Basic Information

Symbol
MAVS
RNA class
mRNA
Alias
Mitochondrial Antiviral Signaling Protein Cardif IPS-1 VISA KIAA1271 Interferon Beta Promoter Stimulator Protein 1 Putative NF-Kappa-B-Activating Protein 031N Mitochondrial Antiviral-Signaling Protein CARD Adapter Inducing Interferon Beta Virus-Induced Signaling Adaptor Virus-Induced-Signaling Adapter CARD Adaptor Inducing IFN-Beta IFN-B Promoter Stimulator 1 IPS1
Location (GRCh38)
20:3842694-3876123
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
Other applications
External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_020746.5
Sequence length
11731.0 nt
GC content
0.5207

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-4947.88 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -5138.92 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 2463.46
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_001206491.2 NCBI
CUCCUCGCUGCGGGAAGGGUCCUGGGCCCCGGGCGGCGGUCGCCAGGUC… 11556 nt 0.5192
NM_001385663.1 NCBI
CUCCUCGCUGCGGGAAGGGUCCUGGGCCCCGGGCGGCGGUCGCCAGGUC… 11855 nt 0.5211
NM_020746.5 NCBI
CUCCUCGCUGCGGGAAGGGUCCUGGGCCCCGGGCGGCGGUCGCCAGGUC… 11731 nt 0.5207
Summary

This gene encodes an intermediary protein necessary in the virus-triggered beta interferon signaling pathways. It is required for activation of transcription factors which regulate expression of beta interferon and contributes to antiviral innate immunity. [provided by RefSeq, Jul 2020]

Forensic Context

A study in mice demonstrated that deficiency in MAVS (mitochondrial antiviral signaling protein) did not alter the induction of TNF-α and IL-6 in skin after UVB exposure, indicating little involvement of this cytoplasmic RNA sensor pathway in the immediate inflammatory response to UV radiation [Bernard et al. DOI:10.1038/nm.2861].