((.(((.,{{....{{{...}})..}}}..))).)))))}})}|.}}}}.}}})}.)),,}))))},||.,,},..,.,((((((.....))))))|{{{|.....))))}}}||||||.,,,.,,.|||{(((((((((....{{{,,((.,.,||((((((((.(((......((((......)))).((((((.((((.((((.((,((({{...(((((((.((((((((.((.((((({((({......||..,,))..((((((((((((..((((..{{(((((((......)})))))).}){(((((((((.(.((((.(((.({.,,..||{{{,,(({({(({{((({((((,..{,((((..(((((((((((((.((((.((((,.{{.,{(((.,,,|}}|(({..,(({{{.....|)|)),}))),}))))},.|,{((((....))))))))..))))))))))..)).)))))..))))))})),),,.,.)))))},}),))}.},))).)))).).))))))))))......(((((.....)).))),,......,..)))).)))))))))))).)}}},}}.......))).)).)).))))))....))))))).{{(....}}}((((........))))..((((.((..,}).}}}}.|.}}||},|})}.....{(((((((((||......(((((((......))))))).....,,|,{({|......)))),.,,)))))))))).......)))))))).))))))(((......)))..((((((({((((.(((((......((((.(.((((.....))))).)))).....))))).)))))))))))))))))))))).||||||{{{,.||||||,{{{||||||{...((((((((..(((......)))..)),,))))}................................|}((((((((...))))))))||{{{|||}||{{|||{(,(((,{(,...||||.}.)})),..})))))),...,{({{.,,({{...,...}}}...}))}}....,,((((((((..((..((......))..))..)))))))}....{(((((({...}))))))),}))}}.....((((..(((((((..({,.....,),))))))).))))....})).})}}}}},}}}|||.,{,((((((,{((,,(((....|}}..|||,)})}))))...,(((,.,,,...,,))|,|,}}|||,..{{{(((((((.......))))))).,|||{|}}||||}}|||||.,,}||{{,{{{,..||||||,|||||...|||||||{|{{(((.((((...{{(({{{.,..}),}}},}))))..}}|{|....,}},.{{{,...,}}|({{{{(((..{{{.{{{{((..(((((((.................)))))))..))},,{.,,,,},|,|||..,..,,||,}}.}}}}..,)))),)},,..(((((({......}),}))))....,,,))}}}}}},.}}}}}|}}|||||,|{{..(((....,((({{{,.}|||}}}|||||{.{|||,{{{.||||||||||.,,,,||{{{,...,)))))))))))|{{..{{(.((((....))))..))),..})),..)))).))))),))),))))))..,,,..)))}))),}}))..)))))).}))))),.},),)))))|{{|||||{|,||{,{...,,..,}}.}})))).))}||||,.,{{({.{{((((({..|||...}},,.)))))))).))||||.|{..,,},.))))|||{{,},}))}})))))))}})}.)))).))....)))))))).))),)).))))))).....)))))))){((((((((((((......)))))))))..)))}........))))))))).(((..((((((((((.(.{.{((,......))))}.))))))))))..)))......,{((((((..(((((..(({...}))..)))))..{{.((((.((((((.((((....)))).)))))))))).)})))))))|{|,,.,}}}))))))....{{.|||.||||...,,,(({{{{|,,||{{....},,,.,}}.,))}}..}}}))}}..}))).)}))}..)})).....,))))}....})))))))).))))).)).))).((((((((((...)))))))))).......,.....}}.)))).))}}})))).}))))))),),,)))}}}|(((((..(((((((((.(((.((((.((........)).)))))))))))))).))..))))).....,)))})))))}..((((((...(((((((..(((((((...,,..((((((((((((.....)))).)))).(((...|}}.(((,((((.((.((((((({....,,|,........,.....,,.)),,))))}.)})))).)))..(((((((((....))))))))))))).,.....)))))))..)))..)))))))))).))))))))))))}),)).(((((((........)))))))...

Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_001393521.1 NCBI
GCGUCUAGUCUGCCGCACCAGCCAGGCGUCUGUCCCUGCGUCCGUGUGU… 6008 nt 0.6069
NM_015016.2 NCBI
GCGGACUCCCGGGCCAUGGACGAGUCGAGCCUCCUGCGGCGCCGCGGGC… 5906 nt 0.6057
Showing 21 to 22 of 22 entries
Summary

Predicted to enable protein serine/threonine kinase activity. Predicted to be involved in cytoskeleton organization and intracellular signal transduction. Predicted to be located in cytoplasm. Implicated in developmental and epileptic encephalopathy 108. [provided by Alliance of Genome Resources, Jul 2025]

Forensic Context

No relevant information is available at the moment.