Basic Information

Symbol
MATN3
RNA class
mRNA
Alias
Matrilin 3 EDM5 HOA Matrilin-3 SEMDBCD DIPOA OADIP OS2
Location (GRCh38)
2:19992052-20012669
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
-
External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_002381.5
Sequence length
2557.0 nt
GC content
0.4423

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-760.80 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -809.06 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 839.67
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_002381.5 NCBI
GCCCCCGACGGACACCACCAGGCCCACGGAGCCCACCAUGCCGCGCCCG… 2557 nt 0.4423
Summary

This gene encodes a member of von Willebrand factor A domain containing protein family. This family of proteins is thought to be involved in the formation of filamentous networks in the extracellular matrices of various tissues. This protein contains two von Willebrand factor A domains; it is present in the cartilage extracellular matrix and has a role in the development and homeostasis of cartilage and bone. Mutations in this gene result in multiple epiphyseal dysplasia. [provided by RefSeq, Jul 2008]

Forensic Context

No relevant information is available at the moment.