Basic Information

Symbol
MB
RNA class
mRNA
Alias
Myoglobin PVALB Nitrite Reductase MB Pseudoperoxidase MB EC 1.11.1.- EC 1.7.-.- MYOSB
Location (GRCh38)
22:35606764-35637951
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
Tissue/body fluid identification
External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_005368.3
Sequence length
1070.0 nt
GC content
0.5514

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-406.40 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -424.69 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 246.16
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_001362846.2 NCBI
GGCCGCUUGGCUGGAGGCUCUGCGAGGACAGCUGGGGAGAAGGGGAGCU… 1058 nt 0.5595
NM_001382809.1 NCBI
GAGCAUGUUGGCCUGGUCCUUUGCUAGGUACUGUAGAGCAGGUGAGAGA… 1286 nt 0.5529
NM_001382810.1 NCBI
GGCCGCUUGGCUGGAGGCUCUGCGAGGACAGCUGGGGAGAAGGGGAGCU… 1174 nt 0.5630
NM_001382811.1 NCBI
AGAAGGAGGAGGAAGAGAGUAGUGAAGAUCGUGGGGAGUCCUGGCUUUG… 1243 nt 0.5438
NM_001382812.1 NCBI
GGCCGCUUGGCUGGAGGCUCUGCGAGGACAGCUGGGGAGAAGGGGAGCU… 955 nt 0.5518
NM_001382813.1 NCBI
GAGCAUGUUGGCCUGGUCCUUUGCUAGGUACUGUAGAGCAGGUGAGAGA… 1067 nt 0.5408
NM_005368.3 NCBI
AAACCCCAGCUGUUGGGGCCAGGACACCCAGUGAGCCCAUACUUGCUCU… 1070 nt 0.5514
NM_203377.1 NCBI
GAGCAUGUUGGCCUGGUCCUUUGCUAGGUACUGUAGAGCAGGUGAGAGA… 1170 nt 0.5487
NM_203378.1 NCBI
AAUGGCACCUGCCCUAAAAUAGCUUCCCAUGUGAGGGCUAGAGAAAGGA… 1153 nt 0.5490
Summary

This gene encodes a member of the globin superfamily and is predominantly expressed in skeletal and cardiac muscles. The encoded protein forms a monomeric globular haemoprotein that is primarily responsible for the storage and facilitated transfer of oxygen from the cell membrane to the mitochondria. This protein also plays a role in regulating physiological levels of nitric oxide. Multiple transcript variants encoding distinct isoforms exist for this gene. [provided by RefSeq, May 2020]

Forensic Context

A study in human brain tissue demonstrated that the MB mRNA, selected for investigation due to its distinct upregulation in the cerebellar region, could not be reliably and repeatedly detected in any of the four forensically relevant cerebral cortex lobes (frontal, temporal, parietal, occipital) via multiplex-RT-PCR and capillary electrophoresis [Euteneuer et al. DOI:10.1007/s12024-024-00787-7].