Basic Information

Symbol
MAST4
RNA class
mRNA
Alias
Microtubule Associated Serine/Threonine Kinase Family Member 4 KIAA0303 Microtubule-Associated Serine/Threonine-Protein Kinase 4 EC 2.7.11.1 EC 2.7.11
Location (GRCh38)
5:66596380-67169593
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
Sudden death from CNS diseases Cause of death analysis
External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_001164664.2
Sequence length
10677.0 nt
GC content
0.5202

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-3713.70 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -3905.87 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 3632.49
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_001164664.2 NCBI
ACAGUGGAGCGCAGAUCGCGGACCCGAGCGGGCAUGUCCCCGCGCGCGG… 10677 nt 0.5202
NM_001290226.2 NCBI
AUCUCUUGAUUACGGCUAGAGGUGGAAGGACCCAAACUUGCAGCCUCCC… 9971 nt 0.5035
NM_001290227.2 NCBI
AGACAGCGCUUUGAGCAGAACGCACGGCUCAACUCAUUCAUAUGGCCUU… 9710 nt 0.5028
NM_001290228.2 NCBI
ACAGUGGAGCGCAGAUCGCGGACCCGAGCGGGCAUGUCCCCGCGCGCGG… 1017 nt 0.6785
NM_001297651.2 NCBI
AGACAGCGCUUUGAGCAGAACGCACGGCUCAACUCAUGUAAUUACUGUU… 10171 nt 0.5007
NM_001393524.1 NCBI
ACAGUGGAGCGCAGAUCGCGGACCCGAGCGGGCAUGUCCCCGCGCGCGG… 10686 nt 0.5200
NM_001393525.1 NCBI
ACAGUGGAGCGCAGAUCGCGGACCCGAGCGGGCAUGUCCCCGCGCGCGG… 10476 nt 0.5210
NM_001393526.1 NCBI
AGCGUGCUGAAGUAGAGGUAGUACAGCAUGGCUAGACUGUUGUGAGAGG… 9717 nt 0.5034
NM_001393527.1 NCBI
AGACAGCGCUUUGAGCAGAACGCACGGCUCAACUCAUGUAAUUACUGUU… 9970 nt 0.5012
NM_001393528.1 NCBI
AGCGUGCUGAAGUAGAGGUAGUACAGCAUGGCUAGACUGUUGUGAGAGG… 9681 nt 0.5037
Showing 1 to 10 of 12 entries
Summary

This gene encodes a member of the microtubule-associated serine/threonine protein kinases. The proteins in this family contain a domain that gives the kinase the ability to determine its own scaffold to control the effects of their kinase activities. Alternative splicing results in multiple transcript variants encoding different isoforms. [provided by RefSeq, Mar 2014]

Forensic Context

A study in human cerebral cortex tissue demonstrated that ATAC-seq robustly identified trauma-induced chromatin accessibility changes, with the gene MAST4 showing marked alterations in accessibility in traumatic brain injury (TBI) cases compared to controls, and these differential accessibility profiles remained stable even after 24 hours of postmortem degradation [Xu et al. DOI:10.1016/J.Forsciint.2025.112789].