Basic Information
Symbol
MATCAP1
RNA class
mRNA
Alias
Microtubule Associated Tyrosine Carboxypeptidase 1
KIAA0895L
TMCP1
Microtubule-Associated Tyrosine Carboxypeptidase 1
Microtubule-Associated Tyrosine Carboxypeptidase
Tubulin Metallocarboxypeptidase 1
KIAA0895 Like
LOC653319
EC 3.4.17.17
MATCAP
Location (GRCh38)
16:67175599-67184228
Forensic tag(s)
-
MANE select
Transcript ID
NM_001040715.2
Sequence length
3386.0 nt
GC content
0.5921
Secondary Structure
Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-1368.80 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy:
-1428.32 kcal/mol
Frequency:
0.0000
Diversity:
793.34
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
....(((((((((..((((....))))))))((((..((((((..(((((((.(((((((..((((((.((.((((((((.((((......((.(((((..((.........))..)))))))..(((.((((((.(((((((...)))).))))))))).)))...((((....)))).)))).))).)))((((((((..(((((...(((..((((((((((((((((...(..(((((...(((((((..(((((..(((((((....((((..(((....(((....((((...((((...((((((((((.((((.((((........((((((.............((((((.....((((((((((.....)))))...(((((((.....((((.(((((((....))))))).))))....)))))))........((((...((((.((((.((((((.(((...(((((......))))).))).))))))....(((((...(((......))).))))))))))))))))).)))))...)))))).(((((((((......)).)))))))(((((.((((.........))))...)))))...(((((((.....(((....))))))))))(((((..(((.(((((((...........)))).))).)))..)))))..)))))).......)))).))))..)))))..)))))..))))))))...))))))))))(((((((.(((....((((((.(((((........(((........))))))))...))))))...)))..))))))).(((...(((((((.((((..(..((((((..((((.(((...)))..))))...))))))..)..(((((.((((((((((((((((.(..((((((.(((((.(((((((.......((((..(((((((((((((((...)))))....((.((((((((((((......))))..........(((((((((.(((((((((...(((((.((.((((((((((((.((....))....)))))))))))).......((((((((...(((((......................))))))))))))).........(((........)))((((((((((((....)))).))))))))((((.(.((((.......))))...).))))...........(((........))).)).)))))...)))))))).).)))).))))).....)))))))).))...((((.......)))).)))).....))))))..))))))))))).))....(((((.......)))))...))).))))))).))))))))..)))))).....)).)))))....))))..((.((((........)))).)).)))))))..)))))))))).)))))))))))))))))..)..(((((......))))).))))).)))))))..(..((((((...(((((((.....((.....))....)))))))...))))))..).(((((....))))).........(((.(.....).)))(((((.....)))))(((..(((((......)))))..))).(((((((((....)))))))))))))..)))...)))))..))...)))))).......((((.((((((.....))))))))))...)).)).)))))).))))))).)))))))..))))))))))(((((((((((((.((((.(((..((((((...)))))).)))))).).)))))....))))))))(((((((.(((..(((((.....)))))..)))...(((((((.((..((((......(((((((((.(((((....)))))..(((...(((((((...)))).))).)))..............)).))))))).....)))))).)))))))(..(((((((...(((((.(((((......(((((((((.(........).))))))))).....)))))((((((.((((((.(((((....)))))))).((((..((((.......)))).))))(((.((((.(((((((((.((((...(((((..((((.....))))..)))))((.((((((((((....).)))))...)))).)).((((..((((((((.....(((((....)))))..(((((((....(((((((((.(.((((((((((((.........((((((((((.(((((((..((((.((((((((((((((((((((((((...)))))(((.(((....))).))).(((..........))).((((((((((((((((((((...))))))....))).))))))))))).))).)))).))).....))))((((((((((.(((((((........(((.(((.((.(((..(((((.(((((((....((((((((.....(((..((((((((.((.(((..((((......(((((....))))).........))))))).)).))))))))..)))..........))))))))...))))))).))))).(((((((((..((((((..(((((.....))))).)))))).((((((.((((((..(((((((.((.((((((..(((...)))..))))))(.((((.....))))).((((((....)))))).......))))))))).)))))).)))))))))))).))).))).)).))))))......)))))))..)))))))))).......................................................))))).))))..))))...((((..(.(((((........)).))).)..))))..)))..))))).)))))...(((....))))))))))))))).)..)))))))))((((((((((..(((.............)))..)))))))))).....))))))).(((((.(((((((.....))).))))...))))).(((((((((...(((......)))..))))).))))))))))))..))))...........)))).).))))..))))))))...)))..((((((.......(((.((((.............)))).)))....((((((((.....)))))).))((((((......)))))).))).)))....)))))))))..)))))...)))))))..).)))))))(((.............))).............))))).....
Thermodynamic Ensemble Prediction
....(((((((((,.{{{{...,))))||||((((..{(((((..(((((((.(((((((..((((((.((.((,.{{,,,({((({,,..((((((((...((...,.((.{({.,,,..,,...(((((((((((((((((...)))).))))............((((....)))),{......,,)))))))))...{{{......)))..}))},....})....))))))))......,||||({.(((((.({(((((((({...,,,(((((,(({..,((({((((({((({(((((((((((..,,,}|||{,..(((((.((((((({,....(((.,,...((((((.,...((((((((((.....)))))...(((((({.....((((.(((((((....))))))).))))....}))))))........((((...((({{(((({((((((.{(({..{((((......))))}.))).))))))....{{(((...(((......))).)))}))))))))))))).))))),,.)))))).,))}....,)))))..))).))))){{(((.((((,{.....,.))))...))))),..{((((((,....{((....)))))))))){((((..(((.(({((((...........)))).})).)))..))))).))))))).,}),)).)))))))))))).(((.(((((((((.((({.((((((((.,{(.,,((((({,,.{{{.((((((.{((((........(((........|||}}||}.,,||}}}}...,,,{,|||||||.{{|,,..{{{{((,{((({.{..((((((..((((.(((...)))..))))...)))))).,|,.,|{{{{{{{(({{.((((((((({,.{{(((((...((((((((((.(((((((((((.(((((...{{(((({...})))).}}.)))))...)))))))).{{{.(((.({....(((((((((((((.(((((((((,..(((((..{.((((((((((((.((....}}....)))))))))))).....,.((((((((...(((((...............,......))))))))))))).........(({.,......)))((((((((((((....)))),,)))))))((((.{.((((.......))))...}.))))...........({{........}}).),.))))).},)))))))).).)))).))).....)))))))))))((((.((((.......))))..)))|((,{((((.{.((((((.((((({((............,)}}.))))))))))),).)))))))})),))).))))))),.{{{..((((....)))),..}|}{{{(,.......)))}..))).)))))))))))))).|||||}|||}},|{{{{(((.((.((.(((((((((..((....,,.},.))).),})))).))))))).}||||,..}.,|},}.}}))}}}},}}}}},,,)))),}),)))){(((....)))))}}...}}}}}}..}}.)))).)))}(((.....)))))))))))))).)))))..{{.{{.{{((((((((((((....)))))))))))),,,))}}.,)))))))))).))))).||,|||,,{{{|.||{{{,.....,))))))))),}))).)).)))))).))))))).)))))))..))))))))))(((((((((((((.((((.(((.{((((((...)))))).)))))).).))))),...})))))))(((((((.(((.,(((((.....)))))}})))...(((((((.{{{{(({({,.,..(((((((((.(((((....)))))..(((...(((((({...}))).))).))).,...........,)).)))))))....,))}))),))))))){..(((((((...(((((.((((({,....(((((((((,(.......,).))))))))).....}}|||((((((,,,,(((.(((((....)))))))).,,,,..(((({{{{,..||||{||||,,({(((({.((((,{{,.{|,|}}}(((((..((((.....))))..))))){(.((((((((({....}.)))))...)))).)}.{(((..{,,{{{||,,}}}}|||,}}}})},)))}(((((((....(((((((((.(.(((((((((((((..,{..,.((((((((((.{(((.,,..((((.(((((((({((((((((((,{,{({{.||}||{{(.(((....))).)))}{{{...,,.,}.,})),((((((((((((((((((((...)))))),...})).))))))))))).))).)))).))).....)))|((((((((((.(((((((........(({{(((.((.(({..(((((.(((((((....((((((((.....(((..((((((((.(({((,.,((,{......(((((....)))))........,)),,))).)).))))))))..)))..........))))))))...))))))).))))).(((((((((..((((((..(((((.....))))).)))))).((((((.{(((((..(((((((.(({((((((..(({...|}}..))))))}.{{{(.....))))}{((((((....)))))),......}}))))))).)))))}.)))))))))))).)))}})).)).)))))}....,.)))))))..)))))))))),.......................................................,,,,.,.,,..}},....((((..(.(((((........)},))).)..)))).))))..)))))))}))).,.}|,....},))))))))))))).)..)))))))))((((((((((..(((...,.....}...)))..)))))))))).....))))))){(((,{.{{||||,....})))})))),,,)))))}(((((((((...(((......)))..))))).))))||||}},,,|}}|,....,,|,||.,}}}.)}}))},,,},,)}}}...,,,..||||,|,,,{{{{{,{.((((.............)))).}))}}},{{((((({.....}))))).},{(((((......)))))).,,},}}}....)}))}}},}.,}))))...)))))))..}.))))))){{{..{.......,..)))........,,,,.))))).....
Transcripts
| ID | Sequence | Length | GC content |
|---|---|---|---|
| GUACGUCAUCGGCGACGGCUCCCGCCGGCUGGGCGUCCGGUGGCCGGUG… | 3386 nt | 0.5921 | |
| GUACGUCAUCGGCGACGGCUCCCGCCGGCUGGGCGUCCGGUGGCCGGUG… | 3478 nt | 0.5877 | |
| GUACGUCAUCGGCGACGGCUCCCGCCGGCUGGGCGUCCGGUGGCCGGUG… | 3494 nt | 0.5876 | |
| GUACGUCAUCGGCGACGGCUCCCGCCGGCUGGGCGUCCGGUGGCCGGUG… | 3526 nt | 0.5882 | |
| GUACGUCAUCGGCGACGGCUCCCGCCGGCUGGGCGUCCGGUGGCCGGUG… | 3384 nt | 0.5922 | |
| GUACGUCAUCGGCGACGGCUCCCGCCGGCUGGGCGUCCGGUGGCCGGUG… | 3110 nt | 0.5846 | |
| GUACGUCAUCGGCGACGGCUCCCGCCGGCUGGGCGUCCGGUGGCCGGUG… | 2970 nt | 0.5889 | |
| GUACGUCAUCGGCGACGGCUCCCGCCGGCUGGGCGUCCGGUGGCCGGUG… | 3516 nt | 0.5887 |
Summary
Enables tubulin-tyrosine carboxypeptidase. Predicted to be involved in brain development. Is active in microtubule. [provided by Alliance of Genome Resources, Jul 2025]
Forensic Context
No relevant information is available at the moment.